CRISPR是一种RNA诱导的获得性免疫系统,发现于细菌和古生菌中,用来抵抗外来病毒或是质粒的入侵。该系统由成簇间隔的短回文重复序列(Clustered regularly interspaced short palindromic repeat sequences)和Cas基因(CRISPR-associated genes)组成。CRISPR/Cas系统分为两类:第1类包含I、III和IV型,使用多种Cas蛋白的复合体;第2类包含II、V和VI型,只使用一个具有多个结构域的Cas蛋白。第2类CRISPR/Cas系统具有简单、易使用性,更适合基因工程应用。
CRISPR/Cas 系统首先产生与靶标序列对应的RNA序列,与病毒或质粒的 DNA 进行互补作用,然后引导Cas 内切酶对互补的序列进行双链切割。其中Cas 基因家族中的Cas9广泛地应用于该系统中,它是一种天然存在的内切酶,具有两个酶切活性结构域 :HNH核酸酶结构域和 Ruv-C like 结构域,分别切割互补链和非互补链。切割过程需要另外两个RNA的帮助,分别为CRISPR RNA(crRNA)和反式 CRISPR RNA(trans -acting CRISPR RNA,tracrRNA),人们已经将这两种RNA改造融合成一个向导RNA(single-guide RNA,sgRNA),单个sgRNA 足以帮助Cas9实现定点切割的效果。

CRISPR/Cas9系统的结构成分(Sun J et al. Brief Funct Genomics. 2020)
经过人工改造的 CRISPR/Cas9系统一般分为两种,一种主要由Cas9、tracrRNA 和 crRNA三部分构成 ;另一种主要由Cas9 和 sgRNA 两部分构成。载体的构建过程简便快捷,仅需人工合成一段和靶标序列相同的序列,连接至载体特定位点即可,具有高通量高效率的特点。
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