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叶绿素荧光仪和光合仪高分应用文章集锦(2024年10月)

来源:上海泽泉科技股份有限公司      分类:应用方案 2024-11-30 20:15:07 186阅读次数
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本文我们将回顾一下2024年10月份德国WALZ调制叶绿素荧光仪参与发表的12篇高分文章,其中Nature Communications ( IF.14.7) 1篇,Plant Biotechnology Journal 1篇, The Plant Cell 1篇,PNAS 1篇,The EMBO Journal 1篇,Plant Communications 1篇, New Phytologist 1篇, Plant Physiology 1篇, The Plant Journal 4篇。研究对象包含茶树、烟草、绿藻(莱茵衣藻),拟南芥,菠菜(叶绿体),蓝藻(集胞藻),番茄,玉米,高粱,硅藻(三角褐指藻)等光合生物。德国WALZ制造的PAM调制叶绿素荧光仪及光合仪设计严谨,运行稳定,功能完善,操作简单,应用广泛,国际学术界认可度高,在国际植物学研究领域遥遥领先~
1. Evolution and functional divergence of glycosyltransferase genes shaped the quality and cold tolerance of tea plants (The Plant Cell, IF=10.0)

茶树是我国重要的经济作物。干旱、低温等非生物胁迫严重影响茶叶的品质与产量。研究发现,茶树基因组在大约3000万年前发生过一次近期的全基因组加倍事件,导致诸如糖基转移酶(UGTs)等与茶叶品质和抗逆性相关的基因家族在茶树中发生快速扩增,然而目前尚未有关于茶树UGTs基因加倍后功能分化影响茶叶品质和抗逆性的报道。2024年10月4日,安徽农业大学茶树生物学与资源利用国家重点实验室宋传奎与夏恩华教授等团队合作在The Plant Cell在线发表了题为“Evolution and functional divergence of glycosyltransferase genes shaped the quality and cold tolerance of tea plants”的研究论文,揭示了茶树UGT基因通过功能分化协同调控茶树香气品质与抗寒的新机制,为其他园艺作物品质与抗性的协同演化与调控提供新思路。据悉,该论文也是全球茶学领域发表的首篇The Plant Cell论文。

为此,该研究以28个代表性植物的基因组为切入点,在系统鉴定UGT的基础上,首先探索了茶树UGTs的扩增模式。研究发现,UGTs在茶树谱系中发生特异性地扩张和收缩。茶树中UGTs家族成员众多,共包含297个拷贝。根据其结构和底物偏好性可分为18个亚家族(A-R),其中UGT76隶属于H亚家族,该亚家族在不同茶树品种中呈现显著收缩的状态,特别是在茶树‘舒茶早’品种中仅保留了一个拷贝(UGTH1)。功能试验证实该拷贝与茶树真菌病害的抗性密切相关,暗示着H亚家族在茶树中仍保留了其它植物中保守的抗病功能。与H亚家族不同,UGT85隶属于G亚家族。该家族成员通常在糖基化单萜、二萜和脱辅基类胡萝卜素等底物上表现出特定的偏好性。研究发现,茶树G亚家族的UGTs可进一步划分为3种类型(Ⅰ-Ⅲ),其中Ⅱ和ⅡI型的UGTs在茶树全基因组重复和串联重复事件驱动下发生显著扩增,之后经历了功能分化。如G亚家族Ⅱ型代表成员UGT85A53(Ⅱ-2)和UGT1(Ⅱ-3)为重复基因,二者均能糖基化香叶醇等挥发性化合物,但对激素底物的选择发生了分化。主要表现为,UGT85A53的糖基化底物为脱落酸(ABA),而UGT1并未表现出对ABA或其他激素的糖基化活性,二者对激素底物的选择差异重塑了重复基因UGT85A53和 UGT1分别通过正、负调控的方式调控茶树的抗寒和抗旱性。研究还进一步对野生型茶树(DASZ)和栽培茶树(‘云抗10号’和‘舒茶早’)的UGTs进行了比较分析,发现茶树G亚家族ⅡI-1为茶树‘舒茶早’品种特有分支。遗传多样性分析进一步发现,该分支中的许多UGTs经历了人工选择。特别地,ⅡI-1代表成员UGT3和ⅡI-2代表成员UGT2分别具有糖基化叶绿醇和呋喃酮的活性,表明二者在糖基化香气底物上表现出分化。进一步功能实验发现,UGT2可参与茶树的抗寒和抗旱,而UGT3仅能参与茶树的抗寒而非抗旱(图3),进一步证明G亚家族ⅡI中受人工选择的UGTs表现出抗寒性保守而抗旱性分化的功能差异。这些发现不仅为揭示了驯化过程中UGTs协同调控茶树香气品质与抗寒性的全新机制,也为其他园艺作物香气品质与抗性的协同选择提供新思路。本研究中,茶树叶片光合作用活性相关的叶绿素荧光参数通过调制叶绿素荧光成像MAXI-IMAGING-PAM测量完成

2. Chlorophyll to zeaxanthin energy transfer in nonphotochemical quenching: An exciton annihilation-free transient absorption study (PNAS,  IF=9.4)

