GeneCE-100生物片段分析系统对cfDNA样本的质控

使用高灵敏度DNA片段分析试剂盒（NH1）对cfDNA样品进行自动电泳分离后，在约170 bp处可观察到一个主峰，其后跟随若干较小的宽峰。该主峰代表与组蛋白相结合的单核小体DNA片段（图1）。

图1 位于约170bp处的主峰

图2 单核小体、双核小体以及高分子量(HMW)DNA

在传统的NGS工作流程中，HMW DNA的存在往往会对文库的产量以及测序的质量造成不利影响。GeneCE-100生物片段分析系统检测的质量评估指标——%cfDNA可用于量化在预设的50至700碱基对（bp）范围内，cfDNA亚组分占样品总DNA的百分比。通过%cfDNA这一指标，用户能够评估样品的质量，并据此判断样品中是否含有足够量的cfDNA，以满足后续分析流程的需求。

图3. 具有不同质量水平的cfDNA样品的电泳图谱对比

样品A（绿色，73%cfDNA）：

该样品中大于700 bp的HMW物质含量较低，反映了其较高的样品质量。

样品C（紫色，35%cfDNA）：

该样品中HMW物质含量极高，因此其质量评估值最低。

综上所述，cfDNA作为极具潜力的疾病诊断与科研生物标志物，其测序分析的核心前提是获得高质量的合格样本，而传统检测方法在cfDNA精准质控上的局限性，已成为制约下游NGS实验可靠性的关键瓶颈。奥盛GeneCE-100生物片段分析系统搭配高灵敏度(DNA)片段分析试剂盒(NH1)，为这一难题提供了高效且精准的解决方案。