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从“沧海一粟”到“菌中黄金”的距离,可能就是一台RAcolony高通量菌落智能筛选系统!

来源:长春长光辰英生物科学仪器有限公司      分类:应用方案 2025-03-26 16:15:12 9阅读次数
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在浩瀚的微生物群落中,低丰度菌株如同“沧海一粟”——数量稀少却价值非凡,他们很可能是疾病治疗、生态修复或工业发酵的“黄金钥匙”。然而,传统筛选方法却让科研人员举步维艰:

· 大海捞针:人工挑取重复率高,耗时数月仍可能错失目标;

· 成本黑洞:无差别挑取下,大量检测资源浪费在重复菌株上;

· 随机之痛:稀有菌株捕获率低,科研突破遥遥无期!


如何从“菌海”中打捞出
真正的“黄金菌株”?




01

破局之道:RAcolony

——高效去重复,从“沧海之粟”中挑选“菌中黄金



RAcolony高通量菌落智能筛选系统,结合图像识别+拉曼光谱检测,打造“识别/检测-去重-筛选”全链路解决方案,有效识别并排除优势菌株,进而提高低丰度菌筛选效率。


1

微观成像:

AI透视菌落“身份证”


· 20+项形态特征分析:尺寸、形态、纹理等,细节无处遁形;

· 智能聚类去重:使用特征相似性降维聚类算法,基于比较菌落图像间的相似性进行图像“去重”筛选;

· 数据见证:仅挑取总菌落数的10%(40个),即可覆盖85%物种,丰度为0.5%的稀有物种捕获率超80%(图1)!

图1 图像去重菌落挑取数量与物种覆盖度和低丰度物种捕获率。

A)低丰度物种存在群体中,菌落挑取数量与物种覆盖度的关系图 B)不同低丰度阈值菌株的捕获效率



2

拉曼光谱:

解码菌落“分子指纹”


· 原位无创检测:免标记、原位获取菌落 “分子指纹”,为菌落形态相似的不同物种提供另一维度的去重依据;

· 精准去重升级:使用降维聚类算法,基于菌落光谱间“分子指纹”的相似性进行拉曼精细“去重”筛选;

· 数据见证:仅挑取总菌落数的10%(40个),物种覆盖度达95%,丰度为0.5%的稀有物种100%捕获(图2)!

图2 拉曼去重菌落挑取数量与物种覆盖度和低丰度物种捕获率。

A)存在低丰度物种群体中,菌落挑取数量与物种覆盖度的关系图 B)不同低丰度阈值菌株的捕获效率



 02

告别低效,

让“菌中黄金”触手可及



RAcolony不仅是设备,更是微生物研究的“黄金探测器”:

· 从“人力苦熬”到“智能筛选”:全自动化操作,解放科研生产力;

· 从“盲目试错”到“精准定位”:微观图像+拉曼光谱,锁定目标菌株;

· 从“高成本”到“高回报”:缩短研发周期,降低经费压力,加速成果转化!

立即行动,开启“菌中黄金”

挖掘新时代!



#微生物筛选 #拉曼光谱 #菌落去重


END


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最近更新:2024-09-05 09:08:45
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