在光合作用激发能的传递研究中,可以通过使用瞬态吸收(TA)光谱学追踪叶绿素激发后的类胡萝卜素S1态的数量来探索类胡萝卜素(Car)在NPQ中通过Chl→Car进行激发能传递的作用。然而,由于叶绿素Qy(S1)到Sn的吸收光谱覆盖了大部分可见光谱,如果想检测如Car S1到Sn转换的额外贡献,需要良好信噪比的瞬态吸收光谱,特别是对于像类囊体膜这样高度散射的样品。这反过来需要比用于荧光寿命测量更高的激发脉冲能量。在所需的激发能量下,激发态-激发态湮灭(EEA)在类囊体膜这样的扩展激发态传输系统中几乎是不可避免的,这引起了人们的担忧,即在瞬态吸收测量中观察到的任何额外的瞬态物质可能仅仅是在湮灭过程中形成的高能物种的结果。2024年10月8日,PNAS在线发表加州大学伯克利分校化学系Graham R. Fleming实验室和植物与微生物生物学系Krishna K. Niyogi实验室联合署名的,标题为Chlorophyll to zeaxanthin energy transfer in nonphotochemical quenching: An exciton annihilation-free transient absorption study的研究论文。在该研究中,Maly等人展示了一种非常简单直接的方法来分离非线性泵浦-探测信号的第三阶(单粒子)、第五阶(双粒子)、第七阶(三粒子)等的贡献。这种方法使得提取不受多粒子动力学如激发态能量转移影响的激发态动力学成为可能,并增加了我们对类囊体膜对高光照响应期间观察到的瞬态的信心。此外,瞬态吸收信号的第五阶贡献包含了关于激发态运动的信息,作者在这项工作中简要分析了这一点。

与本研究有关的早期研究是通过菠菜类囊体来做的,其中NPQ突变体不可用,未实现的研究目的在这项研究中通过本氏烟(Nicotiana benthamiana)NPQ突变体的生成得到了解决。结合瞬态吸收数据和在关键突变体[缺乏PsbS的npq4、缺乏叶黄素的npq1和缺乏玉米黄质的lut2的N. benthamiana]上收集的快照荧光寿命数据,强烈表明Chl Qy到Zea S1的激发态能量传递是强光条件下qE响应的一个重要组成部分。本研究中使用的实验材料是转基因本氏烟草N. benthamiana (Nb-1),10小时的日照时间生长。使用CRISPR/Cas9技术在本氏烟中生成NPQ相关基因的突变体。使用MAXI-IMAGING-PAM调制叶绿素荧光成像系统在室温下对植物进行全株和/或叶片打孔叶绿素荧光表型测量来鉴定目标直系同源物的CRISPR/Cas9 敲除。采用泵浦-探测技术,通过隔离高阶非线性信号来研究激发态能量转移。使用时间相关单光子计数(TCSPC)技术测量叶绿素激发态寿命的变化。通过高效液相色谱(HPLC)分析叶片中的叶绿素和类胡萝卜素组成。通过超速离心法分离类囊体膜,并使用连续梯度蔗糖密度梯度离心法分析膜的组成。研究结果发现,在qE激活过程中,从激发态叶绿素Qy到玉米黄质S1的激发能量转移与黄绿素循环之间存在很强的相关性。在缺乏玉米黄质的npq1突变体系统中,没有叶黄素S1信号。此外,五阶响应分析显示,在强光照射下,激子扩散长度(LD)从62±6 nm减小到43±3 nm,这与激子运动范围缩小是植物对过量光照响应的一个关键因素是一致的。
3Geranylgeranylated-chlorophyll-protein complexes in lhl3 mutant of the green alga Chlamydomonas reinhardtii(The Plant Journal, IF=6.2)

叶绿素a和b(Chla和b)参与植物和绿藻的光捕获、光化学反应和电子转移反应。光系统的核心复合物(PSI和PSⅡ)与Chl a 结合,而外周天线复合物(LHCI和LHCⅡ)结合Chla和b。Chl生物合成的最后一步是通过香叶基香叶基还原酶(GGR)将香叶基香叶基化的Chls(ChlsGG系列)转化为植酸化的Chls。2024年10月15日,日本冈山大学Yuichiro Takahashi研究组在The Plant Journal杂志在线发表题为“Geranylgeranylated-chlorophyll-protein complexes in lhl3 mutant of the green alga Chlamydomonas reinhardtii”的研究论文,文章分离并表征了绿藻莱茵衣藻的淡绿色突变体,该突变体对光非常敏感,无法光合生长。

进一步研究发现,该突变体的LHL3基因缺失了16个bp,导致LHL3和GGR的缺失,只积累了ChlsGG。在黑暗中生长的lhl3突变体细胞积累的PSII和PSI蛋白只有野生型植株的 25-50%,缺乏PSII活性,PSI活性降低。在光下生长的突变体细胞中,PSII和PSI蛋白被消耗到微量。相反,除了LHCA3外,LHCI和LHCII的积累未受影响。相关的结果表明,用ChlsGG替代Chls会强烈影响PSII和PSI复合物的结构和功能完整性,但其关联的LHC 复合物受到的影响较小。HA标记的LHL3的亲和纯化证实了稳定的LHL3-GGR复合物的形成,这对GGR的稳定性至关重要。LHL3-GGR 复合物含有少量PSI复合物组装因子,这表明Chl合成与PSI复合物组装之间可能存在耦合。
4. Resistance to the herbicide metribuzin conferred to Arabidopsis thaliana by targeted base editing of the chloroplast genome (Plant Biotechnology Journal, IF=10.0)

除草剂在现代农业中被广泛用于控制杂草,然而,除草剂也可能对作物产生毒害。因此,开发抗除草剂作物成为了一个重要的研究方向。常见的抗除草剂作物多是通过修改核基因获得抗性。然而,核基因的改造后的抗性基因可能通过花粉传播到野生种群,造成抗性基因的扩散,进而可能导致环境问题。叶绿体基因组通常通过母系遗传,不会通过花粉扩散到野生种群,这使得通过叶绿体基因组编辑赋予的性状更具生物安全性。相比于核基因编辑,叶绿体基因的这种特性有助于避免抗性基因在环境中的不受控传播。2024年10月20日,日本东京大学的Shin-ichi Arimura团队在国际知名杂志Plant Biotechnology Journal发表了题为“Resistance to the herbicide metribuzin conferred to Arabidopsis thaliana by targeted base editing of the chloroplast genome”的研究文章。研究人员使用胞嘧啶碱基编辑器Ptptalecd和Ptptalecd_v2将V219I和A251V突变引入了拟南芥thaliana Ecotype columbia-0(Col-0)的D1蛋白。随后,评估了突变体对嗪草酮的抗性。

