样本处理:
很多问题其实在实验开始前就已经埋下。
在 IHC 实验中,样本制备往往被低估。组织的固定方式会直接影响蛋白结构、抗原表位暴露以及抗体进入组织的能力。
肿瘤研究中最常见的样本形式有两种:冷冻切片和石蜡包埋(FFPE)样本。冷冻切片的优势是抗原保存较好,信号通常比较强,但组织结构容易受损;而 FFPE 样本则可以很好地保持组织形态,因此在病理和大量研究样本中被广泛使用,不过它也会带来蛋白交联的问题。
如果在 IHC 中遇到染色非常弱甚至完全没有信号,有时并不是抗体的问题,而可能只是样本处理出现了一些细节偏差,例如切片存放时间过长、组织在玻片上干燥,或者脱蜡步骤不彻底。这些细节都会影响实验结果。
抗原修复:很多“无信号”其实卡在这一步。
对于 FFPE 样本来说,抗原修复几乎是不可避免的一步。福尔马林固定会在蛋白之间形成交联结构,从而掩盖抗原表位,使抗体难以结合。抗原修复的目的,就是重新暴露这些被隐藏的表位,使抗体能够顺利识别靶蛋白。
加热是比较普遍的抗原修复方法,例如微波加热、高压锅或者加热缓冲液。不同的蛋白对修复条件并不相同,因此缓冲液的 pH、加热时间以及温度都可能影响最终结果。如果抗原修复条件不合适,就很容易出现染色弱或者染色不均匀的情况。
背景过高?往往是封闭没做好
IHC 的一个经典问题是整张切片都是背景。这通常是因为组织中存在内源性酶或非特异性结合。组织中天然存在的过氧化物酶或碱性磷酸酶,如果在染色前没有被抑制,就会参与显色反应,从而产生大量背景信号。
因此,在抗体孵育之前进行适当的封闭处理非常重要。常见的方法包括使用H?O? 抑制过氧化物酶、正常血清封闭,或者使用亲和素/生物素封闭体系。这一步虽然看似简单,但往往能显著改善染色质量。
很多 IHC 实验,其实输在抗体
在整个 IHC 流程中,抗体无疑是最关键的试剂。对于 IHC 来说,除了价格和是否有人用过外,一个靠谱抗体至少需要满足几个条件。
首先看是否验证过 IHC
很多抗体只验证过 WB 或 IF,但并不适合 IHC。因为 IHC 涉及固定、抗原修复和组织环境。只有经过 IHC 验证的抗体,成功率才会更高。
第二看应用验证数据
一个可靠抗体通常会提供实验数据帮助研究人员判断抗体是否适合自己的实验体系。
其次看抗体特异性验证
文献引用固然重要,但更关键的是抗体是否做过严格验证。高质量抗体通常会通过多种方法验证,例如:基因敲除(KO),RNA干扰(KD),免疫沉淀/质谱,正交验证等,这些方法可以确保抗体真正识别目标蛋白。
最后,这几年越来越多实验室开始使用重组抗体。原因其实很简单:稳定。传统杂交瘤抗体有一个问题:不同批次之间可能存在差异。而重组抗体通过已知序列表达,通常具有更好的批次一致性、更稳定的实验结果甚至更高的特异性。
显色与成像:最后一步也可能影响整张图
当抗体成功结合靶蛋白之后,接下来就是显色步骤。IHC 中最经典的显色体系是 HRP 与 DAB 组合。对于表达量较低的蛋白,还可以使用增强型 DAB 显色体系。
在完成染色后,显微镜成像同样需要注意一些细节,例如物镜是否清洁、封片剂是否与显色体系兼容、滤光片是否正确设置等。这些因素看似微小,但都会影响最终图像质量。
肿瘤研究中常见的 IHC 靶点
在癌症研究中,一些蛋白由于具有明确的生物学功能,经常被用于 IHC 检测。例如 Pan Cytokeratin 常用于识别上皮来源肿瘤,而 c-Kit、c-Raf 和 S6 等蛋白则更多用于研究肿瘤信号通路的变化。这些靶点在组织水平的表达模式,往往能够帮助研究人员更直观地理解肿瘤的发展过程。近期赛默飞对肿瘤研究常用靶点进行了价格优化,包括信号通路、肿瘤微环境、肿瘤免疫及代谢相关蛋白。
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