
- 2025-01-10 17:02:53非靶标代谢组学技术
- 非靶标代谢组学技术是一种无预设目标地全面分析生物体内小分子代谢物的方法。该技术通过高通量检测手段,如质谱、核磁共振等,对生物样本中的代谢物进行定性和定量分析,揭示生物体的代谢状态及变化规律。非靶标代谢组学能够发现与表型相关的未知代谢物,为疾病诊断、药物研发及生物标志物筛选等领域提供重要信息。该技术具有高通量、高灵敏度和广泛代谢物覆盖等优势。
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- 通过对不同进化家系、不同血清型菌株的代谢轮廓进行分析,探究菌株代谢产物和表型差异特征相关性,来了解非靶标代谢组学技术的实际应用。
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非靶标代谢组学技术问答
- 2023-02-23 15:23:03科研加油站 | 代谢组学全剖析 — 从流程、应用到数据处理一次搞定!
- 作为一种在分子水平研究复杂体系变化的方法学,代谢组学经过20余年的发展已经日益完善。从传统的研究方向(生命科学领域)扩展到传统医药研究、微生物代谢研究、暴露研究、食品研究、材料科学等诸多研究领域。2023年2月23日,沃特世将举办主题为“科研加油站|代谢组学全剖析 — 从流程、应用到数据处理一次搞定!”的网络讲座。本次讲座将重 点介绍沃特世代谢组学方案流程、特点及其最 新应用。届时将邀请从业15年的应用工程师现场演示代谢组学数据处理的完整过程,干货满满,现在就扫描下方二维码报名吧!扫描上方二维码,立刻报名通过本次讲座,您可以:了解代谢组学的基本流程、最 新技术及应用进展;观摩数据处理的完整过程。日程安排14:00 - 14:40沃特世代谢组学解决方案基础流程|技术进展|最 新应用芦勤玮沃特世应用科学家14:45 - 15:15代谢组学数据处理演示Progenesis QI数据处理软件|EZinfo多元统计分析软件贾晓飞沃特世应用科学家
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- 2021-07-06 23:39:18荧光寿命成像助力攻克癌症热点靶标——四链DNA结构
- 1953年,科学家詹姆斯-沃森和弗朗西斯-克里克发现了DNA分子的双螺旋结构,遗传学的研究进入到分子层次,人们可以更深层的了解遗传信息的构成和传递途径(图1A)。近年,科学家在人类癌症细胞中发现一种四重螺旋体DNA分子——G-四链体(G-quadruplex)。它是由富含串联重复鸟嘌呤(G)的DNA或RNA折叠形成的高级结构。G-四分体(G-quartet)是四链体的结构单元,由Hoogsteen氢键连接4个G形成环状平面,两层或以上的四分体通过π-π堆积形成四链体(图1B)。 有研究表明,G-四链体更多的出现在癌细胞等快速分裂的细胞中,与癌基因的启动子区域和DNA链的端粒区域相互作用。因此,G-四链体结构与DNA复制过程有着紧密联系,对于细胞分裂和增殖非常关键[1]。那么,通过靶向调控G-四链体结构将有望成为选择性YZ癌细胞增殖的新途径,G-四链体也成为了癌症ZL药物的重要靶标。图1.A:James Dewey Waston(左)& Francis Harry Compton Crick(右)B:G4-DNA的3D结构鉴于G4-DNA参与到很多生物过程当中,开发用于检测和可视化细胞中 G4-DNA 结构的工具也尤为重要。伦敦帝国理工学院的研究人员开发了一种能够在活细胞中检测G4-DNA的荧光探针——DAOTA-M2,为人们揭开了这种结构的神秘面纱 [2]。 