质粒在整个生命科学如基因工程、基因治疗、疫苗开发等领域具有广泛的应用,质粒类型也非常的多,比如克隆质粒、表达质粒、报告基因质粒、穿梭质粒、病毒载体质粒、基因编辑质粒、探针质粒等等。
在质粒应用过程中,通常会涉及到对质粒进行测序以确认质粒的碱基排布和质粒图谱是否符合预期。
质粒测序的方法主要分为三大类:
传统的一代测序(Sanger测序)
高通量的二代
三代测序
选择哪种方法,主要取决于质粒结构复杂程度、对通量的需求以及预算。
随着三代测序准确性的飞速提升、成本的大幅下滑,三代全长质粒测序越来越多的人关注和认可。尤其是针对含有大量高GC区域、重复序列或者发夹结构的序列,三代全长质粒测序能够提供优于一代测序和二代测序的结果。
翌圣生物上线针对三代全长质粒测序的完整解决方案,能够有效地对质粒进行无偏移的片段化和建库测序,同时支持大量的质粒混样测序。
翌圣全长质粒建库试剂盒
实验方案:使用翌圣全长质粒建库试剂盒13305ES和马达蛋白接头连接模块13304加上针对ONT平台的barcode(13317ES/13318ES)对不同类型的质粒进行全长建库后,使用ONT测序仪进行测序。
▼表:不同质粒ONT平台全长测序结果展示
▲图:不同质粒全长测序后片段长度结果展示
▲图:不同质粒全长测序序列展示
实验方案:使用翌圣全长质粒建库试剂盒13305ES和马达蛋白接头连接模块13304进行全长质粒建库后,在ONT和序风(cyclone)平台进行测序。
▲图:相同质粒在ONT和序风(cyclone)平台测序结果比较
▼表:AAV质粒全长测序的竞品对比展示
翌圣生物
翌圣生物科技(上海)股份有限公司成立于2014年,是一家聚焦生命科学产业链上游核心原料,从事核苷酸、蛋白、细胞和类器官四大品类生物试剂的研发、生产与销售的高新技术企业。公司兼备核心技术自主研发和规模化生产能力,核心产品数量达数千种,覆盖分子克隆、qPCR、NGS、体外转录、抗体、蛋白纯化及分析、细胞培养、转染、报告基因检测和类器官等多种系列,广泛应用于生命科学研究、诊断检测和生物医药等领域。
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