DRUG-seq技术介绍
DRUG-seq(Digital RNA with pertUrbation of Genes)是一种mRNA 3’端测序技术,通过特异性靶向poly-A尾,实现样本裂解液中的mRNA直接反转录。由于其仅聚焦转录本的3’序列,测序数据只需 2M/样本。该技术采用Barcoded 标签可实现多样本混合构建文库,而每个序列的UMI可以捕获的mRNA序列进行精确定量,降低PCR扩增带来的数据偏差。可广泛用于干细胞诱导分化、类器官、细胞培养方法开发、新药筛选、肿瘤标记物发现等领域。
DRUG-seq技术应用
DRUG-seq技术通过检测药物处理后的细胞表达谱之间的比对,为疾病和药物、药物与药物之间找到了基于基因signature相似性所构建的关系桥梁。
DRUG-seq不仅能够识别出对于某类疾病有调控功效的活性药物分子,而且还可以通过基因功能分析发现药物主要调控的分子机制,并且在多种基因分子网络层面的数据比较更加系统和准确。临床试验前阶段,DRUG-seq还可帮助药物药效、药理和动力学分析。
DRUG-seq技术在老药新用、中药复方有效成分筛选、药物靶标发现等方面的应用均具有广阔前景。在中药研究中,还可评估多种中药单体或组分的作用情况。
DRUG-seq研究内容
确定化合物作用机理:验证已知靶点化合物作用机理,或推测未知靶点化合物的可能的作用机理。
研究不同化合物对间接靶点的剂量动力学差异。
评估不同化合物引起的生物功能差异。
评价化合物作用于非靶基因引起的生物功能等。
翌圣生物推出DRUG-seq建库试剂盒:Hieff NGS HTP OneStep RNAseq Kit 高通量一步法 RNA 建库试剂盒。该试剂盒将逆转录(RT)和 PCR 扩增步骤进行合并,在高通量 PCR 板中进行一步法操作(One Step),高效获得各孔中的 cDNA 分子,然后将每孔的 cDNA 混合纯化,可构建成一个含多种药物化合物处理信息的混合 RNA-seq 文库。NGS 测序后,可根据孔标签(Well Barcode)信息拆分出不同药物处理的转录本信息。样本无需纯化,直接细胞投入,减少了人工操作。搭配自动化过程,大大减少了人工消耗,同时能提供药筛效率。药筛研究助力,永远快人一步。
试剂盒特点
无损直检:96孔板细胞上样,无需RNA提取过程。
通量高:一次实验,可获取96个样本的转录组建库。
起始量少:实验兼容1-1000细胞/每孔的活细胞投入,也可兼容提取好的RNA投入。
分辨率更高:相比传统药物高通量筛选技术针对于细胞表型,基于RNA测序的DRUG-seq药物筛选技术可以针对基因层面。
转录本精准定量:含UMI,可对转录本进行定量分析,定量更准确。
结果更全面:可以进行多维的药物作用信息分析,将基因差异表达分析与高标准中药复方成本鉴定相结合,解析中药复方中主要活性成分及其药效功能性机制。
试剂盒数据展示
1-96孔样本的3端转录组测序结果展示
结果上看,大多数样本无需核酸提取时进行建库,每孔样本能够拆分和定量,同时转录本个数基本超过1万以上。
产品推荐
翌圣生物
翌圣生物科技(上海)股份有限公司成立于2014年,是一家聚焦生命科学产业链上游核心原料,从事核苷酸、蛋白、细胞和类器官四大品类生物试剂的研发、生产与销售的高新技术企业。公司兼备核心技术自主研发和规模化生产能力,核心产品数量达数千种,覆盖分子克隆、qPCR、NGS、体外转录、抗体、蛋白纯化及分析、细胞培养、转染、报告基因检测和类器官等多种系列,广泛应用于生命科学研究、诊断检测和生物医药等领域。
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