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【行业应用】基于无人机高光谱图像数据的集成学习方法对烟草叶片氮含量估测

来源:江苏双利合谱科技有限公司 更新时间:2024-01-10 10:00:03 阅读量:104
导读:来自江苏大学农业工程学院赵春江博士的应用分享!

本期导读:

关注双利合谱,聚焦行业应用,探索高光谱遥感发展!

本期内容基于无人机高光谱图像数据的集成学习方法对烟草叶片氮含量估测

应用关键词高光谱遥感叶片含氮量、集成学习、烟草


background

背景

烟草生产是中国西南地区农业和农村经济发展的关键支柱。为了给烟叶质量优化提供信息支持,减轻烟农的劳动负担,对快速、准确、实时的叶片氮含量(Leaf nitrogen content, LNC)检测方法有很大需求。无人机机载高光谱遥感(Hyperspectral remote sensing, HRS)能够以非破坏性的方式获取成像光谱数据,实现烟叶LNC的快速获取。

一般来说,可以使用经验方法或物理方法建立模型,或者两者相结合,以实现目标性状的反演。为了解决单个反演方法的异质性,一些学者提出了作物表型性状估计的集成学习框架。与试图从训练数据中学习一个假设的普通机器学习方法不同,集成方法试图构建一组假设并将它们组合起来使用。集成学习的思想是结合几种不同的方法来增强输入的多样性,以挖掘更多的数据特征,从而提高模型的整体性能。

本研究旨在建立一种准确有效的模型,利用无人机机载高光谱图像估计烟草LNC。研究中测试了几种基于三种集成学习策略的典型算法,包括随机森林(RF)回归、自适应增强(Adaboost)回归和堆叠回归。此外,我们选择了Z常用的偏Z小二乘回归(PLSR)作为基准模型。主要创新点有:(1)研究了无人机机载HRS在烟草LNC估算中的潜力;(2)评估了不同集成学习策略(如bagging、boosting和stacking)下模型的性能;(3)探索基于堆叠策略提高模型预测精度的可行方法。

experimental design

试验设计

江苏大学利用Gaiasky-Mini2-VN高光谱相机(江苏双利合谱科技有限公司)获取了研究区内不同氮处理下烟草冠层的高光谱影像,其波段范围为400 ~ 1000 nm,波段数为256。各类地物的光谱曲线如图1所示。在整个田间试验过程中,每约20天采集一次冠层图像,从移栽后35天开始,一直持续到收获。

影像获取后,第一步,利用ExG去除背景,并提取平均反射率。第二步,利用连续投影算法(SPA)进行数据降维。第三步,建立LNC估计模型,研究中选择了Z常用的PLSR作为基准模型(图1)。此外,采用集成学习方法来完成上述相同的回归任务。集成学习框架下有三种建模策略,即bagging、boosting和stacking。本研究以决定系数(R2)、均方根误差(RMSE)和平均绝对百分比误差(MAPE)作为评价指标。


图1 本研究主要步骤流程图


Conclusion

结论

本研究对全波段高光谱反射率数据进行主成分分析(PCA),提取对LNC变化更敏感的主成分(PC)。如图2所示,选取前80个PC进行显示,当主成分数为4、6、7时,累积方差贡献率(AVCR)分别超过99.5%、99.8%、99.9%。我们选择SPA作为二次降维算法。与PCA不同,SPA可以通过选择对LNC变化更敏感的变量来降低数据维度,Z终保留了15个波段(图3)。

图2 前7个PC贡献了超过99.9%的信息


图3 选择的15个波段


从图4可以看出,PLSR的R2相对较低,但训练集与测试集之间的差距较小。由于PLSR结合了PCA和MLR。在这里,我们也给出了MLR的预测结果,训练集和测试集之间的差距也很小(图4c、4d)。结果表明,训练良好的MLR模型具有良好的稳定性,样本分布均匀,同时也证明了我们的数据集划分是合理的。