这种探针具备良好的活细胞渗透性和低细胞毒性,在与G4-DNA结合时会发出荧光,可以用来观察G4-DNA是如何与活细胞内的其他分子相互作用的。并且当DAOTA-M2与不同的核酸拓扑结构结合时,将显示出不同的荧光寿命信息,进而可以区别双螺旋DNA和G4 DNA(图2),因为与四链体结合时荧光寿命更长(图3)。图2. 荧光寿命置换测定的示意图:竞争对手结合后,DAOTA-M2 从 G4-DNA 转移到 dsDNA环境,导致其荧光寿命缩短图3 DAOTA-M2染色的活细胞U2OS细胞核DNA的FLIM分析(a)以 512 × 512 分辨率(λex=477 nm,λem=550–700 nm)记录的荧光强度图像,红线表示用于 FLIM 分析的核分割(b) 来自 a 的 FLIM 图,显示在平均寿命 (τw) 9ns(红色)和 13ns(蓝色)之间(c) 平均核强度与平均核寿命(蓝点)的二维相关性(d)单个原子核的放大 FLIM 图 - 颜色代表寿命,由 9ns(红色)和 13ns(蓝色)之间的颜色梯度条定义G4-DNA的生物功能是通过动态的折叠和打开实现。在细胞内,G4-DNA可以自发折叠,但其打开是由专门的解旋酶来完成。并且在接下来的研究中,科学家发现哺乳类动物中的DNA 解旋酶 FancJ 和 RTEL1的表达量减少将会导致DAOTA-M2荧光寿命变长(图4)[3]。因此可以直接利用DAOTA-M2荧光寿命的变化监测G4-DNA在活细胞中的动态变化。图4,减少 FancJ或RTEL1 解旋酶表达如何导致更长的 DAOTA-M2 寿命 (τw)的示意图G4-DNA被认为是潜在癌症ZL药物靶点,因此评估给定的 G4-DNA靶向药物与该结构结合的能力将非常有用。通过不同处理后DAOTA-M2的荧光寿命变化,结果显示双羧酸功能化的Ni(Ni-salphen)与G4-DNA有很强的靶向结合能力,会在短时间内导致DAOTA-M2荧光寿命迅速下降。(图5)图5. 加入结合剂1-7hr的DAOTA-M2 的代表性 FLIM 成像结果(显示在 6ns(红色)和 14ns(蓝色)之间)共孵育后 使用 DMSO(对照)、Zn-salphen、Nisalphen 。比例尺:20 μm在以上的科研工作中,不难发现,JZ的检测方法是必不可少的,比如贯穿于整篇文献中的FLIM技术。FLIM(Fluorescence Lifetime Imaging,荧光寿命成像):是一种基于荧光寿命的显微成像技术,其成像结果提供像素位点的寿命信息,使得我们在荧光强度成像之外,能更加深入地对样品进行功能性测量。荧光寿命成像具有不同于荧光强度成像的众多优点,如不受荧光物质浓度、光漂白、激发光强度等因素的影响。会因为分子构象、分子间相互作用、分子微环境、生理状态等条件改变而发生变化。Leica全新STELLARIS 8 FALCON荧光寿命成像系统,搭载新一代白激光(440-790nm)以及HyD X高灵敏度专用检测器,提供超快速、多维度荧光寿命成像解决方案。 将特异性探针与FLIM相结合使用,不仅可以用来监测活细胞细胞核中G4-DNA的形成,以及判定小分子药物与G4-DNA的相互作用,还可以应用于G4-DNA靶向药物的筛选。这些信息将为癌症的诊断和ZL带来了新启示,更有助于靶向性新疗法新药物的开发。了解更多:https://www.leica-microsystems.com.cn/cn/?nlc=20201230-SFDC-011237
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- 2022-11-18 16:15:48反应离子刻蚀技术
