下一代测序(NGS)技术的进步将基因组学研究推向了新的高度。随着Element Biosciences公司的AVITI、Ultima Genomics公司的UG 100?等新型测序平台的推出,以及行业标准的Illumina NovaSeq?测序仪的持续应用,单个样本的测序成本大幅降低,这一进展促使全自动移液工作站的建库通量达到了更高的水平。
然而,随着测序成本的不断降低,文库制备的成本和复杂性却日益增加,成为高通量基因组学工作流程中的新瓶颈。为了保持竞争力和高效性,样本制备工作流程需优先考虑自动化、微缩化和灵活性。
文库制备面临的日益严峻的挑战
在DNA或RNA样本能够进行测序之前,必须先通过一系列液体处理步骤将其转化为适合测序的文库。如果手动执行这一工作流程,将需要耗费大量的时间、人力和资源。因此,全自动建库工作站在保持成本效益和出库质量的同时,面临着更高通量更高效率的建库挑战。生物医药CRO公司提供具有竞争力的测序服务定价,这使得核心测序设施必须最大限度地提高效率,以吸引和留住客户。
自动化液体处理解决方案(如公司的firefly?和mosquito?液体工作站)正在革新NGS文库制备方法。这些工作站不仅提高了通量和可重复性,还实现了建库反应的体系微缩化,使实验室能够节省试剂使用并减少耗材成本。
自动化与微缩化的优势
NGS工作流程中自动化的主要优势之一是精确性。手动移液容易产生误差,这可能导致文库质量和测序结果的不一致。自动化液体处理工作站提高了准确性,减少了人为错误,并确保了多个样本之间文库制备的一致性。
除了精确性之外,mosquito液体处理仪还实现了文库制备的微缩化,使用户能够显著缩小反应体积。通过减少每个反应所需的昂贵试剂的体积,核心测序部门可以在保持高质量测序输出的同时减少预算。此外,微缩化还有助于通过减少枪头耗材的使用来减少环境污染,这在当今的研究中是一个日益重要的考量因素。
案例研究:引领潮流的核心测序设施
几家领先的基因组学核心测序部门已经利用我们的自动化液体处理技术增强了其NGS工作流程。
在佛罗里达大学,研究人员使用mosquito仪器实施了微型化的mRNA-seq文库构建,这显著提高了他们的效率并降低了试剂成本。这种方法帮助他们完成了昼夜生物钟紊乱对基因表达的研究,可以在不损害测序数据质量的情况下简化高通量测序流程。
另一个案例研究展示了Illumina测序DNA文库制备的微缩化,其中我们的mosquito液体处理工作站帮助缩小了反应体积,同时没有牺牲出库测序的准确性,最终实现了显著的成本节约。
在不断发展的行业中保持竞争力
随着测序技术的进步和成本效益的提高,核心测序设施的角色正在发生变化。为了满足对高通量测序服务日益增长的需求,这些设施必须采用灵活且可扩展的自动化解决方案。我们的firefly和mosquito仪器提供了所需的适应性,能够与从学术研究人员到制药公司的广泛客户合作,确保核心测序设施能够满足多样化的应用需求,同时保持效率。
通过整合自动化液体处理解决方案,核心测序设施可以消除手动瓶颈、降低成本并提高数据一致性。微缩化进一步增强了这些优势,使其成为现代基因组学实验室优化工作流程并保持领先地位的关键策略。
展望未来
基因组学的未来在于高通量、成本效益高且精确的测序工作流程。自动化和微缩化是释放NGS全部潜力的关键。通过投资自动化,测序实验室可以确保自己始终处于创新的前沿——以前所未有的速度、更低的成本和更高的可持续性提供高质量的结果。
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