图4g – 4p显示了集成学习方法的结果,包括RF、Adaboost和堆叠模型。RF和Adaboost都是基于决策树回归(DTR),为了避免过拟合,我们将max_dept的值设置为5。DTR的预测结果如图4e和图4f所示。对于堆叠模型,我们采用双层结构,MLR和DTR模型(即stacking – 1)作为第一层的基估计器,MLR作为第二层的元估计器。结果表明,stacking - 3模型预测效果Z好。与DTR模型在测试集上的预测结果相比,stacking - 1模型得到了显著增强,但相较于SPA-MLR改进幅度较小。结果表明,叠加策略可以传递基估计器的优点。通过组合多个模型来挖掘更有价值的数据特征。在图4m - 4p中也可以看到类似的现象。通过将已经训练好的模型添加到堆叠框架的第一层,可以发现在Z终表现上也有逐渐的改善。当添加RF模型时(stacking – 2),测试集上的R2不仅从0.710提高到0.743,而且超过了RF本身的R2值,RMSE值也有小幅下降。当Adaboost模型被添加时(stacking – 3),与stacking – 2相比,准确度只有轻微的提高。

综上所述,stacking - 3模型的R2和RMSEZ高(0.745, 4.824 mg/g),Adaboost模型的MAPEZ小(17.56%)。原因可能是堆叠方法可以从不同的模型中提取更多可用的数据特征。由于数据噪声的存在,模型在数据特征上往往表现不同。堆叠法可以提取各模型中表现较好的特征,丢弃较差的特征,有效地优化预测结果,提高Z终的预测精度。Adaboost模型可以根据每个基估计器的预测误差调整其权重。错误率小的基估计器在Z终结果中占有较大的权重。因此,Adaboost模型得到Z小的MAPE。对于RF,基估计量相互独立,Z终结果是所有基估计量的简单平均值,因此RF模型更容易受到异常值的干扰。


图4 训练集和测试集下不同模型性能比较


进一步分析每个基估计器对Z终结果的贡献。我们首先选择已经训练好的RF和Adaboost模型作为基估计器(图5a、b)。stacking - 4的综合性能优于RF。将DTR和MLR分别加入到stacking - 4模型中,得到stacking - 5和stacking - 6模型。结果如图5c、f所示。stacking - 5和stacking - 6模型之间存在非常小的差异。同时,stacking - 4模型(R2 = 0.876)和stacking - 6模型(R2 = 0.779)在训练集上存在显著差异。

从某种意义上说,DTR、RF和Adaboost模型(基于树的模型)是同质的,因为DTR本身是RF(bagging & DTR|)和Adaboost(boosting & DTR)模型的基估计器。因此,添加DTR不能使模型挖掘更多可用的数据特征。这可能就是stacking - 5模型的性能变化不大的原因。对于线性模型(MLR),它与基于树的模型原理是不同的,可以学习到一些新特征。虽然在测试集上的表现略有下降,但在训练集上取得了进步。模型的整体稳定性得到了提高。综上所述,RF和Adaboost几乎贡献了所有的堆叠精度,然后MLR有助于提高模型的稳定性。

Z后,对如何正确配置堆叠模型提出了一些建议。理想情况下,堆叠策略的第一层中的基估计器应该是“准确和异构的”。通过这种方式,可以学习更多有价值的数据特征。此外,为了避免过拟合,第二层的元估计器通常选择一个简单的模型(线性或岭回归),该模型使用第一层的输出作为训练的输入。


图5 进一步分析堆叠策略


PRODUCT

产品推荐

GaiaSky Mini3-VN无人机载高光谱成像系统

主要特点:

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 软件功能:快速实时校准为用户在线输出反演、分类识别等结果,为行业应用快速做成决策判断。

 数据拼接:高精度POS及校正软件为大面积的数据拼接等硬软件,充分提升了系统的数据的质量和工作效率。

 负载:可根据实际应用需求选配其他产品。

作者简介:

赵春江:

博士,江苏大学农业工程学院教授,博士生导师。

主要研究方向:

农业智能系统与精准农业技术装备。


参考文献:

Zhang, M.Z., Chen, T.E., Gu, X.H., Kuai, Y., Wang, C., Chen, D., & Zhao, C.J. (2023). UAV-borne hyperspectral estimation of nitrogen content in tobacco leaves based on ensemble learning methods. Computers and Electronics in Agriculture, 211.
https://doi.org/10.1016/j.compag.2023.108008

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