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纯干货!显色示踪荧光定量相对定量操作解析

来源:翌圣生物科技(上海)股份有限公司 更新时间:2025-02-20 15:45:12 阅读量:226
导读:纯干货!显色示踪荧光定量相对定量操作解析


实验材料:













































1.cDNA样本:通过上游反转录反应得到的cDNA。
2.荧光定量试剂:Hieff UNICON ColorGPS qPCR SYBR Green Master Mix (No/Low/High Rox)。
3.其他试剂:RNase-free H2O、相关基因上下游引物(储存浓度10 μM)。
4.设备与耗材:移液器、qPCR仪、冰盒、离心机、RNase-free八连排、RNase-free离心管。



实验步骤:













































01

试剂&样本前期准备


试剂解冻和混匀



  • 从冰箱中取出:

    从-20℃冰箱中取出含酶试剂,立即放入冰盒中(冰上操作);

    避免将试剂直接放在室温下解冻,以免温度波动影响酶的活性。

  • 缓慢解冻:

    让试剂在冰上自然解冻,通常需要5-10分钟;

    如果需要快速解冻,可以将试剂握在手中轻轻摇晃,但不要过度加热。

  • 轻轻颠倒混匀:

    解冻后,将试剂管轻轻上下颠倒几次,使试剂充分混匀;

    避免剧烈震荡或涡旋混匀,以免破坏酶的活性。

  • 低速离心:

    将试剂管短暂离心(5-10秒,1000 rpm左右),使管壁和管盖上的液体集中到管底;

    离心后再次轻轻混匀,确保试剂均匀分布;

    混匀后的试剂应继续放在冰上,避免长时间暴露在室温下。

Tips:混匀时尽量避免产生气泡,气泡可能会影响酶的活性或实验结果的准确性。


02

模板稀释(若需要)


稀释步骤


  • 若需追踪模板,按以下步骤稀释:

    取1 μL 10×Dilution Buffer + 9 μL无菌超纯水 → 配制1×Dilution Buffer;

    用1×Dilution Buffer稀释cDNA至目标浓度(建议稀释至Ct值20-30的范围内)。

  • 若无需追踪模板,直接用无菌超纯水稀释cDNA或者直接使用cDNA原液。


03

荧光定量PCR反应体系配制

常见的荧光定量仪器为96孔反应,大体分为12列×8行。举例说明:

image.png

备注说明:

  • 相对定量分析基因表达情况时,为排除样本和操作的影响,对数据进行归一化,需要有内参基因,例如GAPDH、β-actin等等。

  • 技术重复通常建议设置3孔,为保证后续取平均值或剔除异常值。当然根据自己的需求进行调整,设置2孔重复或者4孔重复均可。

  • 依据MIQE准则,NTC(阴性对照)建议设置,一方面用于污染风险判断,另一方面其也是一套实时荧光定量 PCR (qPCR) 实验设计及数据报告实践指南以及与发文共享实验信息的标准。



荧光定量PCR体系(大体系配制减少误差)



大体系配制

微信截图_20250220095635.png


以上述投入2μL cDNA模板检测不同样本基因1为例:

微信截图_20250220095717.png

将上述溶液依次加好后,将管盖盖严,用手轻弹管壁,使各组分充分混匀,再放入小型离心机,短暂离心1-2s,再次轻弹管壁(防止有气泡),瞬间离心(防止部分溶液沾到管壁上)并置于冰/冰板上。

备注:如使用显踪剂建议模板投入体积控制在2-5 μL,以保证显踪效果,如使用cDNA母液建议投入体积控制在2 μL(反应体系的1/10)以内防止影响扩增效果。



上样体系配置
  • 按照上机仪器选取对应耗材(八联排或96孔板)。

  • 在对应耗材中按照布板依次分装18μL/孔步骤1)配置的大体系Mix。

  • 在每个孔中加入2 μL对应模板。

微信截图_20250220100006.png

移液枪加样Tips(吸一排二):


  • 吸取液体:缓慢、平稳地按下按钮至第一档(不是按到底),然后将吸头浸入液面下,然后缓慢、平稳地松开档位至原位来吸取液体。注意不要让吸头接触到容器的边缘或底部,以防止污染。

  • 液体排出:将吸头对准接收容器,然后缓慢、平稳地按下按钮至第二档(按到底)以排出液体。确保所有的液体都被排出。

image.png

完成加样后,将管盖盖严,用手轻弹管壁,使各组分充分混匀,再放入小型离心机,短暂离心1-2s,再次轻弹管壁(防止有气泡),瞬间离心(防止部分溶液沾到管壁上)确保无气泡后置于洁净的96孔PCR管架。

