仪器网(yiqi.com)欢迎您!

| 注册2 登录
网站首页-资讯-专题- 微头条-话题-产品- 品牌库-搜索-供应商- 展会-招标-采购- 社区-知识-技术-资料库-方案-产品库- 视频

技术中心

当前位置:仪器网>技术中心> > 正文

5 min快速甲基化转化试剂盒,无忧玩转表观建库!

来源:翌圣生物科技(上海)股份有限公司 更新时间:2024-12-25 14:39:41 阅读量:72

 

表观遗传

1942 年,Conrad Waddington 创造出了“表观遗传学”一词,用以定义基因型未发生改变而表型改变的现象,以解释发育的各个方面。大约 3/4 个世纪以后,我们发现基因表达模式传递的表观遗传机制并不依赖于 DNA 序列的改变,而是通过改变染色质的状态,而染色质状态同时是我们遗传信息的生理学形式。表观遗传的调控机制包括多种方式,图1主要介绍其中的3种:DNA甲基化、组蛋白修饰(图1中显示乙酰化和甲基化修饰)和非编码RNA介导的调控。

 

 

表观遗传与人类疾病

DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA等表观遗传因素,与肿瘤发生、免疫缺陷病、神经系统疾病、心血管疾病和精神疾病等多种疾病相关。DNA甲基化就像一顶“神奇的帽子”,在不改变DNA分子一级结构的情况下调节基因组的功能,在调控基因表达、维持染色质结构、基因印记、X染色体失活以及胚胎发育等生物学过程中发挥着重大的作用。

肿瘤

 

正常的DNA甲基化模式如果被破坏(如基因启动子区域的甲基化程度过高或过低)都会导致细胞的癌变。

免疫缺陷疾病

 

ICF综合征,是由DNA甲基转移酶3b(DNMT3b)基因突变而引起的。患者1号、9号和16号染色体异常,在其着丝粒附近具有大量重复的典型卫星DNA序列,这些重复序列表现为低甲基化。

精神类疾病

 

瑞特综合征是由于X染色体上编码MeCP2转录因子的基因突变导致的。MeCP2突变导致该基因调节DNA甲基化的过程异常,从而致病。

 

甲基化研究分类

根据甲基化作用的对象不同,可以将甲基化分为:DNA甲基化、RNA甲基化以及蛋白质甲基化。

 

 

DNA甲基化

 
 

DNA甲基化可以发生在胞嘧啶的C-5位、腺嘌呤的N-6位、鸟嘌呤的N-7位等,它们分别由不同的DNA甲基化酶催化,生成5-甲基胞嘧啶(5-mC)、N6-甲基腺嘌呤(N6-mA)及7-甲基鸟嘌呤(7-mG)。目前对于DNA甲基化的研究主要关注点在5mC以及6mA,甲基化研究技术也分为WGBS(研究5mC)、RRBS(研究5mC)、MeDIP(研究5mC)、6mA(研究6mA)等。其中,WGBS和RRBS能定位到单碱基分布的甲基化研究,MeDIP以及6mA主要基于特异性的甲基化修饰位点结合抗体来识别DNA甲基化区域,具有实验简单、成本较低等优点。

 

表.不同DNA甲基化技术对比

 

 

RNA甲基化

 

已知RNA存在超过100种修饰。在真核生物中,5’端的Cap以及3’的ployA修饰在转录调控中起到了十分重要的作用,而mRNA的内部修饰则用于维持mRNA的稳定性。RNA最常见的内部修饰包括N6-腺苷酸甲基化(m6A)、N1-腺苷酸甲基化(m1A)、胞嘧啶羟基化(m5C)等。目前RNA甲基化的研究主要在m6A和m5C上,对应的RNA甲基化研究技术为MeRIP(m5C)、m6A(m6A)等。这两种技术都是基于特异性识别核酸修饰的抗体进行靶向富集,两种技术都是非单碱基研究。

 

目前已经有很多技术来解决RNA甲基化单碱基分布的问题,2024年1月2日,芝加哥大学何川教授团队在Nature Biotechnology上在线发表了题为Ultrafast bisulfite sequencing detection of 5‑methylcytosine in DNA and RNA的研究论文,该研究提出并开发了对DNA和RNA上的5-甲基胞嘧啶修饰进行快速,准确检测的测序方法,简称为UBS-seq。该技术提出的5 min快速转化试剂盒,能够减少传统化学转化方法对RNA的损伤。

