Small RNA,是长度大约在18-30 nt的非编码RNA分子,包括miRNA、siRNA、piRNA、snoRNA、rasiRNA等,其中很多种类是生命活动重要的调控因子,通过靶向沉默与降解与之结合的靶基因在基因表达调控、生物个体发育、代谢与疾病的发生等生理过程中起重要作用。
由于miRNA基因数量多,表达量丰富,所以进行small RNA测序出来的数据中miRNA占主要地位,目前研究最广的也是miRNA,而其他small RNA的研究分析较少。
miRNA在细胞核内经过剪切形成pre-miRNA。在细胞核外剪切形成成熟体miRNA。miRNA发挥功能是在细胞核外(与mRNA翻译一致,mRNA在核内转录,且在核内进行加工形成成熟的mRNA,成熟的mRNA释放到胞质中,有一些被mRNA调控后抑制或者降解而不能翻译,没被调控的mRNA会在核糖体上翻译成蛋白,最终呈现出物种的不同表型)。
翌圣Small RNA建库试剂盒介绍
Hieff NGS Small RNA Library Prep Kit for llumina建库试剂盒,是适用于Illumina测序平台的Small RNA文库构建专用试剂盒。适用于动、植物细胞/组织分离纯化的Small RNA,以及其他类型总RNA(如外泌体总RNA)的小RNA文库构建。
适合动物、植物和组织等不同样本分离纯化的10~1 μg的small RNA。
适合不同样本提取的100 ng~4 μg总RNA。
磁珠分选试剂盒,免凝胶回收。
即用型试剂盒:试剂盒中含建库所需的磁珠和接头,无需准备除酒精和样本以外的其他试剂。
适配自动化移液工作站建库。
Small RNA建库应用
small RNA适合生命体生长发育等各个阶段、部位或方面的研究。
植物方向:植物对环境的适应性、突发、个体发育、遗传性状。
动物方向:农艺性状、适应性、个体发育、遗传性状、药物干预模式动物调控机制。
真菌方向:机理性、应用性、药用食用性研究。
肿瘤标志物:miRNA评估癌症患者的发展、进展、预后、诊断和治疗反应。
Small RNA数据展示
100 ng~4 μg Total RNA建库数据展示
用鼠心脏、肝脏、肺组织以及293细胞提取的total RNA按照Hieff NGS Small RNA Library Prep Kit for llumina试剂盒进行small RNA建库,最终能得到单一条带,且文库浓度和峰型都符合small RNA文库特征。
图.鼠心脏、肝脏、肺组织以及293细胞提取的total RNA的100 ng~4 μg Total RNA建库数据展示
small RNA推荐投入量1 μg~10 ng的small RNA投入的建库数据展示
用鼠肝样本提取的small RNA直接投入,按照Hieff NGS Small RNA Library Prep Kit for llumina试剂盒进行small RNA建库,最终能得到单一条带,且文库浓度和峰型都符合small RNA文库特征。
图.鼠肝脏提取的small RNA的10 ng~1 μg Small RNA建库数据展示
miRNA小知识
miRNA特征
miRNA无开放阅读框且表现出进化上的保守性,由含有发夹结构的前体剪切加工而来,通常其前体的自由能比较低(基本命名miR-1,miR-172这样,在不同物种中,名称都是一样的,后面的编号是由miRNA注册数据库按顺序指派。miRNA家族命名为miR375a,miR375b等。如果miRNA多拷贝,则命名miR-281-1、miR-281-2)。
成熟的miRNA长度为19~25 nt,5’端带有磷酸基团且多为尿嘧啶核苷酸,3’端带有羟基,因而miRNA能与大多数寡核苷酸和功能RNA的降解片段区分开来。
大多数miRNA呈现出组织特异性表达和发育阶段特异性表达的特点,且具有调控自身转录的机制。
miRNA基因以单拷贝、多拷贝或基因簇的形式广泛存在于真核生物基因组中,且大部分位于基于间隔区,也有相当一部分位于编码蛋白基因的内含子中。
miRNA调控机制
miRNA介导mRNA的翻译抑制
动物miRNA与靶mRNA的3’-UTR部分序列反向互补结合,而这种结合基本上不是完全匹配的从而导致靶标mRNA翻译表达受影响,但是该影响是可逆的。
miRNA介导mRNA的特异性切割
植物miRNA与靶序列的ORF近乎完全匹配。在植物中,miRNA主要通过介导mRNA的特异性切割来实现对基因进行调控。
miRNA介导mRNA的快速脱腺苷酸化
mRNA转录后通过polyA尾的添加来维持稳定性而不被降解。有些miRNA能促进mRNA的polyA尾的去除而导致其降解。
产品推荐
货号 | 名称 | 规格 |
12342ES | Hieff NGS? Small RNA Library Prep Kit for llumina | 8 T/24 T/96 T |
12642ES | 1× dsDNA HS Assay Kit 即用型dsDNA qubit定量试剂 | 100 T/500 T |
19331ES50 | MolPure? Cell/Tissue miRNA Kit 细胞/组织miRNA提取试剂盒 | 50 T |
19332ES50 | MolPure? Serum/Plasma miRNA Kit 血清/血浆miRNA提取试剂盒 | 50 T |
翌圣生物
翌圣生物科技(上海)股份有限公司成立于2014年,是一家聚焦生命科学产业链上游核心原料,从事核苷酸、蛋白、细胞和类器官四大品类生物试剂的研发、生产与销售的高新技术企业。公司兼备核心技术自主研发和规模化生产能力,核心产品数量达数千种,覆盖分子克隆、qPCR、NGS、体外转录、抗体、蛋白纯化及分析、细胞培养、转染、报告基因检测和类器官等多种系列,广泛应用于生命科学研究、诊断检测和生物医药等领域。
全部评论(0条)
梯度PCR仪(单模块) NA-1梯度PCR仪 80490ES
报价:面议 已咨询 128次
梯度PCR仪(双模块) NA-2双槽梯度基因扩增仪(80491ES)
报价:面议 已咨询 152次
32通道自动化核酸提取仪 Auto-Pure32A核酸提取纯化仪(80500ES)
报价:面议 已咨询 143次
48通道自动化核酸提取仪 AP-48核酸自动制备系统(80511ES)
报价:面议 已咨询 121次
96通道自动化核酸提取仪 AP-96N核酸自动制备系统(80510ES)
报价:面议 已咨询 128次
Celemetor实时荧光定量PCR分析Block/Tube双操作系统(80520ES)
报价:面议 已咨询 119次
梯度PCR基因扩增仪(单模块) ES-PCR96-1梯度PCR基因扩增仪
报价:面议 已咨询 134次
翌圣ES-PC30微孔板离心机 可调节转速离心机
报价:面议 已咨询 121次
①本文由仪器网入驻的作者或注册的会员撰写并发布,观点仅代表作者本人,不代表仪器网立场。若内容侵犯到您的合法权益,请及时告诉,我们立即通知作者,并马上删除。
②凡本网注明"来源:仪器网"的所有作品,版权均属于仪器网,转载时须经本网同意,并请注明仪器网(www.yiqi.com)。
③本网转载并注明来源的作品,目的在于传递更多信息,并不代表本网赞同其观点或证实其内容的真实性,不承担此类作品侵权行为的直接责任及连带责任。其他媒体、网站或个人从本网转载时,必须保留本网注明的作品来源,并自负版权等法律责任。
④若本站内容侵犯到您的合法权益,请及时告诉,我们马上修改或删除。邮箱:hezou_yiqi
BGU-LED-IMH倒置荧光模块升级优化
参与评论
登录后参与评论