在工业领域,酵母的应用极为广泛,从发酵食品到合成生物学诸多方面都有它的身影。目前,工业酵母的传统筛选主要依赖人工挑取。科研人员需要在堆积如山的培养皿中,凭借肉眼和经验挑选菌株,不仅效率低、周期长,更重要的是,人工操作主观性强,容易出现重复挑取相同菌株的情况,大大影响筛选结果的准确性和多样性,限制了工业酵母等微生物资源的开发利用。
自主研发的RAcolony高通量菌落智能筛选系统给出了令人满意的答案,其利用菌落形态与拉曼光谱的差异性识别,实现准确的“菌落去重复”筛选,结合自动化挑菌机械臂,代替人工操作,有效提高筛菌效率,降低后续鉴定的成本,为工业酵母等资源菌株的筛选带来了全新的解决方案。
RAcolony
凭什么脱颖而出?
· 原位拉曼检测
无需破坏或转移菌落,即可在平皿中直接获取菌落的微观图像与拉曼“分子指纹”等表型信息。
· AI智能去重
RAcolony系统基于形态、光谱相似性进行聚类分析,能够精准分辨不同菌株间的差异,有效避免重复挑取相同菌株,让筛选更高效、更准确。
· 高通量设计
多平皿综合去重+高通量机械臂挑取,满足大规模筛选的需求。无论是工业酵母资源库构建,还是发酵工艺优化,RAcolony都能大显身手。
RAcolony
您的理想筛菌助手
· 效率大幅提升
使用RAcolony,仅需挑取10~30%的菌落就能实现90~100%的物种覆盖,大大缩短了菌落筛选周期,降低了工作量。
· 成本显著降低
由于大幅减少了需要进行下游测序与功能检测的菌株数量,能够节省大量筛菌成本。
案例展示
1. 实验设计
A样品:9类工业酵母:来自8个不同属,其中 2 株属于同属不同种,平皿中共201个菌落。
B样品:8 个不同株,均属于酿酒酵母种,平皿中共100个菌落。
2. 成果展示
RAcolony配备菌落原位拉曼光谱检测模块,能够稳定、高质量地采集工业酵母菌落的拉曼光谱信息。样品 A 的筛选结果显示,9 种工业酵母拉曼光谱差异和区分度明显 ( 图 1 A-C)。RAcolony的拉曼光谱“去重” 结果表明,当从 201 个菌落中挑取18个菌落,可捕获9类工业酵母,平均物种覆盖率100%(图1 D)。可见,RAcolony能够基于拉曼光谱去重分析高效实现工业酵母筛选。
图1 样品A的拉曼光谱去重分析结果和菌落挑取数量与物种覆盖度关系
B样品的8种酿酒酵母的光谱差异和区分度也较为明显(图2 A-C),在选取14个菌落作为去重菌落数参考时,能够覆盖100%的B样品物种(图2 D)。
图2 样品B的拉曼光谱去重分析结果和菌落挑取数量与物种覆盖度关系
结语
RAcolony高通量菌落智能筛选系统正在革新传统工业酵母筛选策略,大大降低了筛菌所需的时间与费用投入,为工业酵母菌株的应用转化注入新的活力,在微生物资源库构建、功能菌株筛选等领域展现出前所未有的潜力。
参考文献:
[1]Que Z, Wang S, Wei M, Fang Y, Ma T, et al. The powerful function of Saccharomyces cerevisiae in food science and other fields: a critical review. Food Innovation and Advances. 2024;3: 167?180 doi: 10.48130/fia-0024-0016.
[2] Huang Y, Sheth RU, Zhao S, Cohen LA, Dabaghi K, Moody T, Sun Y, Ricaurte D, Richardson M, Velez-Cortes F, Blazejewski T, Kaufman A, Ronda C, Wang HH. High-throughput microbial culturomics using automation and machine learning. Nat. Biotechnol. 2023; 41:1424-33. doi: 10.1038/s41587-023-01674-2.
[3] Maquelin K, Choo-Smith LP, van Vreeswijk T, Endtz HP, Smith B, Bennett R, Bruining HA, Puppels GJ. Raman spectroscopic method for identification of clinically relevant microorganisms growing on solid culture medium. Anal Chem. 2000. 72:12-9. doi: 10.1021/ac991011h.
[4] Rebro?ová K, ?iler M, Samek O, R??i?ka F, Bernatová S, Je?ek J, Zemánek P, Holá V. Differentiation between Staphylococcus aureus and Staphylococcus epidermidis strains using Raman spectroscopy. Future Microbiol. 2017. 12:881-890. doi: 10.2217/fmb-2016-0224.
[5] Shen H, R?sch P, Popp J. Fiber Probe-Based Raman Spectroscopic Identification of Pathogenic Infection Microorganisms on Agar Plates. Anal. Chem. 2022. 94:4635-4642. doi: 10.1021/acs.analchem.1c04507.
[6] Espagnon I, Ostrovskii D, Mathey R, Dupoy M, Joly PL, Novelli-Rousseau A, Pinston F, Gal O, Mallard F, Leroux DF. Direct identification of clinically relevant bacterial and yeast microcolonies and macrocolonies on solid culture media by Raman spectroscopy. J. Biomed Opt. 2014. 19:027004. doi: 10.1117/1.JBO.19.2.027004.
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