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重磅|斯坦福在 Nature Communications 发文:单细胞牵引力的高通量时代来了

来源:北京心动康达信息技术有限公司 更新时间:2025-11-14 17:30:21 阅读量:44
导读:斯坦福团队在 Nature Communications 发表的 CONTRAX 研究揭示了高通量精准测量心肌细胞力学的重要性,而 HCells 以此为方向,为科研者提供了一套能够获取心肌细胞多维度功能信息的实用工具。

滑到最后有彩蛋哦 

【关键词】HCells|心肌细胞|牵引力显微|CONTRAX|高通量多模态心肌细胞功能检测系hiPSC-CM
“Tracking single hiPSC-derived cardiomyocyte contractile function using CONTRAX an efficient pipeline for traction force measurement.” 这项研究来自美国斯坦福大学Beth L. Pruitt团队,于 2024 年发表在 Nature Communications。文章围绕心肌细胞牵引力测定这一核心主题,系统构建了一个名为 CONTRAX 的高通量自动化分析流程,用于精准量化 hiPSC-CM 的力学功能。研究团队通过自动化细胞识别、视频采集、位移场计算与牵引力分析,最终实现了对超过 4500 个单细胞的牵引力测定,并进一步比较了不同基底刚度、培养条件、药物处理及细胞遗传背景对心肌细胞力学行为的影响。整篇文章不仅展示了高通量牵引力测定的可行性,也强调了力学参数在药物效应分析、疾病模型验证以及细胞成熟度评估中的重要性,是近年来牵引力测定领域极具代表性的一项工作。
背景介绍
心肌细胞的核心功能是节律性收缩,而这一过程伴随的牵引力输出,是细胞生理状态最直接、最客观的物理读数。然而长期以来,牵引力显微术(TFM)虽然被认为是定量测量细胞收缩力的经典方法,但由于成像、分析与处理流程复杂,实验者通常只能在一个实验中处理几十个细胞,难以满足现代心血管研究对于大样本量、高重复性研究的需求。随着人诱导多能干细胞来源心肌细胞(hiPSC-CM)在药物筛选、毒理学、遗传疾病模型和细胞成熟度研究中的广泛应用,科研界迫切需要一种能够真正实现规模化、标准化、自动化的牵引力测定方法,用来捕捉心肌细胞在不同条件下的功能差异与异质性。基底刚度、培养体系、药物刺激、基因突变等因素都会显著影响心肌细胞的力学输出,因此大样本、高通量的测量尤为必要。在这样的背景下,斯坦福团队开发了 CONTRAX,用自动化替代手动操作,用连续成像与批量分析替代分散实验,使牵引力测定首次具备了系统化、扩展性与强统计学意义。也正因如此,这项研究不仅是技术改进,更代表了牵引力测量从传统的“低通量、点状验证”走向“规模化、系统化研究”的重要转折点。
主要结果
斯坦福团队在构建 CONTRAX 体系时,最先处理的问题是如何将传统牵引力显微术中大量依赖人工判断与手工操作的步骤,转化为可连续运行、可自动调度的高通量流程。他们从细胞定位、成像设置、时间序列采集到力学分析,重新设计了整个测量路径,使其成为一种能够在无人干预下批量处理样品的工作体系。在文章开头部分,研究者展示了完整的自动化 workflow:细胞首先通过明场成像进行识别,随后系统自动锁定单细胞区域,启动高帧率时间序列采集,并在成像结束后立即进入位移场计算与牵引力反演的模块。整个过程以连贯的方式串联起来,使得牵引力测定从原本的“分散式、多环节、易出错”转向了“流程化、精确调度、可重复性高”。

图 1|CONTRAX 工作流程示意:实现牵引力显微的自动化与高通量化

该图展示了 CONTRAX 的整体工作流程,包括自动定位心肌细胞的 Cell-Locator 模块、按细胞坐标批量采集 TFM 视频的自动成像模块,以及基于数字图像相关(DIC)和傅里叶变换牵引力计算(FTTC)的 Streamlined-TFM 分析模块。三部分既可独立使用,也可串联形成一套完整的高通量 TFM 流程,从细胞定位、视频采集到牵引力反演均实现自动化处理。系统生成的位移场、牵引应力和多种力学参数计算方法在补充材料中给出了详细说明。