在研究人员调查的275种物种中,从光合细菌到被子植物,除抗除草剂杂草外,所有物种在D1蛋白中都显示出V219和A251残基。与V219和A251相对应的密码子在拟南芥和作者研究的其他12种作物中是保守的。因此,这些物种是V219I和A251V替代的候选者。此外,据报道,拟南芥对嗪草酮除草剂敏感。因此,研究人员选择拟南芥进行测试。研究人员使用胞嘧啶碱基编辑器Ptptalecd和Ptptalecd_v2将V219I和A251V突变引入拟南芥thaliana Ecotype columbia-0(Col-0)的D1蛋白后获得psbA 突变体。
通过一系列的除草剂抗性的评估,A251V突变赋予了拟南芥对嗪草酮的抗性抗性,且V219I和A251V双突变体比A251V单突变体对嗪草酮更具抗性。在生长条件下,A251V突变对生长具有抑制作用。此外,V219I单突变没有促进生长,但它与A251V突变的结合部分减轻了A251V基因突变的抑制作用。
为了更好地了解突变体对嗪草酮抗性的影响,作者使用AutoDock-Vina通过对接模拟构建了嗪草酮与野生型D1蛋白结合的模型。在作者的对接模型中,嗪草酮的叔甲基与疏水袋结合,就像之前嗪草酮与豌豆野生型D1蛋白的对接模型一样。嗪草酮靠近A251的侧链。据推测,用缬氨酸取代A251会引起嗪草酮和疏水袋之间的空间,从而阻止嗪草酮的结合。此外,预计A251V取代会在质体醌和疏水袋之间引入空间碰撞,从而阻碍PSⅡ中的电子传递。作者还使用ColabFold v1.5.3(使用MMseqs2的AlphaFold2)预测了A251V突变体和V219I和A251V双突变体的D1蛋白的结构。基于预测的LDDT评分,疏水袋周围结构的置信度是可靠的。V219I和A251V双突变体以及A251V突变体预测的D1蛋白的叠加表明,V219I置换提升了Y246的侧链,这略微扩大了疏水袋(A251V),口袋的扩张可能有助于质体醌的调节,同时仍然抑制嗪草酮的结合。这种结构见解共同为为什么V219I和A251V双突变体在土壤条件下比A251V突变体生长得更好提供了合理的解释。本研究中,拟南芥光合作用火星相关的叶绿素荧光参数通过蜂巢矩阵叶绿素荧光成像系统HEXAGON-IMAGING-PAM测量完成。
5. Oxygenating respiratoid biosystem for therapeutic cell transplantation (Nature Communications, IF=14.7)

细胞移植作为治疗多种疾病的潜在疗法,一直备受关注。然而,一个关键难题如影随形,那就是如何确保移植细胞拥有充足氧气。缺氧问题严重制约了细胞移植的成效,影响细胞功能和存活。2024年10月23日,Nature Communications在线发表韩国首尔汉阳大学Dong Yun Lee课题组标题为“Oxygenating respiratoid biosystem for therapeutic cell transplantation”的研究论文。文章报道了一项创新性研究,科研人员精心打造了一种放氧呼吸生物系统,有望为细胞移植带来突破性进展,为解决缺氧困境开辟新道路。本研究中,叶绿体颗粒光合活性相关的叶绿素荧光参数和光曲线测量通过叶绿素荧光成像IMAGING-PAM完成。

在本研究中,研究人员使用了从陆地植物中分离出的叶绿体,降低了光合微生物固有的生物污染风险。然而,分离的叶绿体在试管中只能保持数小时的结构完整,光合作用通常在光照暴露后的30分钟至半天内丧失。所以,维持叶绿体的结构对于保持内部环境和实现光合作用等关键过程至关重要。为此,该研究采用了从陆地植物中分离的叶绿体作为放氧源时,结合叶绿体转运肽(CTP)与藻酸盐构建放氧呼吸生物系统。CTP对于维持叶绿体结构和功能至关重要,它能够锚定在叶绿体外膜上,增强叶绿体的结构稳定性,同时上调光合作用相关基因的表达,从而实现持续自供氧。

