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微生物是指个体小到难以用肉眼观察的所有微小生物的统称(有些微生物是肉眼可见的)。细菌、病毒、真菌和少数藻类等都属于微生物。病毒是由蛋白质与核酸等少数几种成分构成的“非细胞生物”,然而它必须依赖活细胞生存。依据不同的生存环境,微生物被分为空间微生物、海洋微生物等,依据细胞的结构,微生物被分为原核微生物和真核微生物。在ZG大陆和ZG台湾的教科书里,微生物被分为细菌、病毒、真菌、放线菌、立克次氏体、支原体、衣原体、螺旋体八类。微生物种类众多,既有有益的微生物又有有害的微生物。其在工农业、医药、食品以及环保等很多领域得到广泛地应用。
传统的微生物鉴定主要参考《伯杰式细菌鉴定手册》和《真菌鉴定手册》,鉴定过程繁琐,耗时长,容易出错,对经验要求非常高。商品化的自动微生物系统有效地解决了以上问题,目前自动微生物鉴定系统从原理上包括以下几种:
基于蛋白的鉴定方法:
以蛋白质飞行质谱平台为基础对不同高度保守的微生物核糖体蛋白电解离后的电子飞行时间进行分析鉴定。典型代表为布鲁克和梅里。
基于基因型的鉴定方法:
例如基因条带图谱法以及基因测序法,典型代表为Life和杜邦。
基于表型的鉴定方法:
如美国Biolog公司的Microstation和Omnilog自动微生物鉴定系统,以对95种碳源或化学敏感物质的利用为基本原理,能够鉴定2650种以上的霉菌、酵母和细菌。除此以外还有基于脂肪酸鉴定的方法,通过气相色谱对微生物细胞壁的脂肪酸构成进行分析。梅里埃、BD、热电和西门子在临床领域都有各自的自动微生物鉴定系统,它们的数据库的主要鉴定对像是致病菌,数据库一般有200-600种,能够做药敏测试。
三类方法各有优缺点,理论上不冲突,可以互为补充,应该根据实际需要进行选择。
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