在完成自动化流程构建之后,团队将这一方法应用于 hiPSC-CM 的大规模牵引力测定。为了验证这一系统在不同机械环境中的表现,他们首先选择了两种典型的基底刚度:一种是接近成人心肌组织力学环境的约 10 kPa,另一种是相对更高的 35 kPa。通过高通量采集方式,研究者获得了成千上万个心肌细胞在两种刚度条件下的时间序列力学图像,并从中提取位移场与牵引力分布。结果显示,细胞在较软的基底上往往呈现更大的位移幅度,但牵引力峰值反而不一定更高;而在较硬的基底上,细胞收缩幅度有所降低,但牵引力输出的集中度更高,更接近成熟心肌细胞的收缩模式。这一趋势在文章中以多个力学云图、时间序列曲线和统计分布的形式呈现,直观展示了不同机械环境对细胞功能输出的调控作用。

图 2|hiPSC-CM 的细胞形态特征显示群体内部显著的异质性

该图展示了研究团队如何利用微图案化基质对 hiPSC-CM 进行标准化培养,以便在一致的几何约束下观察细胞形态差异。图中首先说明了细胞从分化、培养到贴附在 ECM 微图案上的整体流程,并给出了典型的明场影像与荧光标记示例。尽管所有细胞都被限制在相同的 7:1 长宽比图案上,它们在实际铺展面积和拉长程度上仍展现出明显的个体差异,反映出 hiPSC-CM 内在的形态异质性。数据进一步显示,基底刚度、培养基成分(如 M16lac 与 M16glu)以及实验时间均会显著影响细胞铺展面积与长宽比的分布,而这种分布更符合对数正态特征而非正态分布。不同条件之间的差异通过多重统计检验得以确认,也说明即便在高度受控的微图案化环境下,细胞形态仍受到多种生物学因素调控,从而为后续功能测量(如牵引力分析)提供重要背景信息。

图 3|基底刚度显著影响心肌细胞的牵引力、收缩速度与收缩功率

该图展示了 hiPSC-CM 在不同基底刚度(10 kPa 与 35 kPa)下的力学行为差异。研究者在标准化的微图案环境中测量了大量细胞,发现无论从牵引力大小、收缩速度还是功率输出来看,细胞在 35 kPa 基底上的整体表现更强,而在 10 kPa 基底上细胞铺展面积更大但产生的峰值力较低。图中进一步显示,细胞的牵引力会随长宽比增加而上升,在约 7:1 附近达到峰值后再趋于平缓;而收缩力、收缩速度与收缩功率三者之间呈现近似幂律关系,其斜率随刚度而变化,说明机械环境在调控细胞收缩动力学中扮演关键角色。最后的雷达图综合比较了不同刚度下所有力学相关参数,清晰展示出高刚度条件下细胞整体表现更加“成熟化”和“力学化”,包括更快的收缩速度、更高的牵引力与更稳定的动力学输出。这些结果共同强调:基底刚度不仅影响细胞的形态,也深刻参与其功能调控,是研究心肌细胞收缩行为的重要实验变量。

除了机械环境的影响,研究团队进一步探索了药物对心肌细胞牵引力的调控效应。为了模拟药理刺激下的力学行为变化,他们选择了常用的心脏药物,包括正性肌力药物和负性肌力药物,并在不同药物浓度下观察细胞牵引力的动态变化。在时间序列数据中,研究者发现药物处理后的细胞收缩波形发生了显著改变:正性肌力药物会提高牵引力峰值,并加快收缩与舒张速率;而负性肌力药物则会降低峰值、拉长时程,使细胞整体呈现“疲缓”的收缩模式。文中大量时间曲线、参数统计图和力学云图共同描绘出药物作用的多维度变化,可以清晰看到力学行为如何随药物浓度递增而产生渐进式改变。特别值得注意的是,在同一药物条件下,不同细胞之间仍然存在显著的响应差异,这为后文的异质性分析埋下伏笔。