CTP的序列为Met(M)-Phe(F)-Ala(A)-Phe(F)-Gln(Q)-Tyr(Y)-Leu(L)-Leu(L)-Val(V)-Met(M),来源于拟南芥TOC34的跨膜结构域。实验表明,CTP能够完全覆盖叶绿体表面,在20小时的孵育过程中不损害其结构,罗丹明B染色证实了这一点。同时,CTP处理显著降低了叶绿素的释放量,表明其稳定了叶绿体结构,使处理后的叶绿体在14天后仍保持较高浓度。在缺氧条件下,无论是否有光照,CTP处理的叶绿体在20小时内都能保持较高的放氧水平,即使在加入抑制氧释放的铝离子(Al3?)后也是如此。通过对光系统Ⅱ(PSⅡ)相关参数的测量,如有效量子效率(Y(Ⅱ))、电子传递速率(ETR)、表观量子产率(α)和最大光合速率(Pmax)等,发现CTP处理后的叶绿体这些参数值均高于仅用Al3?处理的叶绿体。对PSⅡ复合物的研究发现,CTP处理能显著增加与氧释放(水氧化)活性相关的三个外在蛋白PsbO、PsbP和PsbQ的表达。SDS-PAGE分析表明,CTP处理14天后,这些蛋白亚基的表达明显高于仅用Al3?处理的情况,且在缺氧条件下,CTP处理的PSⅡ复合物的放氧水平显著高于其他处理。通过RNA测序(RNA-seq)分析发现,CTP处理可显著增加RNA含量,基因集富集分析(GSEA)确定了一系列显著上调的基因。功能注释分析表明,CTP处理上调了与光合作用和蛋白质翻译相关的基因,特别是与类囊体膜蛋白相关的基因。此外,CTP还显著上调了叶绿体核糖体蛋白。这些结果表明,CTP的调节信号可促进类囊体膜蛋白的合成,最终激活光合作用和放氧作用。为进一步研究,我们设计了针对PSⅡ和核糖体亚基关键蛋白的小干扰RNA(siRNA),并进行转染实验。结果发现,CTP处理能显著上调psbA、psbO、rps12rpl14的mRNA水平,且在缺氧或正常氧环境下,CTP处理均能恢复siRNA处理的叶绿体的放氧功能。这表明CTP可与叶绿体中的放氧相关基因发生分子反应。我们通过碳二亚胺化学法将CTP的N端与生物相容性藻酸盐(Al)的羧基进行化学偶联。实验确定了最佳的偶联摩尔比为1:1,此时CTP与藻酸盐成功通过酰胺键结合形成Al-CTP偶联物,且不影响水凝胶的形成。通过流变学分析,发现Al-CTP水凝胶与传统藻酸盐水凝胶的储能模量和损耗模量相似。将Al-CTP偶联物、叶绿体和治疗性细胞封装在微胶囊中,系统评估了封装条件,包括封装器的设置(如频率、电极、流速等)和不同钙浓度对系统的影响。优化后的条件确保了生物系统的有效形成,同时发现钙浓度可调控生物系统的降解性,而不影响氧气产生。

扫描电子显微镜(SEM)分析显示,封装胰岛细胞的微胶囊呈球形且结构紧凑。在含有叶绿体的微胶囊(如Al-Ch和放氧呼吸生物系统)中,可观察到叶绿体的存在,其表面微观结构不均匀。成功封装胰岛细胞后,测量微胶囊中叶绿素释放量,发现放氧呼吸生物系统在14天内释放的叶绿素量低于Al-Ch,且两种微胶囊在14天后仍保持球形。在缺氧条件下,放氧呼吸生物系统中的胰岛细胞活力显著高于完整胰岛细胞和Al-CTP微胶囊中的胰岛细胞。活/死细胞染色实验表明,放氧呼吸生物系统中的胰岛细胞死亡信号减少。葡萄糖刺激胰岛素分泌(GSIS)测试显示,尽管在缺氧环境中胰岛细胞的葡萄糖反应性受损,但封装在放氧呼吸生物系统中的胰岛细胞胰岛素分泌模式与正常氧条件下相似,刺激指数(SI)也得到恢复。免疫染色结果显示,放氧呼吸生物系统中的胰岛细胞在缺氧条件下HIF-1α表达较低,胰岛素表达较高。在糖尿病小鼠模型中进行皮下移植实验,测量移植区域的氧气水平发现,放氧呼吸生物系统移植后,尽管皮下区域通常氧气含量低,但仍显著增加了氧气水平。监测糖尿病小鼠的体重和血糖水平表明,放氧呼吸生物系统在维持血糖水平方面优于Al-CTP微胶囊,至少可持续14天。免疫染色显示,皮下移植的放氧呼吸生物系统中胰岛细胞HIF-1α表达较低,胰岛素表达较高,巨噬细胞浸润不明显,纤维化程度低,有利于营养/氧气扩散和胰岛素长期分泌。腹腔内移植实验中,植入Al-CTP微胶囊的小鼠在30天后血糖恢复至高水平,而植入放氧呼吸生物系统的小鼠在85天以上保持正常血糖水平,且微胶囊未被排斥。在100天后,放氧呼吸生物系统大多自由漂浮在腹腔内,与腹部器官粘连少,仍包裹着胰岛细胞,形态保持清洁透明。免疫染色显示,移植后的胰岛细胞HIF-1α表达低,胰岛素表达高。腹腔内葡萄糖耐量测试(IPGTT)表明,放氧呼吸生物系统处理的小鼠血糖和血清胰岛素水平模式与非糖尿病健康小鼠相似。

本研究成功开发了一种放氧呼吸生物系统,该系统通过将植物叶绿体与生物相容性藻酸盐-CTP偶联物相结合,能够在无需抗氧化剂和光照的情况下长期自发供氧,为移植细胞提供了适宜的生存环境。在分子机制层面,CTP通过调节基因表达,增强了叶绿体的光合效率和氧气释放能力,促进了蛋白质合成,激活了光合作用,且在无光照条件下也能发挥作用。通过体内外实验验证,该生物系统在治疗性细胞移植方面具有显著优势,能有效提高胰岛细胞等治疗性细胞的存活和功能,为治疗糖尿病等疾病提供了新的策略。未来,我们期望该放氧呼吸生物系统能够应用于更大规模的组织工程构建,克服目前临床组织工程构建尺寸受限的问题,为细胞疗法提供更有效的支持,推动组织工程和再生医学领域的发展。

6. Na+-driven pH regulation by Na/H antiporters promotes photosynthetic efficiency in cyanobacteria (Plant Physiology, IF=6.5)

