- 2025-01-10 17:03:03寡核苷酸纯度分析
- 寡核苷酸纯度分析是评估寡核苷酸样品质量的关键步骤。它主要通过高效液相色谱(HPLC)、电泳或质谱等方法进行。这些技术能分离并量化样品中的不同组分,包括全长产物、缺失或添加碱基的产物、盐类及其他杂质。纯度分析结果有助于确保寡核苷酸用于实验时的准确性和可靠性,对基因研究、药物开发等领域至关重要。
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寡核苷酸纯度分析问答
- 2020-10-21 15:47:53冷媒纯度分析检测仪可以检测下列哪些项目?
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- 2020-12-15 17:10:15寡核苷酸类药物的HPLC分析 (二) TSKgel SEC色谱柱应用例
- 上篇文章《寡核苷酸类药物的HPLC分析 (一) TSKgel IEC色谱柱应用例》中我们提到了随着寡核苷酸药物的研发步伐越来越快,对高纯度寡核苷酸产品的需求也日趋旺盛。目前,寡核苷酸主要是通过化学合成法制成,在合成过程中会产生工艺相关杂质和产品相关杂质,离子交换液相色谱法是分析这些杂质的重要手段之一。此篇文章我们将介绍尺寸排阻色谱法在寡核苷酸药物质量控制中的应用。在寡核苷酸的分析中,尺寸排阻分离模式是基于碱基数量、磷酸基不同导致的分子量差别进行分离,通常用于简单的质量控制或纯度研究。该模式的优点是可以使用接近生理条件的洗脱溶液进行等度分离。有时也会添加水溶性有机溶剂来YZ疏水吸附。分析不同碱基数目的寡核苷酸下图是采用两根串联的SEC色谱柱TSKgel UP-SW2000来区分长度相差一个碱基的寡核苷酸混合物 (20-mer和N-1 19-mer)。TSKgel UP-SW2000是东曹生命科学ZX开发的粒径2μm、孔径12.5nm的硅胶基质SEC色谱柱,主要用于分离分子量范围为1-150kDa的小蛋白、肽和寡核苷酸等生物分子。该色谱柱兼容HPLC和UHPLC系统,因此也能够从传统的HPLC-SEC方法转换到UHPLC。下图是使用TSKgel G2000SWXL色谱柱分离不同碱基数量的合成寡核苷酸混合物的谱图。为了YZ核酸酶活性,有时会在流动相中添加EDTA等约1 mmol/L的螯合剂。SEC法分离脂质体包被的siRNA下图是使用TSKgel SuperSW2000色谱柱对天然型DNA核酸药物Defitelio进行质量分析的示例。参考文献:Handbook of analysis of oligonucleotides and related Products, Feb.23 (2011) 125, Edited by J.V. Bonilla et al.寡核苷酸分析用SEC色谱柱下表中列出了适用于核酸分离的SEC色谱柱。对于<375 bp的短链核酸或寡核苷酸,UP-SW3000、UP-SW2000、G3000SWXL以及G2000SWXL这几款色谱柱都是比较推荐的。
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- 2020-12-15 16:52:34寡核苷酸类药物的HPLC分析 (一) TSKgel IEC色谱柱应用例
- 概述寡核苷酸是一类只有50个以下碱基的短链核苷酸的总称(包括脱氧核糖核酸DNA或核糖核酸RNA的核苷酸)。近几年,随着寡核苷酸疗法在ZL各种疾病适应症方面取得了临床上显著的进展,已有多种寡核苷酸类药物,如小干扰RNA (siRNA) 和反义寡核苷酸 (ASO) 药物获得了FDA上市批准。另外还有多种microRNA (miRNA) 和适配体 (Aptamer) 正在研发中。因此,更大量、更高纯度的寡核苷酸产品的需求也随之日益增长。东曹生命科学提供多种具有高分辨率、选择性的色谱柱和层析填料产品以满足从分析到纯化制备不同规模的应用需求。寡核苷酸的HPLC分离模式下表中列举了寡核苷酸HPLC分析的几种分离模式及适用的分离条件。也可以通过连用MS进行检测。ZL性寡核苷酸是由固相化学合成法制成。在合成过程中会产生工艺相关杂质和产品相关杂质。产品相关杂质包含许多目标产物的类似物(分子量的差别:碱基数n-1、n、n+1等),磷酸基S化等的不对称化合物、异构体等。因此,杂质的分析监控对工艺和质量控制就显得十分重要。一般而言,通过阴离子交换色谱法即可实现这一分析需求。寡核苷酸IEC-HPLC分析下图是使用TSKgel DNA-STAT阳离子交换色谱柱分离具有不同序列的4种寡核苷酸引物 (单链) 。在IEC分离模式中,如果使用无孔填料的色谱柱可以提高分辨率。此款色谱柱采用的是亲水性无孔树脂填料,粒径5μm,表面由开放型多层阴离子交换基团构成。这些特性与创新的化学键合方法相结合,使其载量更高、操作压力更低,非常适合于寡核苷酸的高分辨率分析。寡核苷酸的纯度检测在离子交换色谱柱中,可以对离子基团与主成分有一处不同的化合物进行分离,比如能够分离n-1、n、n+1的化合物。下图是TSKgel DNA-NPR阳离子交换色谱柱对13个碱基的硫代磷酸寡核苷酸粗样分析的色谱图。TSKgel DNA-STAT色谱柱对粗制的寡核苷酸与纯化后的样品进行纯度评估。寡核苷酸的分析要点1、根据核酸样品的稳定性和大小来选择合适的洗脱液。如果核酸的稳定性很高,可以采用碱性溶液 (NaOH,pH12) 和高温60℃条件下分离,可提高分辨率。如果是稳定性差的,则推荐使用pH7-8的中性洗脱液,温度40℃条件下分离。2、在样品吸附强的情况下,可使用比NaCl或NaBr洗脱能力更强的NaClO4进行梯度分离。3、如果样品是超巨大双链DNA (如质粒DNA),使用TSKgel DEAE-NPR (4.6mm I.D.×3.5cm) 的话不仅可以获得高分辨率,而且回收率也会更好。
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