图 4|在相同基底刚度下,不同培养基条件共同决定心肌细胞的收缩力、速度与功率表现

该图比较了 hiPSC-CM 在相同的 10 kPa 基底上、但处于两种不同培养基(M16lac 与 M16glu)条件下的力学表现。结果显示,M16glu 培养基会使细胞普遍呈现更大的铺展面积和更高的长宽比,而这类形态差异进而反映到力学输出中:细胞的收缩力随长宽比增加而上升,但在两种培养条件下整体趋势一致,仅在中间区间(约 3–6 的长宽比)出现轻微差异。此外,细胞的收缩力、收缩速度与收缩功率之间依旧呈现幂律关系,在对数坐标下显示为线性分布,而培养基成分对这一关系的影响十分有限,仅在斜率上表现出极弱的差异。最后的雷达图整合了所有形态与力学指标,显示 M16glu 细胞在形态和部分动力学参数上略有增强,而 M16lac 细胞在收缩时序上更为稳定。整体而言,本图说明:在固定机械环境下,培养基成分仍能显著塑造细胞形态,并在部分维度上影响其收缩动力学,但不改变力、速度与功率之间的统一规律性。


图 5|长期培养显示:M16lac 能更好支持心肌细胞的生长与功能成熟,且在高刚度基底上优势更为明显

该图呈现了 hiPSC-CM 在 20 天培养周期内的形态与收缩功能随时间变化的规律,并对比了两种培养基(M16lac 与 M16glu)之间的显著差异。首先,在细胞存活与生长方面,气球图清楚显示 M16glu 组细胞死亡更早,尤其在较硬的 35 kPa 基底上更为明显;而 M16lac 不仅细胞存活时间更长,细胞面积也随时间呈上升趋势,显示出更持续的生长能力。其次,CONTRAX 对大量细胞的长期动力学记录表明:收缩力、细胞面积等核心指标在 M16lac 条件下随时间持续提升,而 M16glu 组的增长势头较弱,甚至出现功能停滞或下降。图中的折线、误差棒与回归趋势共同显示:无论是 10 kPa 还是 35 kPa,M16lac 均能促使细胞力学性能更稳定地向“成熟型收缩模式”演化。右侧的归一化曲线进一步揭示:在 20 天的培养过程中,两种培养基之间的功能差距会逐渐拉开,M16lac 的优势累积效应明显。最终的雷达图综合了形态、应力、动力学和时序等多维度参数,形成一目了然的对比图谱,显示 M16lac 在多数功能指标上均优于 M16glu,且与对照组(Day 20、10 kPa、M16lac)更为一致。总体来看,本图展示了一个清晰趋势:心肌细胞的长期功能成熟不仅受机械环境影响,更受到培养基代谢类型的深刻调控,而乳酸型培养基(M16lac)显然更利于 hiPSC-CM 的持续成熟化与长期稳定收缩。

在完成机械环境与药物作用的基础实验后,研究团队将分析范围进一步扩大,并深入探讨大样本量下心肌细胞功能的异质性。利用 CONTRAX 的自动化数据输出,研究者对超过 4500 个细胞的牵引力参数进行了系统统计,将每个细胞的峰值力、收缩速率、舒张速率、脉冲宽度、应变能等指标投射到多维空间,利用主成分分析(PCA)或非线性降维方法(如 UMAP)从整体分布中寻找模式。结果显示,尽管所有细胞均来自相同的 hiPSC-CM 培养体系,但每个细胞呈现出的力学行为却形成了明显的分层结构。例如,有的细胞表现出高峰值、尖锐收缩波形,类似成熟度较高的心肌细胞;而另一些细胞则表现出平缓、低幅度的力学输出,显示出较低的功能状态。文中图像展示了不同细胞群在特征空间中的分布、热图中的参数聚合模式以及波形形态的典型差异,为 hiPSC-CM 内在异质性的探究提供了直观证据。