光合作用是植物和蓝藻生长的关键过程,依赖于光能的吸收和转换。光能被类囊体膜中的光捕获天线吸收,通过电子传递链形成质子动力,降低类囊体腔的pH值,产生ATP和NADPH,这些能量和还原力用于二氧化碳的固定。然而,过量光照会产生活性氧种,损害光系统并抑制光合作用,称为光抑制。为了应对光抑制,植物和蓝藻进化出了多种调节机制,包括抑制电子传递和激活能量耗散系统。蓝藻的细胞质pH与光合作用密切相关,影响电子传递和卡尔文循环。细胞质碱化还调节类胡萝卜素合成和光保护相关蛋白的活性。尽管已知pH调节对光合作用重要,但对膜转运体如何调节pH的理解还很有限。蓝藻作为研究模型,帮助我们理解光合作用和细胞稳态的机制。Synechocystis sp. PCC6803是一种常用的蓝藻,它具有盐耐性并含有多个Na/H逆向转运蛋白基因。这些蛋白在适应盐胁迫和光合作用调节中起作用,但具体功能和生理角色尚不清楚。例如,NhaS3在高CO2条件下表达上调,可能参与光合作用调节。NhaS2和NhaS4则在维持Na稳态中起作用。

2024年10月24日,Plant Physiology杂志在线发表日本东北大学Nobuyuki Uozumi课题组题为“Na-driven pH regulation by Na/H antiporters promotes photosynthetic efficiency in cyanobacteria”的研究论文。文章评估了六种Na+/H+反转运体(NhaS1至NhaS6)在蓝藻 Synechocystis sp. PCC6803在高光照强度下对 Na+有强烈需求,ΔnhaS1和ΔnhaS2菌株无法在高光照条件下生长。研究分析了大肠杆菌倒膜中NhaS1至NhaS6的Na外流驱动的H摄取活性。生物分馏和免疫电镜检查发现,NhaS1定位于质膜和TM,而NhaS2定位于质膜(PM)。对光合作用活性的测定表明,NhaS2 促进了ATP 的产生以及从PQ到P700的电子传递。对细胞外和细胞质中pH值的测量表明,NhaS1和NhaS2 都参与了PM介导的光依赖性H+吸收和细胞质酸化。研究还发现,NhaS1和NhaS2还能防止高光处理下的光抑制。这些结果表明,NhaS1和NhaS2介导的H+转运在调节细胞内pH值和维持光合电子传递方面发挥了作用。本研究中,蓝藻光合活性相关的叶绿素荧光参数通过DUAL-PAM-100双通道叶绿素荧光仪和WATER-PAM藻类叶绿素荧光仪测量完成
7. A novel LRR receptor-like kinase BRAK reciprocally phosphorylates PSKR1 to enhance growth and defense in tomato (The EMBO Journal, IF=9.4)

植物在生长发育过程中经常受到各种病原体的侵袭。为应对这些持续威胁,植物进化出复杂精细的免疫系统,通过感知、信号传导和激活下游基因表达来抵御病原体入侵。植物在激活抗性反应时,自身的生长发育往往会受到抑制,这就是经典的“生长-抗性”平衡理论。其中,准确且迅速地检测病原体或其相关信号,是植物启动防御反应的基础,而受体激酶(RLKs)在识别外部信号和内部信号传导方面发挥着至关重要的作用。浙江大学师恺教授课题组前期鉴定了富含LRR基序的跨膜受体蛋白激酶PSKR1为损伤相关分子模式PSK多肽(磺肽素)的识别受体,并揭示了PSKR1感知PSK后激发Ca2+信号,通过生长素路径,以及PSKR1的泛素化降解途径提高番茄对灰霉病的抗性(Zhang et al., Plant Cell, 2018,Hu et al., Plant Physiol, 2023)。此外,PSKR1通过CPK28-GS2路径调控氮同化促进植株生长(Ding et al.EMBO J, 2023),并通过磷酸化转录因子DREB2F调控番茄果实成熟和品质形成(Fang et al., Plant Physiol, 2024)。

2024年10月24日,师恺课题组在知名期刊The EMBO Journal发表了题A novel LRR receptor-like kinase BRAK reciprocally phosphorylates PSKR1 to enhance growth and defense in tomato的研究论文,揭示了新型受体蛋白激酶BRAK通过与PSK受体蛋白PSKR1相互磷酸化协同提高番茄植株生长,果实产量及灰霉病抗性的分子机制。本研究中,番茄叶片光合作用活性相关的叶绿素荧光参数通过IMAGING-PAM叶绿素荧光成像系统测测量完成

该研究中,研究人员通过分析234个番茄LRR-RLK基因在灰霉病菌侵染后的表达模式,鉴定到一个受灰霉病诱导高表达的富含LRR基序的新型受体蛋白激酶 (Solyc06g069650) ,并命名为BRAK (Botrytis cinerea resistance-associated kinase)。通过构建brak突变体及过表达植株发现其正调控番茄植株生长,果实产量和灰霉病抗性。利用酵母库筛选及多种蛋白-蛋白互作的研究手段,发现BRAK与PSKR1存在相互作用。且PSK诱导的生长和防御反应在pskr1、brak单突变体和双突变体中均受到了抑制,以及在沉默BRAK的OE-PSKR1植株中同样如此。进一步研究发现,BRAK和PSKR1胞内部分互相磷酸化,且相关位点的磷酸化作用对于协同促进生长和抗性至关重要。

综上,该研究首次揭示了PSK受体PSKR1与新型受体蛋白激酶BRAK相互磷酸化协同提高番茄生长和灰霉病抗性的分子机制,研究为生物育种中同时提高病害抗性和促进植物生长提供了新的优异基因,同时也加深了我们对PSK多肽信号通路的认知,为基于PSK多肽调控生长与抗性的绿色产品和技术研发应用提供了依据。

