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质粒DNA纯化迷雾重重,这些关键要点你知晓几何?

来源:翌圣生物科技(上海)股份有限公司 更新时间:2025-10-15 16:30:19 阅读量:93
导读:质粒DNA纯化迷雾重重,这些关键要点你知晓几何?

什么是质粒纯化?

质粒纯化又称为质粒分离或质粒 DNA 分离,是指从细菌细胞中提取和纯化质粒 DNA,使科研人员获得高度浓缩和纯化的质粒形式,以便进一步分析和实验。质粒纯化的关键步骤通常包括细菌细胞裂解、去除细胞碎片、结合质粒 DNA、清洗、洗脱质粒 DNA 以及根据下游应用的可选附加步骤。


为什么质粒纯化如此重要?

质粒纯化至关重要,因为质粒DNA(pDNA)是基因工程中的基础工具,支持克隆、基因表达研究和治疗开发等应用。高质量的质粒DNA对于确保关键下游项目(如疫苗生产、细胞和基因治疗)的准确性和可靠性至关重要,有助于推动科学突破。


手动质粒纯化包含哪些关键步骤?

  • 收集细菌:离心20~30分钟;

  • 重悬、裂解、中和:在实验台上操作15~20分钟;

  • 澄清裂解液:使用离心机、注射器或真空装置5~10分钟;

  • 必要时,需要“去除内毒素”;结合、清洗、洗脱、沉淀:使用柱式或磁珠纯化,20~30分钟;

  • 重悬于溶液中:在实验台上操作5~10分钟。


质粒纯化考虑的因素?

质粒纯化有两个主要考虑因素:制备规模和纯度等级。这两者直接影响到下游应用的成功与否。从小规模研究到大规模治疗生产,常规的分子实验,一般对内毒素没有严格要求,转染实验对内毒素含量有要求,这些因素以及适当的纯度/内毒素水平——有助于确保获得适量的质粒DNA,从而实现可靠且可重复的预期结果。


质粒生长培养基如何选择?

质粒有不同的大小,包括小型(1–10 kb)、中型(10–50 kb)和大型(>50 kb)。质粒生长培养基,如LB肉汤、Terrific Broth (TB)、SOC培养基和2xYT,对于培养含有质粒的细菌细胞至关重要。这些营养丰富的培养基可以提高质粒产量,尤其对于大型质粒,优化细菌生长条件,并提高转化效率。


如何根据菌液量选择质粒提取试剂盒?

根据不同的菌液量,质粒提取试剂盒有小提,小中提,中提,大提;这些试剂盒又分为去内毒素和不去内毒素提取。



质粒提取的纯度和内毒素等级有哪些?

  • 分子级:提供了速度和成本效益,使其非常适合克隆、核酸标记、PCR 和测序等稳健应用,

  • 转染级:专为需要更高纯度和更高产量的应用而设计,例如标准细胞系的转染和体外转录

  • 高级转染:如转染敏感细胞系或体内研究,推荐采用高级转染级质粒分离技术。


质粒DNA产量低或提取失败的原因?

  • 菌种活性不佳:如菌种保存时间过久,质粒可能丢失,建议培养前先划线活化,以稳定产量;如大肠杆菌太陈旧(低温下长期保存的菌等),建议重新涂板培养后挑选新菌落进行液体培养; 

  • 未充分裂解细菌:细菌需充分重悬,成团的细菌会因无法裂解降低产量;

  • 裂解时间过长:导致质粒断裂,降解;

  • 质粒本身拷贝数低:载体因拷贝数差异会造成质粒产量明显的波动。高拷贝数的载体常有2-3倍的产量波动(每毫升培养过夜的菌液产量为3-16μg);长片段质粒和表达型载体常以中低拷贝数为主,每毫升菌液的产量约为0.5-2μg;低拷贝质粒可以增加起始菌液量来提高浓度;

  • 菌体中无质粒:有些质粒本身不能在某些菌种中稳定存在,经多次转接后有可能造成质粒丢失。


质粒转染后细胞出现死亡或转染效果差,从质粒本身分析,原因可能有哪些?

  • 未使用去内毒素的质粒提取试剂盒:内毒素可与质粒DNA竞争转染试剂,阻碍质粒DNA进入细胞,从而极大程度地影响转染效率;同时,由于转染试剂会使细胞膜的通透性增加,内毒素进入细胞,导致细胞活力降低甚至引起死亡,则会进一步影响转染效率。建议选用添加有高效含内毒素清除因子的质粒提取试剂,以高效清除提取质粒中残存的内毒素。翌圣生物MolPure Endo-free Plasmid Maxi Kit V2 无内毒素质粒大量提取试剂盒V2(19037ES),提取质粒内毒素水平 <1 EU/μg,可大幅提升细胞转染的效率。

  • 质粒纯度不够:在常规质粒提取试剂中,碱裂解法最为常用,但要注意其操作过程中,动作必须尽量温和,否则基因组DNA会由于剧烈操作而被破坏成小片段,在中和过程中被复性,保留在上清中随质粒DNA一同被回收,不仅会导致分光光度计测定的质粒DNA浓度值虚高、影响质粒提取的纯度,还会影响后续的转染效率。因此,质粒提取后进行琼脂糖凝胶电泳就显得非常有必要,可检测质粒中是否含有残留的基因组DNA或RNA,便于研究者对质粒质量有更好的把控。


产品应用




翌圣生物


翌圣生物科技(上海)股份有限公司成立于2014年,是一家聚焦生命科学产业链上游核心原料,从事核苷酸、蛋白、细胞和类器官四大品类生物试剂的研发、生产与销售的高新技术企业。公司兼备核心技术自主研发和规模化生产能力,核心产品数量达数千种,覆盖分子克隆、qPCR、NGS、体外转录、抗体、蛋白纯化及分析、细胞培养、转染、报告基因检测和类器官等多种系列,广泛应用于生命科学研究、诊断检测和生物医药等领域。


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