图 6|大规模单细胞数据揭示心肌细胞的多维力学生物学异质性:八类功能表型在不同条件下各具特征

本图利用研究团队构建的超大规模 TFM 数据集(成千上万个 hiPSC-CM 单细胞)进行高维聚类分析,展示了心肌细胞在功能层面的复杂异质性。通过 X-shift KNN 密度估计算法,数据被分为八个功能表型簇,每个簇都由不同的力学与动力学参数(如收缩力、速度、应变能、时序等)共同定义。纵向跟踪数据显示,在标准条件(M16lac、10 kPa)下,单个细胞在 20 天培养过程中会沿着各自的轨迹在高维空间移动,部分细胞朝更成熟、更高力输出的方向发展,而另一些则停留在低动力学状态,体现出强烈的个体差异。进一步的参数分布比较显示,各个簇拥有截然不同的力学特征,例如部分簇以高峰值力为主导,部分簇以快速动力学为特征,也有簇表现为整体低幅度、低速度的弱收缩型状态。更值得注意的是,在第 20 天时,同一培养基(M16lac)下的细胞会因基底刚度不同而进入不同簇:10 kPa 条件主要分布在簇 2 和簇 5,而 35 kPa 则更多集中在簇 4 和簇 8,体现出刚度对力学表型分布的强力调控。但当仅比较培养基成分(M16glc vs M16lac)时,这种聚类分布差异并不显著,说明代谢环境对力学表型的影响弱于机械环境。整体而言,本图强调:在高通量数据支持下,心肌细胞的功能成熟与状态变化呈现出高度复杂的多维分布,而机械环境在塑造这些表型簇时的影响最为关键。

在此基础上,研究者进一步将牵引力测定方法应用于不同基因背景的细胞模型。通过比较健康细胞系与特定突变细胞系的收缩力模式,他们发现一些疾病相关突变会直接导致牵引力峰值下降、收缩时间延长或舒张不充分。这类细胞在时间序列波形上呈现出明显异常,例如峰形不对称、上升或下降阶段变缓、周期稳定性变差等。在图中,这些异常模式通过波形叠加、参数散点分布以及力学云图三种形式呈现,使读者能够同时从整体与局部两个尺度理解紧密相关的病理现象。

图 7|以细胞形态进行“类 FACS 门控”可快速识别不同功能亚群,形态最优的细胞表现出最佳的收缩成熟轨迹

该图展示了研究团队如何借鉴流式细胞仪(FACS)的思路,通过细胞形态参数(面积与长宽比)对数千个 hiPSC-CM 进行“门控式分群”,从而快速识别具有不同力学表型的功能亚群。研究者利用第 20 天、M16lac、10 kPa 条件下的中位面积与中位长宽比作为分界线,将所有细胞划分为四个象限。结果显示,形态最理想、面积较大且长宽比适中的第一象限(Quadrant I)与 Fig.6 中的功能簇 2 与簇 4 高度重叠,这些细胞往往表现出更高的收缩力、更快的动力学参数及更成熟的周期性;而簇 1、3、5、7 等低功能群几乎不出现在该象限中。进一步的纵向跟踪显示,Quadrant I 内的细胞在 20 天培养周期中逐渐向一个更均一、更高效的收缩表型靠拢,而其他象限的细胞则表现出明显的异质性与较弱的成熟趋势。最后的归一化分析指出,尽管四个象限的细胞在形态上差异巨大,但就“随时间提升收缩力”这一指标而言,Quadrant I 与 Quadrant II 仍表现出最好的增长轨迹,尤其是在 M16lac、10 kPa 条件下增强最为明显。整体而言,本图说明:通过简单的形态参数就可以有效预测 hiPSC-CM 的功能状态,而形态最佳的细胞亚群往往具有最强的功能成熟潜力。

贯穿整篇结果部分,一个突出的亮点在于:无论是在基底刚度研究、药物测试、异质性分析还是突变体比较中,CONTRAX 都展现出了稳健的高通量能力。在系统运行过程中,自动定位、自动采集、自动分析使得研究者能够以几乎不间断的方式处理多个样本批次,实现了每小时上百甚至数百个细胞的分析效率。文章中多处展示了批量处理后的数据分布图和统计结果,强调系统不仅能够捕获单个细胞的细节信息,还能够在大样本规模下揭示规律性的功能趋势。例如,在药物浓度梯度实验中,从低浓度到高浓度的牵引力变化呈现出平滑的剂量反应曲线;在刚度梯度实验中,多组细胞的分布清晰呈现“刚度依赖性的功能分层”;在异质性分析中,多维空间中的细胞群体自然聚为不同功能状态的子集。