8. Fast dehydration reduces bundle sheath conductance in C4 maize and sorghum (New Phytologist, IF=8.3)

干旱对农作物产生严重影响,可能导致食物短缺和经济困难,这些问题预计在未来会加剧。C4植物因其在温暖气候下的高生产力、耐热性和水分利用效率而被视为提高作物产量的有希望的选择。C4光合作用在叶肉细胞和维管束鞘细胞之间共享,通过生化CO2浓缩机制有效地将CO2输送到羧化作用的位点。这种机制减少了光呼吸作用,提高了水分利用效率,使C4植物成为出色的干旱幸存者。在非休眠植物中,抗旱性分为规避和耐受策略。C4植物通过气孔间的CO2浓度梯度,实现低蒸腾率下的高吸收率,延长土壤水分保持,延缓水分限制下的压力。研究表明,C4植物对脱水的敏感性通常比C3植物更为明显,尤其是在快速脱水情况下。然而,气孔关闭并非C4光合作用在脱水期间的主要障碍,非气孔因素如代谢物交换可能更为关键。

2024年10月25日,New Phytologist在线发表都柏林大学Chandra Bellasio署名通讯作者,题为“Fast dehydration reduces bundle sheath conductance in C4 maize and sorghum”的研究文章。文章重点探究了C4光合作用对脱水敏感的原因,假设C4机制可能因结构变化而受阻,影响CO2输送或代谢物交换。通过实验研究模拟了快速脱水过程,并监测了气体交换、叶绿素荧光以及CO2和水的同位素组成。结合生化模型和同位素歧视模型,我们旨在确定非气孔限制是否与叶肉或维管束鞘对CO2的导度降低有关,以揭示C4光合作用在干旱条件下的适应机制。本研究中,玉米和高粱光合作用活性相关的叶绿素荧光参数通过DUAL-PAM-F光纤版双通道叶绿素荧光仪测量完成。

9. Insights into physiological roles of flavonoids in plant cold acclimation (The Plant Journal, IF=6.2)

植物代谢是一个复杂的网络,涉及多种化合物的合成、降解和转化。碳水化合物作为光合作用CO2固定的直接产物,是所有合成代谢途径的基础,与羧酸和氨基酸一起构成蛋白质、脂质和核苷酸生物合成的基本单元。此外,它们还是多种特殊化合物如生物碱、硫苷和类黄酮的生物合成底物,这些化合物有助于植物抵御生物和非生物环境胁迫。许多植物在低温下会经历冷驯化过程,提高其抗冻能力。这一过程涉及光合作用和碳水化合物代谢的调整,以防止光抑制和不平衡的光合反应。蔗糖代谢在光合作用适应中起着关键作用,而蔗糖磷酸合成酶(SPS)活性的调整对于维持光合ATP合成至关重要。类黄酮作为酚丙烷的一类,主要由苯丙氨酸合成,对植物的冷驯化和抗冻能力有重要影响,但其具体生理作用尚不明确。类黄酮在植物细胞中的分布广泛,包括液泡、细胞核和叶绿体,这增加了对其功能的分析难度。类黄酮生物合成的主要途径位于细胞质中,涉及多种酶的活性。在环境条件变化,尤其是低温下,光合作用适应有助于维持电子传递、ATP合成和CO2固定的平衡。CBBC循环中的酶在低温下上调,以补偿活性的下降。这些冷诱导过程在冷驯化的初期即可观察到,而类黄酮和其他特殊代谢物的积累则在这些初级代谢反应之后发生。

2024年10月25日,The Plant Journal杂志在线发表慕尼黑大学Thomas N?gele实验室标题为“Insights into physiological roles of flavonoids in plant cold acclimation”的研究文章。

在本研究中,研究人员将拟南芥叶片组织的非水分馏与代谢组学和蛋白质组学分析相结合,揭示了类黄酮缺乏对低温适应过程中亚细胞代谢的影响。在为期两周的冷适应期的前三天,类黄酮缺乏会影响丙酮酸、柠檬酸和谷氨酸的代谢,这表明类黄酮在稳定C/N代谢和光合作用方面发挥作用。此外,还发现四氢叶酸代谢受到影响,这对光呼吸途径的蛋白质组有显著影响。在冷适应后期,黄酮类化合物的缺乏会影响蛋白质的稳定性、折叠和蛋白酶体降解,从而导致两种突变体的蛋白质总量显著下降。总之,这些研究结果表明,类黄酮代谢在植物冷适应的早期和晚期阶段发挥着不同的作用,并对在不断变化的环境中建立新的蛋白质平衡做出了重要贡献。

本研究中,拟南芥叶片净CO2同化速率通过便携式光合-荧光测量系统GFS-3000测量完成。

10. The thylakoid phosphatase TEF8 is involved in state transition and high light stress resistance in Chlamydomonas (The Plant Journal, IF=6.2)

光合作用蛋白复合体将光能转化为化学能量,为地球生命提供动力。光能驱动电子流通过PSII、细胞色素b6f和PSI等光合蛋白复合体。然而,过量光照可能损伤光合蛋白,因此植物演化出多种非光化学猝灭(NPQ)机制来释放多余的光能,其中之一是状态转换(qT),它通过调整LHCII在PSII和PSI之间的分配来响应光照质量的变化。状态转换由质体醌池的氧化还原状态精细调控,涉及LHCII的磷酸化和去磷酸化过程,这些过程由特定的激酶和磷酸酶控制。在陆生植物中,只有15%-20%的LHCII参与状态转换,而在衣藻中这一比例高达80%。状态转换有助于光合生物适应变化的光照条件,优化光合作用效率并防止光损伤。除了状态转换,光抑制猝灭(qI)是另一种NPQ类型,涉及光损伤D1蛋白的降解和新合成,以及PSII的修复,这些过程对植物和绿藻抵抗强光至关重要。在拟南芥中,PSII核心亚基的磷酸化和去磷酸化由STN8和PBCP等激酶和磷酸酶调控,但在衣藻中这些过程尚不清楚。