备注:注意观察每一枪是否吸到了气泡,若出现气泡吸取则会导致实验数据出现较大偏差。


04

荧光定量PCR上机运行

上机前,仔细检查管子,确保正上方管盖、管身没有记号笔染料,管内无气泡、管壁无液体。


若采用常规程序,则进行以下设置:

微信截图_20250220100425.png

备注:
不同荧光定量qPCR试剂核心的酶和Buffer组成都存在差异,对应说明书上的程序是该产品大多数情况下的最适反应条件,建议按照说明书的程序进行仪器设置,减少因用其他程序带来的数据偏差;
熔解曲线程序可选用仪器默认程序。


image.png

备注:以ABI Q5常规程序为例,在进行程序设置时,确保在退火/延伸阶段和熔解曲线的升温阶段打开数据信号收集开关。


若采用快速程序,需确认仪器本身是否可以快速升降温,运行快速程序。以下以ABI Q5为例:

微信截图_20250220101341.png


05

结果判定

  • 观察熔解曲线峰是否单一。

  • 初步判断复孔间Ct值差距是否<0.5,或者进一步计算复孔间CT值STD是否<0.2。

  • 内参基因Ct值尽量在14-25之内,不要过小也不要过大。


06

数据分析

下机得到的Excel数据处理如下:

image.png

图示说明:

④:对照组校正后的数值;

③/④:每个小组校正后的数值比上对照组校正后的数值;

意图表上的数据在excel中采用了保留2位小数的形式,实际计算时不可忽略小数点后的所有数字,减少按数字的动作,活用Excel。


07

注意事项

1、引物设计好坏对于最终实验的成功和实验结果都会有一定的影响,可参考干货软文,解锁更多引物设计宝藏。

微信-往期回顾23.jpg微信-往期回顾24.jpg

2、长时间放置的引物,建议尝试先用预实验(跟着其他实验或人带上几孔测测看),避免直接进行大规模正式实验,从而造成不必要的风险损失。



产品特别推荐:













































方法

分类

产品名称

货号

RNA提取

同Trizol提取

TRIeasy? Total RNA Extraction Reagent

10606ES

免氯仿升级版

TRIeasy? Total RNA Extraction Reagent(Tcm Free)

19202ES

动物组织/细胞总RNA提取,避开有毒试剂,最快15 min完成

MolPure Cell/Tissue Total RNA Kit细胞/组织总RNA提取试剂盒

19221ES

反转录

5 min高效高产反转

预混液(含gDNA去除)

Hifair AdvanceFast 1st Strand cDNA Synthesis SuperMix for qPCR (DNA digester plus)

11155ES

5 min一步gDNA去除&反转录预混液(下游应用qPCR)

Hifair AdvanceFast One-step RT-gDNA Digestion SuperMix for qPCR

11151ES

5 min快速反转,最长可满足14 kb cDNA合成,含gDNA去除(下游应用PCR/qPCR)

Hifair AdvanceFast 1st Strand cDNA Synthesis Kit

11149/11150ES

高质量第一链cDNA合成预混液,含gDNA去除(下游应用qPCR)

Hifair III 1st Strand cDNA Synthesis SuperMix for qPCR (gDNA digester plus)

11141ES

qPCR染料法

高灵敏显色示踪荧光定量预混液(染料法)

Hieff UNICON ColorGPS qPCR SYBR Green Master Mix (No Rox)

11188ES

Hieff UNICON ColorGPS qPCR SYBR Green Master Mix (Low Rox)

11189ES

Hieff UNICON ColorGPS qPCR SYBR Green Master Mix (High Rox)

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高特异高荧光值定量预混液(染料法)

Hieff UNICON Advanced qPCR SYBR Master Mix

11185ES

高灵敏通用型定量预混液(染料法)

Hieff UNICON Universal Blue qPCR SYBR Master Mix

11184ES



翌圣生物


翌圣生物科技(上海)股份有限公司是一家聚焦生命科学产业链上游核心原料,从事分子、蛋白和细胞三大品类生物试剂的研发、生产与销售的高新技术企业。核心产品覆盖qPCR系列、NGS系列、逆转录系列、核酸提取与纯化系列、PCR系列、分子克隆系列、体外转录系列、抗体、蛋白纯化系列、蛋白分析系列、重组蛋白、细胞分析系列、细胞培养系列、细胞转染系列、报告基因检测系列等多个品类,广泛应用于生命科学研究、诊断检测和生物医药等领域。

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