- 反应离子刻蚀概述:反应离子腐蚀技术是一种各向异性很强、选择性高的干法腐蚀技术。它是在真空系统中利用分子气体等离子来进行刻蚀的,利用了离子诱导化学反应来实现各向异性刻蚀,即是利用离子能量来使被刻蚀层的表面形成容易刻蚀的损伤层和促进化学反应,同时离子还可清除表面生成物以露出清洁的刻蚀表面的作用。主要用于Si、SiO2、SiNx、半导体材料、聚合物、金属的刻蚀以及光刻胶的去除等,广泛应用于物理,生物,化学,材料,电子等领域。 工作原理:通常情况下,反应离子刻蚀机的整个真空壁接地, 作为阳极, 阴极是功率电极, 阴极侧面的接地屏蔽罩可防止功率电极受到溅射。要腐蚀的基片放在功率电极上。腐蚀气体按照一定的工作压力和搭配比例充满整个反应室。对反应腔中的腐蚀气体, 加上大于气体击穿临界值的高频电场, 在强电场作用下, 被高频电场加速的杂散电子与气体分子或原子进行随机碰撞, 当电子能量大到一定程度时, 随机碰撞变为非弹性碰撞, 产生二次电子发射, 它们又进一步与气体分子碰撞, 不断激发或电离气体分子。这种激烈碰撞引起电离和复合。当电子的产生和消失过程达到平衡时, 放电能继续不断地维持下去。由非弹性碰撞产生的离子、电子及及游离基(游离态的原子、分子或原子团) 也称为等离子体, 具有很强的化学活性, 可与被刻蚀样品表面的原子起化学反应, 形成挥发性物质, 达到腐蚀样品表层的目的。同时, 由于阴极附近的电场方向垂直于阴极表面, 高能离子在一定的工作压力下, 垂直地射向样品表面, 进行物理轰击, 使得反应离子刻蚀具有很好的各向异性。所以,反应离子刻蚀包括物理和化学刻蚀两者的结合。 刻蚀气体的选择对于多晶硅栅电极的刻蚀,腐蚀气体可用Cl2或SF6,要求对其下层的栅氧化膜具有高的选择比。刻蚀单晶硅的腐蚀气体可用Cl2/SF6或SiCl4/Cl2;刻蚀SiO2的腐蚀气体可用CHF3或CF4/H2;刻蚀Si3N4的腐蚀气体可用CF4/O2、SF6/O2或CH2F2/CHF3/O2;刻蚀Al(或Al-Si-Cu合金)的腐蚀气体可用Cl2、BCl3或SiCl4;刻蚀W的腐蚀气体可用SF6或CF4;刻蚀光刻胶的腐蚀气体可用氧气。对于石英材料, 可选择气体种类较多, 比如CF4、CF4+ H2、CHF3 等。我们选用CHF3 气体作为石英的腐蚀气体。其反应过程可表示为:CHF3 + e——CHF+2 + F (游离基) + 2e,SiO 2 + 4F SiF4 (气体) + O 2 (气体)。SiO 2 分解出来的氧离子在高压下与CHF+2 基团反应, 生成CO ↑、CO 2↑、H2O ↑、O F↑等多种挥发性气体。对于锗材料、选用含F 的气体是十分有效的。然而, 当气体成份中含有氢时, 刻蚀将受到严重阻碍, 这是因为氢可以和氟原子结合, 形成稳定的HF, 这种双原子HF 是不参与腐蚀的。实验证明, SF6 气体对Ge 有很好的腐蚀作用。反应过程可表示为:SF6 + e——SF+5 + F (游离基) + 2e,Ge + 4F——GeF4 (挥发性气体) 。 设备:典型的(平行板)RIE系统包括圆柱形真空室,晶片盘位于室的底部。晶片盘与腔室的其余部分电隔离。气体通过腔室顶部的小入口进入,并通过底部离开真空泵系统。所用气体的类型和数量取决于蚀刻工艺;例如,六氟化硫通常用于蚀刻硅。通过调节气体流速和/或调节排气孔,气体压力通常保持在几毫托和几百毫托之间的范围内。存在其他类型的RIE系统,包括电感耦合等离子体(ICP)RIE。在这种类型的系统中,利用RF供电的磁场产生等离子体。虽然蚀刻轮廓倾向于更加各向同性,但可以实现非常高的等离子体密度。平行板和电感耦合等离子体RIE的组合是可能的。在该系统中,ICP被用作高密度离子源,其增加了蚀刻速率,而单独的RF偏压被施加到衬底(硅晶片)以在衬底附近产生定向电场以实现更多的各向异性蚀刻轮廓。 操作方法:通过向晶片盘片施加强RF(射频)电磁场,在系统中启动等离子体。