图 8|Mavacamten 在 1 小时内快速抑制心肌细胞收缩力与收缩速度,而形态变化轻微

该图展示了 Mavacamten(临床用于治疗肥厚型心肌病的肌球蛋白抑制剂)在短时间内对 hiPSC-CM 收缩功能的急性影响。药物处理后,细胞面积略有增加,而长宽比并无显著变化,说明 Mavacamten 对细胞形态影响有限。然而在力学功能层面,药物作用十分明显:细胞的总牵引力和收缩速度均显著下降,收缩持续时间却保持不变,提示药物主要削弱的是“收缩强度与动力学”,而非改变收缩节律或周期结构。雷达图进一步整合所有参数,显示形态(绿色)、应力(蓝色)与动力学指标(红色)均出现明显压低,尤其是与心肌收缩主动过程相关的指标下降最为显著。这一结果与 Mavacamten 的分子作用机制高度吻合:药物通过抑制肌球蛋白 ATP 酶活性降低横桥循环效率,从而直接导致收缩力与动力输出的快速衰减。整体而言,本图展示了 CONTRAX 在药物作用评估上的高分辨率能力:即便是短至 1 小时的急性处理,也能在单细胞尺度上清晰捕捉到功能下降的多维度变化。

更重要的是,研究团队通过大样本量的数据进一步证明:高通量牵引力测定不仅能够观察平均趋势,还能够揭示传统小样本实验难以观察到的隐藏维度。例如,在药物处理实验中,有一小部分细胞呈现与总体趋势相反的反应,即当整体牵引力升高时,这些细胞却表现出低峰值或异常波形;在基底刚度实验中,有部分细胞在高刚度下并未表现出“成熟型”波形,而是呈现出异常的延迟或分离活动;在不同细胞系比较中,突变效应也并非对所有细胞一视同仁,有的细胞受到强烈影响,有的则仅表现出轻微差异。这些现象只有在大规模数据下才能显现,说明牵引力测定作为功能性指标具有强大的分辨力和对细胞状态的敏感性。文章中通过大量散点图、密度图和波形示例展示了这些分布特征,使结果部分既具有统计广度,又具有生物学深度。

图 9|高刚度基底会放大 DMD 突变导致的心肌细胞收缩损伤,揭示机械环境与遗传缺陷的协同效应

本图对比了健康 hiPSC-CM 与携带 Duchenne Muscular Dystrophy(DMD)突变的心肌细胞在两种基底刚度(10 kPa 与 35 kPa)上的收缩表现,显示出机械环境如何加剧情形。雷达图表明,在正常的 10 kPa 环境中,DMD 细胞虽表现出一定程度的收缩力下降与动力学削弱,但整体表型仍相对接近正常细胞;然而在更硬、类似纤维化的 35 kPa 基底上,DMD 细胞呈现显著的全面性退化,包括牵引力、收缩功率、收缩速度与时序稳定性等多项指标明显降低。对数坐标下的幂律(square-law)关系进一步显示 DMD 细胞的力—速度—功率关系的斜率显著减弱,反映其动力输出体系发生根本性破坏。形态方面,虽然 DMD 细胞面积降低,但长宽比没有改变,说明其功能缺陷主要源自分子病理机制,而非形态重塑。最具说服力的是,硬基底条件显著加重了 DMD 细胞的收缩力损失与同步性破坏,而 10 kPa 环境下这种差异并不明显,提示基底硬化会放大遗传病导致的功能脆弱性。整体而言,本图揭示了一个关键生物学事实:遗传性心肌病的表型强度并非固定不变,而是会被细胞所处的力学微环境显著调制。

