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如何选择用同源保守序列设计引物扩增DNA还是用RACE扩增DNA

panyu1112 2015-11-17 07:26:03 440  浏览
  • 我通过转录组测序得到的基因序列ORF是不完整的。看到网上有人说可以通过 Blast找到和序列相似的其他物种的序列,通过序列比对找到保守区,在保守区设计引物就可以扩增DNA.还有人说ORF不完整要设计3”5“的引物通过RACE先将3”端5“端扩增出来拿到完整序列。我... 我通过转录组测序得到的基因序列ORF是不完整的。看到网上有人说可以通过 Blast找到和序列相似的其他物种的序列,通过序列比对找到保守区,在保守区设计引物就可以扩增DNA.还有人说ORF不完整要设计3”5“的引物通过RACE先将3”端5“端扩增出来拿到完整序列。我该做那一步呢,刚开始做,实验小白,求指教 展开

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全部评论(1条)

  • George926798 2015-11-18 00:00:00
    用RACE扩增要还一些,用保守序列扩增一个问题是保守区位置不好,扩增后任然不是基因全长,第二个你是新手保守序列设计引物不一定能设计到合适的引物。

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如何选择用同源保守序列设计引物扩增DNA还是用RACE扩增DNA
我通过转录组测序得到的基因序列ORF是不完整的。看到网上有人说可以通过 Blast找到和序列相似的其他物种的序列,通过序列比对找到保守区,在保守区设计引物就可以扩增DNA.还有人说ORF不完整要设计3”5“的引物通过RACE先将3”端5“端扩增出来拿到完整序列。我... 我通过转录组测序得到的基因序列ORF是不完整的。看到网上有人说可以通过 Blast找到和序列相似的其他物种的序列,通过序列比对找到保守区,在保守区设计引物就可以扩增DNA.还有人说ORF不完整要设计3”5“的引物通过RACE先将3”端5“端扩增出来拿到完整序列。我该做那一步呢,刚开始做,实验小白,求指教 展开
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