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揭秘罗氏定向进化新型DNA聚合酶—KAPA2G

来源:罗氏诊断产品(上海)有限公司      分类:工作原理 2025-01-23 10:44:39 18阅读次数
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作者:曲爽博士

Science Value 团队


现代分子诊断应用对实验的要求越来越高,传统的DNA聚合酶已经不能满足当下分子诊断的临床应用需求,Roche旗下KAPA系列定向进化筛选的DNA聚合酶具有更加适合现代分子诊断应用的优良特性。其中,KAPA2G是利用定向进化技术筛选得到的新型快速热启动DNA聚合酶,具有超快速、超多重PCR扩增、无序列偏好性、广谱耐抑制等特点。能够显著提升检测速度、检测灵敏度和特异性,并且可以灵活应对临床复杂样本,极大简化了下游分子诊断的开发和生产流程。


01

超快速

相比于野生型Taq聚合酶,KAPA2G DNA聚合酶具有更快的合成速度,可达1kb/s。如图1A所示,KAPA2G DNA聚合酶提供比野生型Taq DNA聚合酶更快的延伸速率,最多可节约近75%的时间。除了扩增速度快之外,KAPA2G DNA聚合酶在快速多重PCR应用中比其它酶有更高的产量和灵敏度(图1B)。

图1: KAPA2G DNA聚合酶与野生型热启动Taq酶(A)和其它酶(B)性能对比*



02

超多重

KAPA2G DNA聚合酶除了具有快速扩增速度外,KAPA2G还具有超多重的扩增能力。图 2展示了KAPA2G Fast Multiplex预混液在8-plex PCR和12-plex PCR中对于多个模板能够进行有效的扩增。tNGS通常需要同时高效扩增几十至上百重靶标,KAPA2G DNA聚合酶因其优秀的超多重扩增能力已在多项研究中有所应用。

图2: KAPA2G DNA聚合酶与其他酶在多重PCR(8-plex & 12-plex)中性能对比*



03

无序列性偏好

多重PCR不仅需要能够同时扩增多重靶标,并且要求对于不同靶标序列的扩增不能有明显的偏好性。KAPA2G DNA聚合酶对高GC或高AT序列的靶标均具有优秀性能,同时对体系中超多重靶标扩增具有很好的均一性。如图3所示,对于富含GC或者AT的靶标,KAPA2G DNA聚合酶均可高效扩增,GC含量27%到GC含量84%的72种靶标均能100%检出,而传统的热启动Taq酶只能检出66%。

图3: KAPA2G DNA聚合酶与普通热启动Taq酶扩增不同GC含量模板性能对比*

扩增子按照GC含量递增顺序加载,最低GC含量(27%,蓝色)位于左上角,最高GC含量(84%,红色)位于右下角。


04

耐抑制

在进行PCR扩增的过程中常常会遇到模板质量参差不齐的情况,比如不同类型样本中可能含有各种PCR抑制物。KAPA2G DNA聚合酶本身对于一些常见的PCR抑制剂具有一定的耐受性,对于复杂困难的样本会有更好的表现。如图4所示,使用KAPA2G和野生型Taq聚合酶,在四种常见PCR抑制剂存在的条件下进行PCR扩增,KAPA2G DNA聚合酶具有更好的扩增能力。

图4: KAPA2G和野生型Taq 聚合酶在四种常见PCR抑制剂(氯化钠/尿素/SDS/乙醇)存在的条件下从1pg质粒DNA扩增1.5kb片段的结果对比*


KAPA2G DNA聚合酶是抗体介导的热启动聚合酶,具有更好的扩增性能和更快的合成速度,能够大大缩短PCR的时间。KAPA2G DNA聚合酶在多重扩增方面也表现优秀。另外,KAPA2G DNA聚合酶还具有强大的耐抑制能力,面对粗制样本、GC异常样本均具有优秀的扩增能力。经过多年的市场验证,KAPA2G DNA聚合酶在病原靶向测序tNGS、遗传病多重扩增检测、快速PCR以及法医学检测等领域均有广泛的应用。


KAPA2G系列产品适合的应用

  • 病原靶向测序tNGS

  • 遗传病多重扩增检测

  • 快速PCR

  • 法医学检测

产品名称

货号

KAPA2G Fast HotStart PCR Kit

08041202001

KAPA2G Fast HS (12500U)

07983239001

KAPA2G Robust HotStart ReadyMix

08041113001

KAPA2G Fast HS Multiplex Mix,50 ml  

09077898001

KAPA2G Buffer A

09084690103

KAPA2G Buffer B

09084703103

注:

所有数据来源于罗氏诊断整理;

相关测试的数据表现均为内部特定实验条件下的结果,仅供参考。


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仅供科学研究,不用于临床诊断,MC-CN-04657



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最近更新:2024-09-05 09:08:13
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