此外,研究者还强调了 CONTRAX 在不同实验条件下的稳健性与重复性。在文章的后半部分,他们展示了多个独立实验批次之间的数据一致性,包括峰值牵引力的再现性、收缩周期的稳定性以及应变能等高级参数的可比性。通过跨批次叠加的散点图与时间序列展示,团队证明了该系统能够消除传统手工分析中由于人为差异带来的偏差,使同一类型的实验在不同时间、不同人员操作下仍能获得高度一致的结果。这种跨实验室可重复性,是传统牵引力测定技术难以实现的,而 CONTRAX 则通过完整的自动化链条有效解决了这一瓶颈。
总体而言,文章中的核心结果展示了一个贯穿实验全过程的理念:牵引力不再只是少量细胞的精细测量,而是一个可以扩展到千细胞规模的功能性指标。通过系统化、自动化的成像与分析流程,研究者不仅能够记录单个细胞的力学行为,还能够在群体尺度上观察到细胞之间的差异、药物的剂量效应、基底力学环境的调控作用以及疾病模型的特征性收缩表现。牵引力参数从此不仅能够描述个体,还能刻画群体;不仅能体现趋势,还能展现分布;不仅能服务于基础研究,还能用于药物筛选与疾病验证。文章中的每一张图都服务于这一核心目标,即证明高通量牵引力测定可以成为现代细胞功能研究的有力工具。
三、讨论
从整体上看,这项来自斯坦福大学的工作,真正完成的是对“单细胞牵引力测定”这一技术路径的体系化重构。过去,牵引力显微术更多停留在“小样本、高手工”的精细实验层面,很难支撑成千上万个心肌细胞的系统性比较。这篇文章通过 CONTRAX 将整个流程拆解成“自动找细胞—自动采集视频—自动牵引力计算和参数提取”三大模块,并用标准化、开源化的软件加以实现,使牵引力测定从一个偏“作坊式”的技术,第一次具备了平台化、流水线化和高通量运行的可能。更重要的是,作者并不是简单秀一个工具,而是用 >4500 个单细胞的数据,完整展示了该系统在纵向成熟研究、药物作用评估和遗传病建模中的实际研究价值,用一系列具体问题证明了:高通量 TFM 不只是“能做”,而是真正“值得做”。
如果只看实验结果,这篇文章最突出的贡献,是用大样本数据把心肌细胞“形态—力学—时间”三者之间的关系讲清楚了。作者在统一的微图案环境下,仔细梳理了细胞面积、长宽比、基底刚度、培养基成分与牵引力、收缩速度、功率、应变能等参数之间的映射关系:一方面,在 10 kPa 与 35 kPa 不同刚度下,细胞的铺展状态和收缩模式出现了截然不同的“功能分层”;另一方面,在相同刚度下,乳酸型代谢培养基(M16lac)与葡萄糖型(M16glu)又分别塑造出不同的形态与成熟轨迹。更高一层,作者通过聚类分析和类似 FACS 的“形态门控”策略,把这些连续变化分解为若干功能亚群:有的细胞呈现高力输出、高速收缩的“成熟型”表型,有的则停留在低幅度、缓慢的“未成熟型”状态。传统小样本实验往往只能给出“平均值”的变化,而在这篇文章中,我们第一次能在群体层面看到:在相同分化体系下,每一个 hiPSC-CM 其实都在自己的坐标轴上演化,呈现出高度复杂但具有结构性的异质性。
在疾病模型和药物作用方面,这套体系同样展现出很强的解释力。Mavacamten 急性处理实验清晰地表明,一种临床用的肌球蛋白抑制剂,可以在 1 小时内显著削弱单细胞的牵引力和收缩速度,而对收缩周期和细胞几何形态影响有限,这种“动力学被削弱而节律结构尚在”的表型,与其靶点机制高度吻合。DMD 突变模型则从另外一个角度强调了“基因 × 力学环境”的交互:在正常 10 kPa 基底上,DMD 细胞已经可以看到功能下降,但整体尚在可接受范围;而一旦置于类似纤维化的高刚度 35 kPa 基底,收缩力、功率、同步性几乎全面崩塌,呈现出远比健康细胞更严重的“力学失代偿”。这提示我们,遗传性心肌病的表型强度并非仅由基因本身决定,而是高度依赖细胞所处的微环境,尤其是基底刚度这一“慢变量”。在精准医学语境下,这类“环境放大遗传缺陷”的证据,对于理解疾病进展、评估模型可信度乃至设计干预策略,都有重要启示意义。
从方法学的角度来看,CONTRAX 更值得关注的是它在“数据结构”上的思路,而不仅仅是“测得更快、算得更多”。通过自动化成像与分析,作者将每一个心肌细胞抽象成一个多维特征向量:包含形态学参数、瞬时和积分性力学参数、时间维度上的节律信息等。随后,聚类和门控步骤把这些高维特征转化为可解释的功能亚群,既能从统计学上描述整体分布,又能从表型上归纳出“高力型”“快收缩型”“低功能型”等不同状态。这种处理方式本质上是把传统的显微成像数据,转化为可以类比“流式细胞分类”的高维表型图谱,把单细胞力学从“图像”真正推进到“定量表型学”。这一点不仅对 hiPSC-CM 有意义,对任何需要在单细胞层面做功能分型的体系——包括其他肌肉细胞、干细胞向功能细胞分化、肿瘤细胞力学表型等——都具有很强的可迁移性。
当然,这篇工作本身也在讨论中坦诚地指出了若干局限。其一,目前的 CONTRAX 基于二维 TFM,虽然在时间分辨率和通量上有明显优势,但对三维力场及复杂三维模型的适配仍有限,无法完全捕获细胞在厚组织或 3D 基质中的全部牵引行为;其二,方法依赖于专门制备的水凝胶和微图案,长期纵向实验中水凝胶力学性质与 ECM 图案的稳定性本身也需要额外监控和标定;其三,尽管分析端已经高度自动化,但从体系搭建到参数选择,仍然需要具备一定背景的研究者参与。换句话说,CONTRAX 大幅降低了牵引力测定的门槛与成本,但还谈不上“完全黑箱化”。在未来,如果能与 3D TFM、钙成像、肌节成像、电生理记录等其他模态进一步融合,并在云计算和标准化基准模型的加持下建立跨实验室的大型数据资源,那么这套体系有望从单篇论文中的“实验方法”,升级为一个真正可复用、可扩展的“心肌细胞功能表型学基础设施”。
站在更宏观的视角来看,这篇文章的意义已经超出了“牵引力显微术本身”。它向我们展示了一种新的思路:在心血管研究和药物开发领域,单细胞功能测定不必局限于少数示范性实验,而是可以通过自动化成像、算法分析与高维统计,将数千甚至上万细胞纳入一个统一的分析框架之中。在这个框架下,机械环境、代谢状态、分化时间、药物干预和遗传背景都可以作为“维度”被系统地组合与拆解,最终构建出关于心肌细胞功能的多维地图。这种地图既可以帮助我们更好地理解心肌病的发生发展,也可以为药物筛选、毒理学评估和模型质量控制提供更客观、更可量化的标准。也正是在这一点上,CONTRAX 所代表的,不只是一个技术细节的改进,而是一种向“高通量、多参数、单细胞分辨率”时代过渡的信号。