 

翌圣生物的Hieff® Superfast DNA Methylation Bisulfite Kit便是基于此技术开发优化而成,可以在98°C 5min条件下可完成>99.5%的胞嘧啶转化,并且极大的降低了DNA损伤,更好的保证了DNA片段的完整性。

 

图. Superfast DNA Methylation Bisulfite的技术原理及优势

 

Hieff® Superfast DNA Methylation Bisulfite Kit(12225ES)将DNA变性与亚硫酸氢盐转化融合为一步,5分钟内即可完成转化,约30 min可完成BS转化全流程。采用柱内脱硫技术,使操作流程更为简单;可以满足100 pg-2 μg样品的转化;未甲基化胞嘧啶转化为尿嘧啶的转化率≥99%;转化后的产物适用于PCR扩增和DNA测序等下游应用。

 

图4.Superfast BS转化实验流程

 

客户案例

客户A:使用12225与竞品Z转化试剂盒进行头对头对比,转化样本为15 ng 甲基化puc19+非甲基化λ DNA混合物,转化后的样本采用甲基化单链DNA建库,如图5所示:12225文库产量和对比率优于竞品Z,转化效率和竞品Z相当。

 

 

 

 

蛋白质甲基化

 

蛋白质甲基化是真核生物中普遍存在且关键的翻译后修饰 (PTM),主要发生在赖氨酸残基和精氨酸残基上。常见的组蛋白甲基化修饰有H3K4me3、H3K9me3、H3K27me3以及H3K36me3等,不同的组蛋白修饰起不同的作用。组蛋白H3K4 (H3K4me1 和 H3K4me3)上的单甲基化和三甲基化都是活化标志物,但是也有着特殊 的细微差别:H3K4me1 通常会标记转录增强子,而 H3K4me3 则标记基因启动子。同时,K36 (H3K36me3) 的三甲基化是与基因转录区域相关的活化标志物。H3K27me3启动子区域的一个临时信号、H3K9me3是在具有串联重复结构的基因贫乏染色体区域形成异染色质的永久信号,如卫星重复序列、端粒和近着丝粒区。其中,H3K27me3位于基因间和沉默的编码区,H3K9me3主要位于活性基因的编码区。对于蛋白质甲基化有组蛋白甲基化研究CUT&Tag、ChIP-seq、CUT&RUN或者蛋白质修饰组的质谱研究。

 

表.CUT&Tag、ChIP-seq及CUT&RUN技术对比

CUT&Tag

ChIP-seq

CUT&RUN

胞内反应

*胞内反应

胞内反应

收集细胞,无需特殊处理

甲醛交联

收集细胞,无需特殊处理

ConA磁珠与细胞孵育

细胞破碎裂解,超声打断gDNA

ConA磁珠与细胞孵育

一抗二抗结合目的蛋白

一抗结合目的蛋白

一抗二抗结合目的蛋白

转座酶复合体结合二抗,激活反应

免疫沉淀

MNase酶复合体结合二抗,激活反应

磁珠回收DNA片段

洗脱,解交联,获得DNA片段

纯化获得DNA片段

一步法PCR扩增文库

多步反应:修复加A,加接头,PCR扩增

多步反应:修复加A,加接头,PCR扩增

产物纯化,上机测序

产物纯化,上机测序

产物纯化,上机测序

总时长:7.5 hour

总时长:3-5 Day

总时长:1-2 Day

 

 

欲知DNA甲基化、RNA甲基化以及蛋白质甲基化如何进行关联研究,请关注翌圣生物下回分晓。

 

 

相关产品推荐

 

产品名称

产品货号

产品应用

Recombinant Ten-Eleven Translocase 2.0(TET2.0, with buffer)

12212ES

酶转

DNA  Enzymatic methyl- Conversion Kit

12213ES

酶转

Hieff NGS® Methyl-seq DNA library Prep kit for Illumina® V2
单链甲基化DNA建库试剂盒V2

12221ES

单链甲基化文库构建

Hieff NGS® dsDNA Methyl Library Prep Kit for Illumina®
双链DNA甲基化建库试剂盒

12214ES

双链甲基化文库构建

Hieff® Superfast DNA Methylation Bisulfite Kit 
5min超快速甲基化转化试剂盒

12225ES

5 min超快速化学转化,DNA和RNA适用

Hieff NGS® In-Situ DNA Binding Profiling Library Prep Kit for Illumina® V2
CUT&Tag试剂盒

