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解决方案 | 生殖遗传NGS检测产品助力出生缺陷防控

来源:翌圣生物科技(上海)股份有限公司 更新时间:2024-12-25 14:39:38 阅读量:111

2024年1月开始,生殖遗传领域逐步迎来一系列里程碑事件,四篇携带者筛查领域方向的专家共识齐发,共同支持携筛的临床应用转化。多家检测公司的遗传NGS检测试剂盒相继获批上市,生殖遗传检测加速迈进“证”时代,大大拓展了NGS技术应用于产前诊断的范围,更标志着NGS技术在我国出生缺陷防控体系建设中又迈出了关键一步。

 

 

2024年1月11日,安诺优达CNV-seq产品获批,可以同时检测羊水样本中染色体非整倍体及CNV变异,填补国内空白。

 

2024年2月21日,华大基因CNV-seq羊水检测试剂盒获医疗器械注册证,继2022年CNV-Seq流产组织检测获证后持续为出生缺陷防控开启新的篇章。

 

2024年3月21日,贝瑞基因“染色体拷贝数变异检测试剂盒(可逆末端终止测序法)”获国家药品监督管理局(NMPA)批准上市。

 

2024年4月11日,杰毅麦特基于微阵列芯片技术(CMA)的染色体拷贝数变异检测试剂盒正式获批NMPA注册证。

 

 

生殖遗传NGS检测常见类别

 

类别

无创产前基因检测-NIPT

基因组拷贝数变异测序技术-CNV-seq

全外显子测序-WES

全基因组测序-WGS

胚胎植入遗传学检测检测PGT-A、PGT-M、PGT-SR

携带者筛查NGS检测

样本类型

孕妇外周血

羊水、绒毛、脐带血、流产组织、外周血

基因组DNA样本、全血、组织样本

血液、组织、羊水等

胚胎细胞,囊胚期外滋养层细胞

外周血胚胎细胞

检测范围

全染色体非整倍体

全染色体非整倍体、大片段缺失/重复及全基因组CNVs

染色体数目异常、拷贝数变异(CNV)、单个碱基的变异(SNV) 和小片段的插入/缺失变异(indel)

全染色体非整倍体家系已知单基因遗传病、染色体结构异常(易位、倒位等)

常染色体隐性遗传病、X连锁遗传病和常染色体显性遗传病。

适应症

常规产筛项目,孕妇为主

流产、死胎或死产胎儿组织需明确遗传学病因者;有介入性产前诊断指征或需求的孕妇

临床无法确诊,高度怀疑遗传病的患者;有单基因遗传病家族史的人群;具有明显家族史,但不清楚为何种疾病的患者;不明原因发育迟缓、智力低下等精神状态异常的患者;临床高度怀疑是基因突变导致的疾病

反复移流产及高龄女性夫妇双方均为同一常染色体隐性疾病的致病基因携带者等。

有亲属存在高度疑似遗传性疾病的情况;关注子代健康,有生育意愿夫妇等

 

 

 

生殖遗传NGS检测产品解决方案

 

方案1. 单细胞全基因组扩增+高效率酶切建库,助力PGT检测更精准

Hieff NGS® Single Cell/Low Input WGA Kit(Cat#12510)+Hieff NGS® C169P1 OnePot Pro DNA Library Prep Kit(Cat#13570)

 

 

性能展示:

建库试剂盒

DNA样本和投入量

建库条件

接头

循环数

12510+酶切建库13570

标准品gDNA,投入量10 pg

打断30度25 min,加A 20min,接头连接15 min

MGI UDB接头

6 cycle

性能表现

WGA试剂盒

标准品

Sample

Clean Bases(G)

Clean GC(%)

Same Reads

Map reads(%)

Dup reads(%)

CV

Depth

Coverage(%)

T*

NA12606

1

3.4558

41.6197

9540000

85.8801

5.5642

20.9322

0.1071

8.5013

C*

2

2.6162

41.929

9540000

89.4011

5.0124

17.9076

0.1076

8.4314

Y-12510

3

4.3083

41.1558

9540000

89.1818

3.1861

17.1842

0.1075

7.8237

T*

NA05966

4

2.7907

42.0496

9540000

86.7340

5.6266

20.2114

0.1069

8.4504

C*

5

3.8316

42.2515

9540000

89.9735

4.4953

17.8383

0.1076

8.4404

Y-12510

6

3.5809

40.3761

9540000

90.4066

3.2077

16.8854

0.1081

8.3008

13570常规建库

NA12606

7

3.3173

40.3008

9540000

98.7902

4.1105

20.8563

0.1139

10.4352

13570常规建库

NA05966

8

3.3623

40.0563

9540000

98.7487

3.4558

19.5305

0.1140

10.4997

 