2024年10月25日,The Plant Journal在线发表西北大学生科院王菲&付爱根课题组标题为The thylakoid phosphatase TEF8 is involved in state transition and high light stress resistance in Chlamydomonas的研究论文。文章对衣藻的一个强光响应基因THYLAKOID ENRICHED FRACTION 8 (TEF8)进行了鉴定。衣藻tef8突变体表现出高光敏性和状态转换缺陷。酶活性测定表明,TEF8是一种真正的磷酸酶,定位于类囊体膜。BN-PAGE、Pull-down和磷酸肽质谱等生化检测证明,TEF8与光系统II有关联,并在状态2向状态1的转换过程中参与了D2和CP29亚基的去磷酸化。综上所述,该研究结果确定了TEF8是一种在光系统II上具有多个去磷酸化靶点的类囊体磷酸酶,并为了解衣藻状态转换和耐强光的调控机制提供了新的视角。

本研究中,衣藻光合作用活性相关的叶绿素荧光参数通过DUAL-PAM-100双通道叶绿素荧光仪测量完成

11. Distinct features of PsbS essential for mediating plant photoprotection (Plant Communications, IF=14.7)
光合作用是植物将光能转化为稳定化学能的关键生理过程,涉及捕光天线复合体(LHCs)在光合膜内的能量吸收与传递。随着光照强度的增加,LHCs吸收的光能可能会超过植物暗反应进行二氧化碳固定所需要的能量,若不加以调节,过量的能量会导致光合机构的损伤,尤其是光系统Ⅱ(PSⅡ)的光抑制。为减轻这种光抑制,植物进化出了非光化学淬灭(Non-Photochemical Quenching, NPQ)机制,能够迅速将捕获的过剩光能以热的形式散发,实现光保护。在NPQ中,能量依赖性非光化学淬灭(qE)是其主要组成部分,由跨类囊体膜质子梯度(ΔpH)驱动,能够在几秒到几分钟内迅速激活和解除。qE的有效性在很大程度上依赖于PsbS蛋白的存在。PsbS是一种主要存在于光合细胞类囊体膜中的小型蛋白,在调节LHCs的光捕获状态和促进光能安全耗散中起着至关重要的作用。研究表明,PsbS的丰度与qE的诱导和弛豫速率密切相关。某些氨基酸突变,特别是两个谷氨酸残基(E69和E173),会导致qE的完全失活,这些残基的质子化被认为在PsbS的二聚体-单体转变过程中起着至关重要的作用。PsbS的二聚体-单体转变使其能够在光照条件变化时迅速适应,增强与LHCs的相互作用,从而有效调节光捕获状态。这一转变不仅影响PsbS的功能,还可能对类囊体膜的结构动态产生影响,进一步促进光能的安全耗散。然而,关于PsbS如何稳定LHC中的qE并维持其活性,以及PsbS在类囊体膜结构中发挥的结构性作用仍缺乏实验证据,亟需进一步研究以阐明其机制。

2024年10月28日,伦敦玛丽女王大学(QMUL)的Alexander Ruban实验室的陈莉莉博士在Plant Communications上发表了题为“Distinct features of PsbS essential for mediating plant photoprotection”的研究论文,文章揭示了PsbS蛋白在植物光保护中发挥功能所必需的特定氨基酸结构域,为理解植物光捕获的动态调节提供了新见解。

本研究首先基于菠菜类囊体膜PsbS蛋白的晶体结构和前人的研究成果,精确定位了本研究中突变和删除的氨基酸残基,生成了一系列PsbS点突变体。这些突变体包括位于类囊体腔侧的两个谷氨酸残基(E69和E173)被突变成谷氨酰胺,发现它们在光保护的激活过程中PsbS 寡聚体状态和构象的动态变化中起着关键的作用。跨膜螺旋Ⅱ(TM2)和跨膜螺旋Ⅳ(TM4)中的疏水性苯丙氨酸残基(F83、F84、F87、F191、F193和F194)被酪氨酸取代的突变体研究表明,TM4中的苯丙氨酸在PsbS与LHCⅡ的疏水相互作用中起着重要作用。移除310螺旋(H3)上的氨基酸 I74、Y75 和 E76会导致qE在黑暗中的弛豫明显减慢。

研究者进一步使用化学交联剂(DTSSP)来稳定PsbS的二聚体,并在不同光照条件下(如黑暗适应、光照、恢复状态)评估突变体的NPQ特性。结果表明,E69QE173Q突变体完全失去了PsbS的活性,导致其在光照下的NPQ被显著抑制,显示出这两个残基在PsbS活性中的重要性。此外,F83YF84YF87Y和F191YF193YF194Y突变体的NPQ幅度也显著降低,进一步支持了PsbS的结构与功能之间的密切关系。研究还发现,H3突变体在NPQ诱导动力学上与野生型相似,但NPQ的恢复速度显著减慢,表明H3结构在PsbS功能中起着重要作用。

最后,研究人员利用ESMFold方法重建了野生型和突变型PsbS的三级蛋白结构。结果显示,突变并未显著改变蛋白质的整体结构,表明NPQ的变化主要是由于氨基酸结构域的变化,而非蛋白质结构的错误折叠。这一发现为理解PsbS在光合作用和光保护中的功能提供了新的视角。

综上所述,本研究通过精确的突变位点分析以及分子动力学模拟,深入揭示了PsbS在光合作用中的光保护机制,为未来提高作物光合作用效率和适应性提供了重要的实验依据和理论基础。

