Nature Genetics| 精准捕获肿瘤异质性：Tissue Cytometry技术在 经内分泌前列腺癌临床样本分析中的核心应用

经雄激素受体（AR）通路阻滞剂的广泛干预后，晚期前列腺癌（PCa）常出现干预耐受。在这些去势抵抗性前列腺癌（CRPC）中，约 20% 会发生转分化，至少部分呈现神经内分泌（NE）相关的组织学和分子特征，因此被称为神经内分泌前列腺癌（NEPC）。其临床预后极差，且目前除铂类化疗外缺乏有效干预手段，亟需明确其转化机制并开发靶向方案。

2025 年 7 月，美国埃默里大学医学院泌尿外科 Jindan Yu 团队在Nature Genetics发表题为 “NKX2-1 drives neuroendocrine transdifferentiation of prostate cancer via epigenetic and 3D chromatin remodeling” 的文章。本研究揭示了一个由 NKX2-1 调控的转录因子层级网络，该网络在调控染色质重塑和驱动管腔型前列腺癌向神经内分泌型转化中发挥关键作用，并为缓解 NEPC 提供了具有潜力的干预方向。

本研究发现，NEPC 与 CRPC 肿瘤具有显著不同的三维染色质结构，这种结构差异可通过经历神经内分泌转化（NET）的同源细胞系重现。机制上，FOXA2 等先锋因子会率先结合神经内分泌增强子，介导区域 DNA 去甲基化并诱导神经转录因子（TF）NKX2-1 的表达。NKX2-1 优先结合基因启动子，并通过染色质环化与结合在增强子上的 FOXA2 相互作用。NKX2-1 在 NEPC 中高表达，且对前列腺癌的神经内分泌转化至关重要。NKX2-1/FOXA2 复合物会进一步招募 p300/CBP 以激活神经内分泌增强子，而对 p300/CBP 的药物阻滞能有效遏制神经内分泌基因表达并阻断 NEPC 肿瘤生长。

实验部分：

Tissue Cytometry技术主要用于免疫组化（IHC）和苏木精-伊红（H&E）染色图像的获取与定量分析：

1. 图像采集：利用TissueFAXS系统，对临床样本（组织芯片TMA、异种移植肿瘤组织）的IHC和H&E染色切片进行图像捕获，确保图像质量稳定且可追溯。

2. 定量分析：针对染色结果（NKX2-1、FOXA2、SYP等蛋白的表达），利用软件对染色强度（阴性、弱阳性、中度阳性、强阳性）和阳性细胞比例进行评分，生成客观的定量数据，为不同肿瘤亚型的标志物表达差异比较提供依据。

3. 结果验证：在验证NKX2-1和FOXA2在神经内分泌前列腺癌（NEPC）中的特异性表达、评估p300/CBP

阻滞剂对肿瘤标志物的遏制效果等关键实验中，该技术的定量分析结果成为结论的重要支撑。

Figure 5 通过 TissueGnostics 的 TissueFax Plus 获取临床 CRPC 组织芯片（TMA）中 NKX2-1 和 FOXA2 蛋白的免疫组化（IHC）图像，量化不同亚型（AR⁺/NE⁻、AR⁻/NE⁻、AR⁺/NE⁺、AR⁻/NE⁺）肿瘤的染色强度，验证二者在 AR⁻/NE⁺（NEPC）肿瘤中的特异性高表达。

Extend Figure 2 捕获 FOXA2 过表达的 LNCaP 异种移植肿瘤中 FOXA2 和突触素（SYP）的 IHC 图像，分析 FOXA2⁺/SYP⁺、FOXA2⁺/SYP⁻细胞比例，验证肿瘤向神经内分泌表型的转化。

Extend Figure 10 分别获取 LuNE 异种移植肿瘤、LuCaP145.2 PDX 肿瘤中 H3K27ac、SOX2、NKX2-1、Ki-67 及 AR、PSA 的 IHC 图像，评估 p300/CBP 阻滞剂（CCS1477）对肿瘤标志物表达的遏制效果。