 

 

 

方案2. cfDNA提取+高产DNA建库,实现无创产前DNA检测更高效

MolPure® Magnetic Circulating Cell-Free DNA Kit(Cat# 18382ES) + Hieff NGS® DNA Library Prep Kit(Cat#12927)

 

建库流程

 

性能展示

试剂盒

样本

实验条件

循环数

建库12927

cfDNA样本

 

投入量0.1-5 ng,搭配Illumina 长接头,接头连接后1.0×纯化,文库扩增15 cycle,扩增产物0.8/0.15×分选。

15 cycle

其他机械法建库kit

性能表现

 

方案3. 一款产品多功能,同步实现WGS、WES和CNV-seq检测

Hieff NGS® OnePot Pro DNA Library Prep Kit V3(Cat#12194)

 

 

性能展示

试剂盒

样本和投入量

实验条件

循环数

建库试剂12194

标准品:NA12878样本500 ng

打断时间15 min;接头连接后0.3/0.1×分选;扩增产物0.9 ×纯化

7 cycle

性能表现

 

 

方案4.多重PCR扩增,实现常见已知位点精准检测

2×Hieff NGS® HG Multiplex PCR Master Mix(Cat#13283)

 

操作简洁:高乘预混液包含除引物和DNA模板之外所有组分;

性能优:高均一性、高特异性和高灵敏度;

兼容广:兼容GC含量在25%-70%;

兼容多种应用场景:遗传病检测、环境微生物鉴定和食品安全检测等。

 

性能展示

试剂盒

样本

实验条件

循环数

多重试剂13283

gDNA样本

1)搭配人源10重panel,30 μl体系,评测扩增均一性情况;                            2)人gDNA 10 ng,搭配热点基因Panel 200重左右,评测测覆盖度情况。

20-30cycle

性能表现

 

 

性能展示

 

 

 

生育健康NGS检测产品选择指南

 

产品

产品名称

货号

NIPT项目

cfDNA提取

MolPure® Magnetic Cell-Free DNA Kit 磁珠法游离DNA提取试剂盒

18382ES

DNA机械法建库

Hieff NGS® DNA Library Prep Kit 2.0 全能型DNA建库试剂盒2.0

12927ES

 

单细胞全基因组扩增

Hieff NGS® Single Cell/Low Input WGA Kit

12510ES

酶切法建库

Hieff NGS® C169P1 OnePot Pro DNA Library Prep Kit

13570ES

多重PCR扩增预混液

2×Hieff NGS® HG Multiplex PCR Master Mix

13283ES

遗传病检测

血液gDNA提取

MolPure® Magnetic Blood DNA Kit 磁珠法血液 DNA 提取试剂盒

18504ES

DNA酶切建库

Hieff NGS® OnePot Pro DNA Library Prep Kit V3

12194ES

配套产品

qubit定量

1×dsDNA HS Assay Kit

12642ES

ssDNA Assay Kit

12645ES

磁珠

Hieff NGS® DNA selection Beads(Superior Ampure XP alternative)

12601ES

环化

Hieff NGS® Dual Barcode Fast-Pace DNA Cyclization Kit for MGI®

13340ES

Hieff NGS® Fast-Pace DNA Cyclization Kit for MGI® MGI测序平台单barcode环化试剂盒

13341ES

 

 

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翌圣生物科技(上海)股份有限公司是一家聚焦生命科学产业链上游核心原料,从事分子、蛋白和细胞三大品类生物试剂的研发、生产与销售的高新技术企业。核心产品覆盖qPCR系列、NGS系列、逆转录系列、核酸提取与纯化系列、PCR系列、分子克隆系列、体外转录系列、抗体、蛋白纯化系列、蛋白分析系列、重组蛋白、细胞分析系列、细胞培养系列、细胞转染系列、报告基因检测系列等多个品类,广泛应用于生命科学研究、诊断检测和生物医药等领域。

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