12597ES

含二抗及全套纯化磁珠的CUT&Tag试剂盒

 

参与评论

全部评论(0条)

相关产品推荐(★较多用户关注☆)
你可能还想看
  • 技术
  • 资讯
  • 百科
  • 应用
  • 大肠杆菌转化实验
    粘附在细菌细胞表面的质粒DNA在42摄氏度下经过短时间的热击处理,为DNA的吸收起到促进作用,之后于非选择培养基中培养一代,等到质粒上所带的抗菌素基因表达,就能够生长在还有抗菌素的培养基中了。
    2025-10-221870阅读
  • 荧光定量pcr试剂盒产品特性
    其通过实时监测PCR反应过程中的荧光信号变化,实现对核酸的定量检测。这项技术广泛应用于基因表达分析、病原检测、基因突变检测等领域。本文将详细介绍荧光定量PCR试剂盒的核心产品特性,帮助用户更好地了解其优势与应用前景。
    2025-10-22255阅读 荧光定量PCR
  • 科建剥离强度试验机安装
    本文将深入探讨科建剥离强度试验机的安装流程,介绍安装步骤、注意事项及常见问题的解决方案,旨在帮助用户有效提升设备的使用效率,确保实验结果的可靠性。
    2025-10-23117阅读 剥离强度试验机
  • 液相色谱质谱联用仪建方法
    其应用领域涵盖了生命科学、环境监测、食品安全、药物研发等多个领域。在液相色谱质谱联用仪的构建过程中,如何合理选择仪器组件、优化工作参数并确保系统的稳定性与精确度,是每位分析化学工作者必须深入研究的课题。本文将详细介绍液相色谱质谱联用仪的建方法,包括其关键技术、仪器选择、流程设计等方面。
    2025-10-1277阅读 液相色谱质谱联用仪
  • 快速蛋白液相色谱的特点,快速蛋白质液相色谱
    随着生物技术的进步,FPLC技术也在不断革新,未来其在高通量分离、高效纯化和智能控制等方面将迎来进一步发展。例如,结合人工智能的FPLC系统可以实现自动化的条件优化与实时数据分析。
    2025-10-22132阅读 蛋白液相色谱
  • 查看更多
版权与免责声明

①本文由仪器网入驻的作者或注册的会员撰写并发布,观点仅代表作者本人,不代表仪器网立场。若内容侵犯到您的合法权益,请及时告诉,我们立即通知作者,并马上删除。

②凡本网注明"来源:仪器网"的所有作品,版权均属于仪器网,转载时须经本网同意,并请注明仪器网(www.yiqi.com)。

③本网转载并注明来源的作品,目的在于传递更多信息,并不代表本网赞同其观点或证实其内容的真实性,不承担此类作品侵权行为的直接责任及连带责任。其他媒体、网站或个人从本网转载时,必须保留本网注明的作品来源,并自负版权等法律责任。

④若本站内容侵犯到您的合法权益,请及时告诉,我们马上修改或删除。邮箱:hezou_yiqi

关于作者

翌圣生物科技(上海)股份有限公司是一家聚焦生命科学产业链上游核心原料,从事分子、蛋白和细胞三大品类生物试剂的研发、生产与销售的高新技术企业。核心产品覆盖qPCR系列、NGS系列、逆转录系列、核酸提取与纯化系列、PCR系列、分子克隆系列、体外转录系列、抗体、蛋白纯化系列、蛋白分析系列、重组蛋白、细胞分析系列、细胞培养系列、细胞转染系列、报告基因检测系列等多个品类,广泛应用于生命科学研究、诊断检测和生物医药等领域。

更多>>ta的最新文章
干货 | 人肾脏类器官构建知多少?一文读懂!
上车了!专为核酸定量准备的96通道酶标仪,平价好用!
DRUG-seq,药筛最佳搭档,少量细胞转录组建库,无需核酸纯化
关注 私信
近期话题
相关产品

在线留言

上传文档或图片,大小不超过10M
换一张?
取消