WGBS还在用超声打断？这款酶破解甲基化DNA片段化难题

DNA甲基化参与调控的生物学过程

在全基因组甲基化测序等高精度表观遗传学研究中，DNA片段化是影响数据可靠性的核心环节。然而，传统技术路径存在一些痛点，制约了甲基化分析的准确性与应用场景拓展。

解决方案：翌圣生物重磅推出Hieff UltraShear甲基化片段化酶，专为甲基化设计的酶切体系

采用200 ng 293gDNA样本，分别用12218和竞品进行酶切，酶切时间为10 min 、15 min、 25min 、35 min、 45 min ，将酶切体系进行琼脂糖凝胶电泳，结果如图1，展示了不同打断时间获得的平均片段大小。

图1.不同打断时间获得的平均片段大小

以293T gDNA、小鼠 gDNA及水稻gDNA为样本，比较了三种DNA片段化方法（常规酶切、超声打断、12218甲基化片段化酶切）对样本甲基化水平的影响。所有样本均采用甲基化双链建库试剂盒（Cat#12214）进行文库构建，并经超快速甲基化转化试剂盒（Cat#12229）处理后，通过Illumina NovaSeq平台进行测序分析，如图2所示：常规酶切试剂会干扰甲基化分析，不适用于甲基化研究，12218甲基化位点占比和超声几乎一致。

图2.常规酶切、超声打断、12218甲基化片段化酶切对样本甲基化水平的影响

以293T gDNA、小鼠 gDNA及水稻gDNA为样本，比较了两种DNA片段化方法（超声打断、12218甲基化片段化酶切）对样本的损伤程度。所有样本均采用超快速甲基化转化试剂盒（Cat#12229）处理后，并经甲基化单链建库试剂盒（Cat#12221）进行文库构建，通过Illumina NovaSeq平台进行测序分析，如图3所示：超声打断相对12218酶切打断，文库产量会偏低，超声打断的样本损失更大，尤其对于低投入量样本。

图3.超声打断、12218甲基化特异性片段化酶切对文库产量的影响

翌圣生物凭借在甲基化检测原料领域多年深耕的技术积淀，已构建覆盖全流程的甲基化检测整体解决方案：从高效稳定的样本DNA提取试剂，到超快速且转化率优异的甲基化转化试剂盒，再到精准兼容甲基化位点的片段化酶与建库试剂，全方位赋能表观遗传学研究。