本研究中,拟南芥野生型和突变体植株非光化学淬灭NPQ的诱导和弛豫均通过双通道调制叶绿素荧光仪DUAL-PAM-100测量完成

12. Identifying the gene responsible for non-photochemical quenching reversal in Phaeodactylum tricornutum (The Plant Journal, IF=6.2)
植物和藻类使用多种色素进行光合作用和光保护。维管植物主要使用叶绿素a和b捕获光能,而类胡萝卜素色素如叶黄素循环(VAZ)的紫黄质(violaxanthin)、花药黄质(antheraxanthin)和玉米黄质(zeaxanthin)在调节非光化学淬灭(NPQ)中起着重要作用,通过这种方式释放多余的光能。紫黄质脱环氧化酶(VDE)和玉米黄质环氧化酶(ZEP)在光捕获天线的光捕获状态和能量耗散状态之间切换。许多藻类,如硅藻和甲藻,含有不同的光合作用色素,包括叶绿素a+c和岩藻黄素,以及(硅甲藻黄素)Ddx:Dtx(硅藻黄质)循环,这在绿色谱系的藻类和植物中是不存在的。NPQ是硅藻的主要光保护机制,其中qE组分可以释放吸收光子的50%作为热量。在高光条件下,Ddx脱环氧化成Dtx,促进NPQ。基因沉默实验表明,VDE基因是硅藻中Ddx转换为Dtx的关键组分,但反向反应尚未明确。反向遗传学实验有助于发现与光捕获和NPQ相关色素的生物合成途径,特别是岩藻黄素的生物合成途径,这是一种含有特殊化学特征的不对称类胡萝卜素。

2024年10月30日,The Plant Journal杂志在线发表美国科罗拉多州立大学生物系Graham Peers课题组标题为“Identifying the gene responsible for non-photochemical quenching reversal in Phaeodactylum tricornutum”的研究论文。文章从?三角褐指藻中发现了玉米黄质环氧化酶 3(ZEP3),作为候选的硅藻黄质环氧化酶。敲除ZEP3基因会导致饱和光照下快速可逆的 NPQ损失。这与在弱光下恢复期间维持高浓度的硅藻黄素有关。通过与野生型ZEP3基因互补,叶黄素循环和NPQ弛豫得以恢复。zep3基因敲除菌株在较高光通量下光合速率降低,在多变光照条件下特定生长速率降低,这可能是由于突变菌株锁定在光能耗散状态。通过将ZEP3基因置于β-雌二醇诱导启动子的控制下,我们能够以时间和剂量依赖的方式切换 NPQ能力水平。该基因的鉴定加深了我们对藻类光合作用控制的多样性的理解,并为提高工业规模培养的生产力提供了一个潜在的靶标。

本研究中,?三角褐指藻培养环境光通过ULM-500多功能辐射计测量,光合活性相关的叶绿素荧光参数Fm,Fm’,非光化学淬灭NPQ通过MAXI-IMAGING-PAM叶绿素荧光成像系统和DUAL-PAM-100双通道叶绿素荧光仪测量完成
参考文献
1. Wang, J., et al. (2024). "Evolution and functional divergence of glycosyltransferase genes shaped the quality and cold tolerance of tea plants." The Plant Cell.[MAXI-IMAGING-PAM]
2. Lee, T.-Y., et al. (2024). "Chlorophyll to zeaxanthin energy transfer in nonphotochemical quenching: An exciton annihilation-free transient absorption study." Proceedings of the National Academy of Sciences 121(42): e2411620121.[MAXI-IMAGING-PAM]
3. Kodru, S., et al. (2024). "Geranylgeranylated-chlorophyll-protein complexes in lhl3 mutant of the green alga Chlamydomonas reinhardtⅡ." The Plant Journal n/a(n/a).[DUAL-PAM-100]
4. Nakazato, I., et al. (2024). "Resistance to the herbicide metribuzin conferred to Arabidopsis thaliana by targeted base editing of the chloroplast genome." Plant biotechnology journal n/a(n/a).[HEXAGON-IMAGING-PAM]
5. Jang, S., et al. (2024). "Oxygenating respiratoid biosystem for therapeutic cell transplantation." Nature communications 15(1): 9151. [MAXI-IMAGING-PAM]
6. TsujⅡ, M., et al. (2024). "Na+-driven pH regulation by Na+/H+ antiporters promotes photosynthetic efficiency in cyanobacteria." Plant Physiology. [DUAL-PAM -100&WATER-PAM]
7. Ding, S., et al. (2024). "A novel LRR receptor-like kinase BRAK reciprocally phosphorylates PSKR1 to enhance growth and defense in tomato." The EMBO Journal 0(0): 1-20.[MAXI-IMAGING-PAM]
8. Bellasio, C., et al. (2024). "Fast dehydration reduces bundle sheath conductance in C maize and sorghum." New Phytologist n/a(n/a).[DUAL-PAM -F]
9. Kitashova, A., et al. (2024). "Insights into physiological roles of flavonoids in plant cold acclimation." The Plant Journal n/a(n/a).[GFS-3000]
10. Dong, J., et al. (2024). "The thylakoid phosphatase TEF8 is involved in state transition and high light stress resistance in Chlamydomonas." The Plant Journal n/a(n/a).[DUAL-PAM-100]
11. Chen, L., et al. (2024). "Distinct features of PsbS essential for mediating plant photoprotection." Plant Communications.[DUAL-PAM-100]
12. Ware, M. A., et al. (2024). "Identifying the gene responsible for non-photochemical quenching reversal in Phaeodactylum tricornutum." The Plant Journal n/a(n/a).[ULM-500&DUAL-PAM-100&MAXI-IMAGING-PAM]
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最近更新:2024-12-27 10:23:45
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