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Science Advances:单分子力谱揭示金黄色葡萄球菌对角质细胞粘附的分子机制

来源:布鲁克纳米表面仪器部 更新时间:2025-12-18 15:45:25 阅读量:9
导读:Science Advances:单分子力谱揭示金黄色葡萄球菌对角质细胞粘附的分子机制



第157期
布鲁克期刊俱乐部
Bruker Journal Club

布鲁克纳米表面仪器部 岳俊培 博士



内容简介


在人类与病原体的漫长博弈中,金黄色葡萄球菌(S. aureus)始终是皮肤感染的"头号通缉犯"。随着抗生素耐药性问题的加剧,尤其是耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的流行,科学家们迫切希望破解其粘附机制。之前,英国谢菲尔德大学研究团队通过使用布鲁克原子力显微镜揭示了MRSA逃避抗生素“追杀”机制,详情可关注布鲁克纳米表面仪器公众号,第130期布鲁克期刊俱乐部。而最近奥本大学、伯明翰大学和鲁汶大学的研究团队通过原子力显微镜单细胞/单分子力谱(SCFS,SMFS)技术定量分析了工程菌株与角质细胞的相互作用力,证实了S. aureus表面蛋白SdrD是角质细胞桥粒蛋白-1(DSG-1)的关键配体以及钙离子在其中起到的调控作用,相关研究结果以“Ultrastrong Staphylococcus aureus adhesion to human skin: Calcium as a key regulator of noncovalent interactions”发表于国际知名期刊Science Advances




实验方案与细节



 单细胞力谱实验细节 


利用AB胶将直径6微米二氧化硅微球粘于无针尖的MLCT-O10悬臂A或者E上。后将固定好的探针置于含盐酸多巴胺(4mg/ml)的10mM Tris-HCl缓冲液(pH8.5)中孵育一小时,将多巴胺修饰于胶体探针上。利用多巴胺与细菌间静电力捕获单个细菌,将细菌修饰于探针上。然后利用修饰细菌的探针对角质细胞进行QI成像,ramp size 1μm,设定力500pN,速度30μm s?1。扫描范围与像素可根据感兴趣区域进行设置,每个像素点均含有力-位移曲线信息。


 单分子力谱实验细节


DSG-1修饰探针制备


NPG-10探针浸入含1mM 10% 16-巯基十二烷酸/90% 1-巯基十一醇的乙醇溶液中过夜,用乙醇冲洗后,用N2干燥。随后将探针浸入含N-羟基琥珀酰亚胺(NHS;10mg/ml)和1-乙基-3-(3-二甲基氨基丙基)碳二亚胺(25mg/ml)的溶液中浸泡30分钟,用超纯水冲洗。最后,将它们与重组人DSG-1(0.1mg/ml)一起孵育1小时,用PBS缓冲液进一步冲洗,即获得DSG-1修饰探针。然后立即使用,无需脱湿。


p?PROX多肽修饰探针制备


用3-氨基丙基三乙氧基硅烷气相法反应对MLCT-BIO-DC悬臂梁进行氨基功能化修饰。氨基功能化后的悬臂梁浸入含1 mg NHS-PEG27-马来酰亚胺和30μl三乙胺的0.5 ml氯仿反应溶液中2小时。浸泡后,将悬臂梁用氯仿冲洗,并在氩气流下干燥。取100μl浓度为100μg/ml的p?PROX溶液,依次加入2μl EDTA(100mM,pH7.5)、5μl Hepes(1 M,pH7.5)、2μl三羟甲基氨基甲烷磷酸盐(TCEP)盐酸盐(100mM),最后加入2μl Hepes(1M,pH9.6)。将制备的混合液滴加至悬臂梁上,经2小时孵育后,用PBS彻底洗涤悬臂梁三次,即获得p?PROX多肽修饰探针。


将100倍稀释的过夜细菌悬液(50μl)置于聚苯乙烯培养皿中,静置15分钟后用PBS洗涤,随后向培养皿中注入PBS。单分子力谱设置为ramp size 1μm,设定力500pN,速度1 μm s?1


