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mNGS病原微生物检测完整解决方案

来源:翌圣生物科技(上海)股份有限公司 更新时间:2024-12-25 14:35:21 阅读量:104

面对突发性、传染性强、不明病因的疾病,需要可靠、快速手段锁定病原。毫无疑问,mNGS将病原一网打尽并在24h内出具报告,成为病原检测的一把利剑。mNGS不需要培养,直接对样本核酸进行高通量测序,能够快速、无偏差的检测临床样本中的全部病原。其检测流程可以分为5个步骤:核酸提取、文库构建、上机测序、生信分析与报告解读。
 

mNGS检测流程图
 

42a.jpg

翌圣 mNGS湿实验完整解决方案
 

宏基因组建库性能
 

主推产品:Hieff NGS® OnePot II DNA Library Prep Kit for Illumina®(Cat#13490)

 

产品特点:

1)起始兼容广:适用500pg-1μg的gDNA、全长cDNA等样本

2)操作简单:片段化/末修/加A一步完成,建库时间低至3h

3)极低背景:工艺优化,严苛质检,背景菌残留低,特别适合病原建库

 

产品性能:

1)建库性能:不同批次13490试剂盒,酶切 4℃1min;30℃ 20min;72℃ 20min;4℃ Hold,结果表明,不同类型样本,不同投入量情况下,均能建库成功
 

表1、不同样本、不同起始量样本文库产出

1652757839187891.png

44.png

图1、不同样本、不同起始量样本文库大小
 

2)背景残留:两个批次13490试剂盒(C、S),小牛胸腺DNA,500 pg、1μg Input 酶切时间20min,14cycles,illumina,PE150,20M reads/样,结果表明,两个批次背景菌残留菌较低,批次间稳定建较好

61.jpg

图2、两个批次试剂500 pg、1μg Input背景菌残留结果
 

产品详情

分类

产品名称

产品编号

规格

DNA建库

机械法建库

Hieff NGS® Ultima DNA Library Prep Kit for Illumina®

12199ES08/ES24/ES96

8 T/24 T/96 T

Hieff NGS® Ultima DNA Library Prep Kit for MGI®

13310ES16/ES96

16 T/96 T

酶切法建库

Hieff NGS® OnePot Ⅱ DNA Library Prep Kit for Illumina®

13490ES08/ES24/ES96

8 T/24 T/96 T

Hieff NGS® OnePot II DNA Library Prep Kit for MGI®

13509ES16/ES96

16 T/96 T

酶切PCR-free建库

Hieff NGS® OnePot Pro PCR-Free DNA Library Prep Kit for Illumina®

12209ES08//ES24/ES96

8 T/24 T/96 T

转座酶建库

Hieff NGS® Fast Tagment DNA Library Prep Kit for Illumina®

12206ES08/ES24/ES96;

12207ES08/ES24/ES96

8 T/24 T/96 T;

8 T/24 T/96 T

 

宏转录组建库性能

主推产品:Hieff NGS® Fast RNA Library Prep Kit for Illumina®(Cat#12304)

产品特点:

1) 起始兼容广:10~500 ng RNA建库

2) 极速建库:将传统约3.5h建库时间缩短到3 h

3) 极低背景:工艺优化,严苛质检,背景菌残留低,特别适合病原建库

产品性能:

1)Control为12253+12252(常规RNA建库),不同起始量293 RNA 为样本建库测序,结果表明,不同起始量文库产出、基因表达数量检出均正常
 

表2、不同起始量RNA文库产出

46.png

 

1653359611491524.png

 

图3、不同起始量RNA建库基因表达数量

 

2)不同起始量293 RNA ,illumina,PE150,20M reads,结果表明,大肠残留均较低
 

 

1653359651763830.png

图4、不同起始量ENA建库,大肠残留检测

 

产品详情

分类

产品名称

产品编号

规格

RNA建库

 

rRNA去除/珠蛋白去除

Hieff NGS® One-Step rRNA Removal Kit(Human,100-1,000 ng)

Hieff NGS® One-Step rRNA Removal Kit(Human,1-100 ng) 

Hieff NGS® One-Step Globin mRNA Removal Kit(Human) 

12258ES08//ES24/ES96

12259ES08//ES24/ES96

12260ES08/ES24/ES96

8 T/24 T/96 T;

8 T/24 T/96 T;

8 T/24 T/96 T

 

常规RNA建库

Hieff NGS® Ultima Dual-mode RNA Library Prep Kit for Illumina®

12252ES08/ES24/ES96

8 T/24 T/96 T

Hieff NGS® Ultima Dual-mode RNA Library Prep Kit for MGI®

13333ES08//ES24/ES96

8 T/24 T/96 T

极速RNA建库

Hieff NGS® Fast RNA Library Prep Kit for Illumina®

12304ES08/ES24/ES96

8 T/24 T/96 T

 

