上新 | 磁珠法土壤/粪便DNA提取试剂盒，助力宏基因组学研究

2023-12-12 00:00:00 22阅读次数

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宏基因组学是直接研究环境样品中的遗传学材料，主体研究对象是微生物群落的基因组，即所有微生物个体基因组的总和。对于微生物组学的研究，最常见的就是通过高通量测序技术对16SrDNA/18S rDNA/ITS等序列进行测序，从而获得样品中的微生物群落组成以及相对丰度，进而揭示环境样品中的物种组成，物种多样性特征，预测基因功能信息等。

图1.宏基因组学概貌（Berg et al. Microbiome (2020) 8:103）

环境样本，比如土壤、粪便、水体等样本中含有丰富的微生物，但这些样本成分复杂；

翌圣生物经过匠心打造，自主研发出高性能的磁珠法土壤/粪便DNA提取试剂盒，助力宏基因组学的研究！

产品介绍

MolPure^® Mag Soil/Stool DNA Kit磁珠法土壤/粪便DNA提取试剂盒（Cat#18526ES）适用于土壤、粪便、水样、水体滤膜、细菌、真菌等环境样本基因组DNA的提取。采用独特的磁珠和精心优化的缓冲体系，可最大限度的分离纯化样本中的微生物基因组DNA。提取的核酸纯度高，质量稳定可靠，适用于各种下游应用实验，如酶切、PCR、建库等。配合磁珠法自动化提取仪器使用，可实现核酸的高通量提取。

产品特点

操作便捷：室温操作，仅需1h内即可回收DNA；
产量高：独特的研磨珠能高效裂解土壤微生物，释放更多DNA，最大限度地提高其产量；
适用范围广：适合土壤、粪便、水体、滤膜、拭子等环境样本；
纯度高：有效去除环境样本中腐殖酸、重金属离子等杂质，适用于各种下游应用实验，如酶切法建库。

操作流程

图2.土壤/粪便DNA提取操作流程图

产品性能

DNA的浓度和纯度

土壤、粪便、水体样本，分别用18526ES和竞品M进行DNA提取，其中18526ES搭配翌圣48通道自动化核酸提取仪使用，洗脱体积均为70μL，结果显示：18526ES相对竞品展现出更优异的DNA浓度和纯度。

图3.土壤/粪便/水样DNA的浓度和纯度

16S qPCR扩增

土壤、粪便、水体样本，分别用18526ES和竞品M进行DNA提取，各取相同体积的DNA溶液进行细菌16S qPCR扩增实验，结果显示，18526ES提取产物Ct值均小于竞品M。

图4 .土壤/粪便/水样DNA16S qPCR扩增结果

NGS文库构建分析

土壤样本和粪便样本，分别用18526ES和竞品M进行DNA提取，各取100ng DNA用翌圣一步法DNA建库试剂盒V2（Cat#12195ES）进行宏基因组建库，结果显示，18526ES提取的DNA文库产量和QC指标与竞品M相当，微生物种类数量优于竞品M。

图5.土壤/粪便DNA文库数据质量

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产品名称	产品货号	产品规格
MolPure® Mag Soil/Stool DNA Kit磁珠法土壤/粪便DNA提取试剂盒	18526ES20	20T
	18526ES50	50T
	18526ES70	200T
MolPure® Mag48 SoilStool DNA Kit FA 磁珠法48孔土壤/粪便DNA提取试剂盒FA（预封装）	18528ES48	48T

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