流式细胞计数具有高度的敏感性，可同时对目的菌进行定量和定性的检测。目前，流式细胞术以其高速、高灵敏度已经广泛应用于食品中各种病原性致病菌的快速检测，尤其是食品中的大肠杆菌的检测已经被FDA 列为食品安全的常规检测。