 

正如文章所展示的,当单细胞力学被纳入高通量框架之后,它所提供的就不再是某几个“典型细胞”的演示性现象,而是一个足以支撑系统性推断的大规模数据空间。更重要的是,这种空间本身并非牵引力显微单一模态的专利,在心肌细胞的研究体系中,钙瞬变、肌节运动,甚至三维力场的重建,理论上都可以作为“功能维度”被整合进来,形成一个真正意义上的多模态单细胞功能图谱。如果能够将这些维度通过统一的成像接口、统一的采集逻辑与统一的数据结构融合,并进一步借助云端计算和跨实验室的标准化基准模型加以推进,那么未来的心肌细胞研究将不再需要在不同仪器、不同软件、不同实验条件之间来回切换,而是可以在一个连续的、多维度的框架中完成功能测定与表型分类。
而这,正是 HCells 的设计逻辑开始与 CONTRAX 的愿景发生交汇的地方。
在 CONTRAX 所展示的“单一力学模态的大规模功能测量”之外,心肌细胞研究的另一个核心需求,是如何在同一实验体系中获得更多类型的生理信息,使研究者能够从力学、钙信号和肌节运动等不同角度理解细胞的兴奋与收缩表现。HCells高通量多模态心肌细胞功能检测系统正是基于这一需求而设计,它并不是对 TFM 的简单延伸,而是一种能够在同一套设备中完成多类心肌细胞功能测量的综合成像系统。其核心价值在于:研究者无需在多台仪器间频繁切换,就可以在同一系统内完成牵引力测定、钙瞬变成像和肌节动力学测量,为心肌细胞功能评估提供更丰富、更全面的数据维度。

part1


「牵引力」


part2


「钙瞬变」


part3


「肌节运动」


从这个意义上讲,HCells 承接了 CONTRAX 所揭示的研究方向——即心肌细胞功能测量正在从单一模态走向多维度表征——但具体实现路径更加面向实验实际:以一体化设备的方式,为力学、钙信号与肌节运动提供可靠的成像条件和可重复的测量流程,使多维度功能信息的获取变得更加方便、高效和系统化。