初始数据分析采用JPKSPM data processing软件完成,通过蠕虫状链模型(Worm-like chain WLC)对展开峰和粘附峰进行了拟合分析。



实验结果与讨论



S. aureus通过细胞壁锚定表面蛋白附着于角质细胞。角质细胞通过角质桥连接,主要由desmoglein-1(桥粒蛋白-1,DSG-1)、corneodesmosin(角质桥蛋白,CDSN)和desmocollin-1(桥粒粘蛋白-1)构成,而DSG-1具有钙依赖性胞外区,其基因突变与皮炎、多重过敏及代谢性消耗症相关,凸显其在维持皮肤完整性及参与疾病发生中的关键作用。S. aureus表面蛋白serine-aspartate repeat protein D(SdrD)被鉴定为DSG-1的潜在配体,其结构如图1所示。SdrD的B重复序列形成刚性棒状结构,被认为具有缓冲功能,可将A结构域推离细胞表面,其正确折叠与结构完整性依赖Ca2+离子。 为验证SdrD是否促进细菌黏附于角质细胞,作者采用表面表达SdrD的乳酸乳杆菌(SdrD(+))及缺乏该蛋白的对照菌株(SdrD(?))修饰的悬臂梁,对在含角质细胞的表面进行单细胞力谱(SCFS)测试,结果见图1。SdrD(+)探针比SdrD(?)更大呈现更大的粘附力,表明相互作用由SdrD介导,而强相互作用集中在角质细胞边缘处,其表面覆盖着DSG-1蛋白。作者对多组数据进一步分析,结果见图2,SdrD(+)粘附力分布呈尖峰状,峰值位于2336±263pN,对应单个SdrD-配体复合物的断开, 而有些离散的粘附力峰4135±340pN,可能源于两条键的并行断开。


为确认DSG-1是SdrD的结合靶标,作者采用DSG-1修饰的探针进行单分子力谱(SMFS)实验。SMFS实验揭示在SdrD(+)乳酸乳杆菌上表现出强粘附力(2076±248pN),与上述SCFS结果相当,而在SdrD(?)上未显示任何相互作用,这些结果证实DSG-1是SdrD的靶标。进一步对断开长度进行分析,在胶质细胞上断开长度在272±62nm,而单分子断开平均达431±104nm。该差异可归因于DSG-1的跨膜特性:SMFS检测的是全长蛋白(1049个氨基酸),而SCFS仅关注其EC区域(548个氨基酸)。断开长度分布表明pPROX可能是结合靶点。为了确认DSG-1的pPROX或pDIST区域是否为特异性结合位点,作者进行了大规模计算实验和p*PROX的肽段修饰的探针进行单分子力谱实验,与全长DSG-1构建体结果一致,p?PROX与SdrD的结合表现出nN级的机械稳定性,其粘附力1808±196pN,断开长度约为460±122nm,与全蛋白实验中观察到的长度非常接近。这些结果确认pPROX在DSG-1中包含正确的结合位点,并且与SdrD的单次相互作用具有高韧性,在纳牛级负荷下保持稳定。且91% SdrD(+)与角质细胞单细胞力谱呈锯齿状模式,在最终断开之前有多个(主要是2、3或4个)等间距的力峰(2213±267pN),平均峰间距为43±7nm,与完全展开的SdrD(+)B结构域预期长度相符,见图3。SdrD(+):DSG-1以及 p?PROX: DSG-1单分子力谱也呈现同样的情况。


研究人员进一步研究了钙离子的影响,结果见图4。在去除钙(添加螯合剂1mM EDTA)时,力曲线展开基本被抑制(展开概率从91%降至5%)。添加10mM Ca2+后,锯齿形图案得以恢复,且高浓度Ca2+产生了更稳定的图案,显示出每个B域中Ca2+结合位点的作用。与此同时,Ca2+显著增强了A结构域的结合特性,断开力从2076±248pN增加到2601±163pN。这表明,Ca2+不仅调控SdrD B结构域的稳定性,还增强了A结构域的配体结合强度。


最后,与正常细胞相比,AD胶质细胞表面出现数百纳米的"圆形纳米物体",对应于角质桥粒,且粘附行为不止发生在边缘,而是遍布整个细胞,印证了AD皮肤中DSG-1弥散分布的理论假设。单分子力谱(SMFS)实验也证实了SdrD是介导AD菌株与DSG-1结合的黏附蛋白。

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图1,SdrD(+)及SdrD(?)探针在含角质细胞的表面进行力谱成像与量测。


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图2,单细胞力谱与单分子力谱数据分析。


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图3,单分子力谱揭示蛋白质二级结构。


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图4,钙离子对SdrD结构与粘附影响。



总结


综上所述,本研究确认DSG-1是SdrD的关键配体,阐释了金黄色葡萄球菌附着于人类皮肤的分子机制。钙离子可稳定SdrD复合体又可增强其机械强度,增强了其与DSG-1的结合。这些发现不仅拓展了我们对细菌黏附机制的认知,更为针对金黄色葡萄球菌感染及湿疹等皮肤疾病的靶向治疗开辟了新途径。本研究揭示了迄今已知最强的蛋白质-蛋白质相互作用机制,标志着细菌致病学与力学生物学领域的重要突破。




 原文链接:

Ultrastrong Staphylococcus aureus adhesion to human skin: Calcium as a key regulator of noncovalent interactions.Sci. Adv.11,eadu7457(2025).

https://www.science.org/doi/10.1126/sciadv.adu7457


 Bruker NanoWizard V介绍:

https://www.bruker.com/en/products-and-solutions/microscopes/bioafm/jpk-nanowizard-v-bioscience.html


5.png


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