单细胞实验上机前,需要对样本进行前处理。单细胞悬液制备结果好,那整个单细胞实验也算是成功一大半了。
在细胞解离过程中,细胞结团的问题时常发生。细胞结团时,若团块较大,会影响单细胞捕获率或者双胞率。这些细胞团块的产生是因为样本制备过程中产生的环境压力加速了样本内细胞的死亡,从而导致一些凋亡细胞释放出了DNA将周围细胞粘合在一起。这些释放出来的DNA分子需要使用DNase I消化。本实验操作以小鼠肺组织悬液制备操作来示例如何使用DNase I处理以减少单细胞悬液中的细胞团块。
Tips:在单细胞悬液制备过程中,DNase I 常常配合胶原酶或者透明质酸酶等联合使用,一般不会单独使用。
1、FACS缓冲液:在500 mL PBS中加入2%的胎牛血清FBS(v/v)和22 mM EDTA。
2、消化液:在RPMI培养基中制备2 mL由200 U/mL胶原酶IV和0.5 U/mL 脱氧核糖核酸酶I(DNase I)组成的消化液。
注:不同的样本,需要的胶原酶类型不一样。
3、小鼠样本肺部组织分离。
4、将肺组织加入含有300 μL消化液的2 mL 离心管中,用剪刀将肺组织在离心管中剪成小块。
5、加入700 μL的消化液后,摇床上800 rpm 37℃孵育30 min。
6、将离心管取出后置于冰上孵育2 min。
7、加入40 μL 500 mM的EDTA溶液,冰上孵育2 min。
8、将70 μm的细胞过滤器置于50 mL离心管上,用FACS缓冲液润湿细胞过滤器。
9、将肺组织细胞悬液加入细胞过滤器上进行过滤。
10、加入9 mL FACS缓冲液到细胞过滤器上冲洗剩余的细胞。
11、扔掉细胞过滤器,将含有细胞悬液的50 mL离心管盖上管盖后,380 g离心7 min。
12、将细胞悬液用2 mL FACS缓冲液重悬细胞。
13、样本显微计数。
翌圣生物
翌圣生物科技(上海)股份有限公司成立于2014年,是一家聚焦生命科学产业链上游核心原料,从事核苷酸、蛋白、细胞和类器官四大品类生物试剂的研发、生产与销售的高新技术企业。公司兼备核心技术自主研发和规模化生产能力,核心产品数量达数千种,覆盖分子克隆、qPCR、NGS、体外转录、抗体、蛋白纯化及分析、细胞培养、转染、报告基因检测和类器官等多种系列,广泛应用于生命科学研究、诊断检测和生物医药等领域。
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