END


彩蛋|hiPSC 心肌细胞诱导分化方法与实验条件参考指南

本文所采用的 hiPSC 心肌细胞模型以 WTC-11 hiPSCs 为主(纵向与药物实验),该细胞系为经过深度测序的商业化细胞系,可由 Coriell Institute Biobank(GM26256)获取;DMD 相关研究则使用了文中表 S6 所列的突变和对照细胞系。不同来源的 hiPSCs 统一培养在 Matrigel 涂层板上,使用 Nutristem 或 Essential 8(E8)无血清培养基,每日换液,约每 3–6 天传代一次。涂层制备方面,作者将 Corning? Matrigel? GFR 按 1:100 稀释于 Leibovitz L-15 培养基中,在 4 ℃ 条件下孵育至少 1 小时后使用。传代时使用 Accutase 或 0.5 mM EDTA 进行消化,按约 1:4–1:8 或 1:30 的比例接种到新涂层板上,并在接种时加入 ROCK 抑制剂 Y-27632 以提高细胞存活率。常规维护时,hiPSCs 一般培养至约 70–90% 融合度,再进入心肌细胞分化流程。
心肌细胞诱导分化采用经典的 Wnt 调控体系。作者在 hiPSCs 达到约 60–80% 融合度时记为分化第 0 天(d0),此时将 E8 培养基更换为含葡萄糖和 L-谷氨酰胺的 RPMI-1640 培养基,并加入不含胰岛素的 B-27 补充剂以及 6 μM GSK-3α/β 抑制剂 CHIR-99021(Chir),通过短时间的 Wnt 激活诱导中胚层分化。分化开始 48 小时后,将培养基更换为新鲜 RPMI-1640 + B-27(不含胰岛素),并用 2 μM Wnt-C59(C59,PORCN 抑制剂)替代 CHIR,以抑制 Wnt 信号,促进心肌谱系分化。第 4 天再更换为不含任何抑制剂或激动剂的 RPMI-1640 培养基,第 6 天开始改用含 L-谷氨酰胺和葡萄糖的 RPMI-1640,并加入 50×、无血清的 B-27 补充剂,此后在第 8 天再次更换为相同配方。按照作者描述,在分化后约第 10–12 天通常可以获得连续自发搏动的心肌细胞单层,此时使用 Accutase 将细胞消化后,按 1:4 或 1:6 的比例重新接种到新鲜 Matrigel 涂层的 12 孔板上,为后续纯化和功能实验做准备。
为提高心肌细胞纯度,作者采用乳酸选择法进行代谢纯化。在重新接种后的培养阶段,使用的是不含葡萄糖、但含有 L-谷氨酰胺的 RPMI-1640 培养基,加入无血清的 B-27 补充剂(50×)、4 mM 钠 D-乳酸溶液,以及一定比例的 KnockOut Serum Replacement(KSR)作为无血清替代物;细胞在该乳酸化培养基中维持数日,以利用心肌细胞偏好乳酸代谢、而非肌成纤维细胞的代谢特性,实现对非心肌细胞的选择性去除。之后,作者将这一乳酸培养条件在文中统一称为 M16lac(乳酸富集型),而含葡萄糖的 RPMI-1640 + B-27 条件称为 M16glu(葡萄糖富集型)。在纵向研究中,分化后第 12 天(d12)先经历约 4 天葡萄糖饥饿以进一步纯化心肌细胞,随后在约第 16 天(d16 ± 1)将部分孔板更换为 M16glu,部分继续维持在 M16lac,以构建不同代谢条件下的长期培养对照。分化后第 17 天(d17),hiPSC-CMs 按约 2×10^5 个细胞/cm2 的密度接种到预先制备好的 Matrigel-包被、带有 ECM 微图案的聚丙烯酰胺水凝胶上,接种时短暂加入 ROCK 抑制剂和 KSR,24 小时后更换为不含 ROCK 抑制剂和 KSR 的相应培养基,并在接种后至少恢复 48 小时后再进入牵引力、形态和功能测量。整个过程中,作者仅选择具有自发搏动的心肌细胞纳入分析,以减少分化效率波动对数据的影响。

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