RNA&DNA共建库性能
 

主推产品:Hieff NGS® ds-cDNA Synthesis Kit(Cat#13488)

Hieff NGS® OnePot cDNA&gDNA Library Prep Kit(Cat#13502)

产品特点:

1) 起始兼容广:500pg-1μg RNA、DNA均能建库成功

2) 模块自由组合:Cat#13502可进行DNA建库,搭配Cat#13488可进行DNA&RNA共建库,模块灵活搭配,经济便捷

3) 极速建库:3h内完成共建库

产品性能:

1)建库性能

不同起始量标准品RNA、小牛gDNA进行建库测序,500pg-1μg RNA、DNA均能建库成功
 

表3、不同gDNA投入文库产出

 

62.jpg

 

 

表4、不同RNA投入文库产出

 

63.jpg

 

2)背景残留

表5、不同gDNA投入背景残留

 

64.jpg

 

表6、不同RNA投入背景残留

 

65.jpg

 

产品详情

分类

产品名称

产品编号

规格

 DNA&RNA共建库

RNA一、二链合成

Hieff NGS® ds-cDNA Synthesis Kit

13488ES08/ES24/ES96

8 T/24 T/96 T

Illumina&MGI DNA建库

Hieff NGS® OnePot cDNA&gDNA Library Prep Kit

13502ES08/ES24/ES96

8 T/24 T/96 T

 

tNGS多重扩增试剂
 

主推产品:Hieff® HG Multiplex PCR Master Mix Library Prep Kit (Cat#13283)

产品特点:

1) 性能优:高均一性、高特异性和高灵敏度

2) GC兼容广:兼容GC含量在25%-70%

3) 性能优:高均一性、高特异性和高灵敏度

4) 操作简洁:预混液包含除引物和DNA模板之外所有组分

产品性能:

YS自设panel 35对GC 70-80;95对GC 27-72.5; 130对GC 27-80,和竞品A、B测序比较,结果显示,GC含量在25%-70%左右基因区域均得到稳定扩增、均一性优于竞品
 

表7、不同GCpanel扩增测序结果
53.png

1652766020230644.png

 

图5、不同GC覆盖结果

 

产品详情

分类

产品名称

产品编号

规格

tNGS(多重PCR)建库

扩增Mix

Hieff® HG Multiplex PCR Master Mix Library Prep Kit

13283ES03/ES08/ES50/ES60/ES76

1 mL/5×1 mL/50 mL/250 mL/500 mL

 

建库必备

分类

产品名称

产品编号

规格






接头



长接头

Hieff NGS® Complete Adapter Kit for Illumina®

13519ES04/ES16

13520ES04/ES16

48×4 T/48×16T;

48×4 T/48×16T

 

Hieff NGS® Complete Adapter Kit for MGI®

13360ES02/ES04/ES96;

13361ES02/ES04/ES96;

13362ES02/ES04/ES96

8×2 T/8×4 T/8×100 T;

16×2 T/16×4 T/16×100 T;

96×2 T/96×4 T/96×100 T



短接头

Hieff NGS® 384 CDI Primer for Illumina®

12412ES02

12413ES02

96×2 T;

96×2 T

 

Hieff NGS® Unique Dual Index Primer Kit for MGI®

13451ES02/ES04;

13452ES02/ES04;

13453ES02/ES04;

13454ES02/ES04;

48×2 T/48×4 T;

48×2 T/48×4 T;

48×2 T/48×4 T;

48×2 T/48×4 T

 

 

文库定量

Qubit定量

1×dsDNA HS Assay Kit for Qubit®

12642ES60/ES76

100 T/500 T

dsDNA HS Assay Kit for Qubit®

12640ES60/ES76

100 T/500 T

qPCR定量

Hieff NGS® Library Quantification Kit for Illumina®,
qPCR Master Mix

12302ES05

500 T

Hieff NGS® Library Quantification Kit for Illumina®,
DNA Standard 1-6

12307ES09

6×96 μL

磁珠

DNA纯化

Hieff NGS® DNA Selection Beads

12601ES03/ES08/ES56/ES75

1 mL/5 mL/60 mL/450 mL

RNA纯化

Hieff NGS® RNA Cleaner

12602ES03/ES08/ES56/ES75

1 mL/5 mL/60 mL/450 mL

 

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翌圣生物科技(上海)股份有限公司是一家聚焦生命科学产业链上游核心原料,从事分子、蛋白和细胞三大品类生物试剂的研发、生产与销售的高新技术企业。核心产品覆盖qPCR系列、NGS系列、逆转录系列、核酸提取与纯化系列、PCR系列、分子克隆系列、体外转录系列、抗体、蛋白纯化系列、蛋白分析系列、重组蛋白、细胞分析系列、细胞培养系列、细胞转染系列、报告基因检测系列等多个品类,广泛应用于生命科学研究、诊断检测和生物医药等领域。

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