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功能菌筛选技术方案(三)丨微生物多维表型检测与可视化精准分选平台的基因转移可视化研究

来源:长春长光辰英生物科学仪器有限公司      分类:应用方案 2024-03-01 15:30:07 46阅读次数
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现有基因转移研究方法通常依赖生物信息学方法对不同物种的基因组序列进行比对来分析,存在灵敏度、特异性不足的问题。

结合分子克隆及单细胞LIFT分选技术,实现基因转移的可视化追踪

其方法为构建携带待测基因的质粒,将其转化入供体菌中,将供体菌与待测样品共孵育。随后,基于质粒上的荧光信号或待测基因的拉曼光谱特征等,在单细胞层面上从群体中识别出携带目标基因(质粒)的微生物个体,应用LIFT技术将此类单细胞分离出来,进行全基因组扩增及16s rRNA测序,实现对目标基因在物种间转移情况及机制的研究。



技术流程





应用案例




耐药基因水平转移研究

利用反向D2O-单细胞拉曼检测技术(Raman-rD2O),能够可靠且快速地从表型上追踪耐药从环境到临床的扩散。该方法具有很高的灵敏度,能够在大量受体菌中识别出少量的抗性转化子,可用于破解影响抗性质粒转移以及持续的因素,并通过与基因型研究的联系,更好地理解环境质体(environmental plastidome)传播风险。
【文章链接:《Analytical Chemistry》 | HOOKE单细胞分选仪助力耐药基因水平基因转移研究 (qq.com)




核心设备




PRECISCS-R300拉曼单细胞分选仪

【产品介绍:PRECI SCS-R300 拉曼单细胞分选仪 (qq.com)



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最近更新:2024-09-05 09:08:45
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