该场通常设定为13.56兆赫兹的频率,施加在几百瓦特。振荡电场通过剥离电子来电离气体分子,从而产生等离子体 。在场的每个循环中,电子在室中上下电加速,有时撞击室的上壁和晶片盘。同时,响应于RF电场,更大质量的离子移动相对较少。当电子被吸收到腔室壁中时,它们被简单地送到地面并且不会改变系统的电子状态。然而,沉积在晶片盘片上的电子由于其DC隔离而导致盘片积聚电荷。这种电荷积聚在盘片上产生大的负电压,通常约为几百伏。由于与自由电子相比较高的正离子浓度,等离子体本身产生略微正电荷。由于大的电压差,正离子倾向于朝向晶片盘漂移,在晶片盘中它们与待蚀刻的样品碰撞。离子与样品表面上的材料发生化学反应,但也可以通过转移一些动能来敲除(溅射)某些材料。由于反应离子的大部分垂直传递,反应离子蚀刻可以产生非常各向异性的蚀刻轮廓,这与湿化学蚀刻的典型各向同性轮廓形成对比。RIE系统中的蚀刻条件很大程度上取决于许多工艺参数,例如压力,气体流量和RF功率。 RIE的改进版本是深反应离子蚀刻,用于挖掘深部特征。
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- 2023-07-03 13:26:49纤维素测定仪技术特点
- 纤维素测定仪技术特点: 1.可同时处理3个样品 2.样品量:0.5-3g 3.重现性:
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- 2024-10-28 15:39:48便携式色谱仪有哪些基本原理和技术?
- 一、便携式色谱仪的基本构造与原理便携式色谱仪是一种集成化高、结构紧凑的分析仪器,能够快速检测样品中的化合物。它通常由进样系统、色谱柱、检测器和数据处理系统等部分组成。设备通过气体或液体将样品带入色谱柱中二、便携式色谱仪的应用领域环境监测在环境保护方面,便携式色谱仪被广泛用于检测空气、水体和土壤中的污染物。其快速的检测速度和便携的特性,使得工作人员可以在污染源头直接获取数据,及时发现问题,避免污染物进一步扩散。食品安全检测在食品安全领域,便携式色谱仪主要用于检测食品中的农药残留、添加剂以及其他有害物质。设备不仅可以在现场检测,提高检测效率,减少运输样品带来的时间延迟,同时保证样品的原始状态,提升检测结果的准确性。医药行业应用 医药行业对化学成分的精确分析需求很高,便携式色谱仪能够在现场快速分析药品中的有效成分和杂质含量,提高药品研发、生产及质量检测的效率。便携式色谱仪在临床诊断中也得到了应用,帮助医生进行即时的药物代谢分析,为临床决策提供数据支持。图片中展示了仪器在医药实验室和医疗现场的应用场景,直观展现了便携式色谱仪的多样化用途。化工行业的质量控制化工企业中,便携式色谱仪能够实时监测生产流程中的化学成分,保证产品质量的一致性。便携式色谱仪的快速响应能力,使得企业可以在短时间内完成质量检查三、便携式色谱仪在使用中的优势便携式色谱仪与传统的台式色谱仪相比,具有无可替代的优势。其便携性使得设备可以用于多种现场分析需求,如紧急事故、流动检测等。由于其集成化设计,便携式色谱仪的操作更为简单,通常只需经过短时间培训即可上手。便携式色谱仪还具备快速检测的能力,有助于减少传统实验室检测所需的等待时间,极大提升了效率。其小型化的结构不需要复杂的电源支持,通常由电池驱动,适合长时间户外使用。四、便携式色谱仪选购与使用建议对于用户来说,选择合适的便携式色谱仪至关重要。要根据具体需求选择合适的色谱柱和检测器,确保设备能够高效分离和检测目标化合物。应关注设备的检测精度、响应时间和电池续航能力,保证仪器在不同环境下的可靠性。
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