一文解读——如何高效完成宿主细胞DNA残留检测
宿主细胞残留DNA是影响生物制品安全性的关键因素之一,它不仅会降低生物药的有效性,还可能带来传染性或致瘤性等安全问题。因此建立合适的宿主细胞残留DNA检测方法有助于监测生产工艺,确保生物制品的安全性和质量。在整个生产过程中,这种杂质会在以下几个步骤中发生(图1)。
(图一)生物制品研发生产过程中对于宿主细胞残留检测涉及的环节
各国药品监督管理机构对宿主细胞残留DNA的残留量有着严格的限度控制,因此都相继出台了有关生物制品中宿主细胞残留DNA的指南。其中,定量PCR法是中国2019年国家药典委员会确认的外源性DNA残留测定方法[1],也是新版USP中推荐生物制品中宿主残留DNA的检测标准方法。
本文测试的Applied Biosystem resDNASEQ残留DNA定量试剂盒通过精确的qPCR手段可检测多个宿主细胞背景,但仍需要连续稀释和相对较大的反应体积(30ul),尤其是多次移液工作中枪头液体残留会造成试剂的大量浪费。
为满足研究学者们对实验自动化以及高质量数据日益增长的需求,可以通过使用精确的移液新科技来改进此类工作流程 。本次引入的qPCR体系构建的新方法主要依靠无接触式纳升移液器Echo(原理如图二所示)提供的精确声转移能力,大大提高残余宿主细胞DNA检测工作流程,同时降低试剂耗材成本、提升实验效率。
1、无接触试微量移液原理展示:
(图二)声波移液——声能转换器位于母板孔下方,向待转移液体的液面发射聚焦声能, 精 准地将体积为2.5nL或25nL的液滴流(取决于使用设备型号)转移至倒置的目标微孔板中。
2、体系构建试剂配比(6倍缩小原体系)
(表三)resDNASEQ定量试剂盒两种不同稀释试剂盒检测CHO细胞的DNA直接稀释方案。
缩小反应体系后,使用resDNASEQ定量CHO试剂盒,使用两种不同的稀释液(92pg/nl、0.92pg/nl)进行CHO细胞测试的DNA直接稀释。
3、操作步骤与分析
Echo声学移液完成后,用Bio-Rad Microseal‘C’PCR密封每个PCR板板密封膜。然后以2000RPM对板进行短暂涡旋15秒。涡旋后,将板以1000xg离心2分钟,并立即放入Roche Lightcycler 480 II中。热循环运行完成后,使用Roche LightCycler 480软件进行分析。使用绝 对定量二阶导数算法完成分析。随后将CP值导入Graphpad Prism进行进一步分析和可视化。
(表四)Roche LightCycler 480 扩增程序
4、实验结果
(图五)qPCR 检测结果展示
A:每个样品做了三个重复,使用Echo 655T将样本转移到resDNASEQ试剂中,显示了多个数量级的结果,证明了再现性。每个反应的DNA投入量以皮克为单位标注在曲线上。
B:当CP值相对于DNA量绘制在半对数图,线性关系R2为0.9884的。各点之间的平均CP CV%为0.74%。
无接触式纳升移液器Echo以无接触方式对DNA残留进行qPCR试剂的低体积分配,可以快速分配和组装,节省实验耗材的同时满足复杂基因工程工作流程的需求,该方案的具体优势还包括:
缩小6X以上的qPCR试剂成本。
全流程移液无需移液枪头,减少耗材成本。
500-700次/秒的超快速移液,提高实验效率。
直接稀释,与液体无任何物理接触,减少交叉污染。
注:测试使用的仪器试剂材如下表
以上方案仅科研使用,不适用于临床诊断。
● 参考资料:
[1] 国家药典委员会. (2019). 关于通则3407外源性DNA残留量测定法第三法的公示[2022-04-04].
https://www.chp.org.cn/gjyjw/swzp/4914.jhtml.
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